RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474513.6

ATXN7-205, Transcript of ataxin 7, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN7, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7-205ENST00000474513 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.67■■■■■ 7.78
ATXN7-205ENST00000474513 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.91■■■■■ 6.7
ATXN7-205ENST00000474513 ABCC9O60706 1549 aa56.02■■■■■ 6.56
ATXN7-205ENST00000474513 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.77■■■■■ 6.2
ATXN7-205ENST00000474513 NACADO15069 1562 aa53.59■■■■■ 6.17
ATXN7-205ENST00000474513 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.25■■■■■ 6.11
ATXN7-205ENST00000474513 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.14■■■■■ 6.1
ATXN7-205ENST00000474513 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.94■■■■■ 6.07
ATXN7-205ENST00000474513 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.71■■■■■ 6.03
ATXN7-205ENST00000474513 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.54■■■■■ 6
ATXN7-205ENST00000474513 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.2■■■■■ 5.95
ATXN7-205ENST00000474513 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.12■■■■■ 5.93
ATXN7-205ENST00000474513 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.8■■■■■ 5.88
ATXN7-205ENST00000474513 SCRIBQ14160 1630 aa51.78■■■■■ 5.88
ATXN7-205ENST00000474513 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.64■■■■■ 5.86
ATXN7-205ENST00000474513 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.81■■■■■ 5.72
ATXN7-205ENST00000474513 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.71■■■■■ 5.71
ATXN7-205ENST00000474513 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.43■■■■■ 5.66
ATXN7-205ENST00000474513 SMARCA4P51532 1647 aa49.52■■■■■ 5.52
ATXN7-205ENST00000474513 NCAPD3P42695 1498 aa49.42■■■■■ 5.5
ATXN7-205ENST00000474513 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.41■■■■■ 5.5
ATXN7-205ENST00000474513 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.35■■■■■ 5.49
ATXN7-205ENST00000474513 SMARCA2P51531 1590 aa49.32■■■■■ 5.49
ATXN7-205ENST00000474513 HMGXB3Q12766 1538 aa49.18■■■■■ 5.46
ATXN7-205ENST00000474513 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.08■■■■■ 5.45
ATXN7-205ENST00000474513 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.02■■■■■ 5.44
ATXN7-205ENST00000474513 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.93■■■■■ 5.42
ATXN7-205ENST00000474513 WIZO95785 1651 aa48.48■■■■■ 5.35
ATXN7-205ENST00000474513 ERCC6Q03468 1493 aa48.37■■■■■ 5.33
ATXN7-205ENST00000474513 NESP48681 1621 aa48.32■■■■■ 5.33
ATXN7-205ENST00000474513 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.27■■■■■ 5.32
ATXN7-205ENST00000474513 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.24■■■■■ 5.31
ATXN7-205ENST00000474513 CUX2O14529 1486 aa48.1■■■■■ 5.29
ATXN7-205ENST00000474513 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.98■■■■■ 5.27
ATXN7-205ENST00000474513 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.93■■■■■ 5.26
ATXN7-205ENST00000474513 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.9■■■■■ 5.26
ATXN7-205ENST00000474513 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.81■■■■■ 5.24
ATXN7-205ENST00000474513 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.79■■■■■ 5.24
ATXN7-205ENST00000474513 CFTRP13569 1480 aa47.56■■■■■ 5.2
ATXN7-205ENST00000474513 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.44■■■■■ 5.18
ATXN7-205ENST00000474513 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.4■■■■■ 5.18
ATXN7-205ENST00000474513 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.39■■■■■ 5.18
ATXN7-205ENST00000474513 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.36■■■■■ 5.17
ATXN7-205ENST00000474513 WDR62O43379 1518 aa47.32■■■■■ 5.17
ATXN7-205ENST00000474513 PRDM2Q13029 1718 aa47.25■■■■■ 5.15
ATXN7-205ENST00000474513 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.12■■■■■ 5.13
ATXN7-205ENST00000474513 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.94■■■■■ 5.1
ATXN7-205ENST00000474513 ABCC8Q09428 1581 aa46.6■■■■■ 5.05
ATXN7-205ENST00000474513 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.58■■■■■ 5.05
ATXN7-205ENST00000474513 TOPBP1Q92547 1522 aa46.58■■■■■ 5.05
ATXN7-205ENST00000474513 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.52■■■■■ 5.04
ATXN7-205ENST00000474513 IFT140Q96RY7 1462 aa46.44■■■■■ 5.02
ATXN7-205ENST00000474513 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.21■■■■■ 4.99
ATXN7-205ENST00000474513 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.15■■■■■ 4.98
ATXN7-205ENST00000474513 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.13■■■■■ 4.97
ATXN7-205ENST00000474513 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.07■■■■■ 4.97
ATXN7-205ENST00000474513 CUX1P39880 1505 aa46.03■■■■■ 4.96
ATXN7-205ENST00000474513 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.96■■■■■ 4.95
ATXN7-205ENST00000474513 OSCARQ8IYS5 282 aa45.93■■■■■ 4.94
ATXN7-205ENST00000474513 SOGA1O94964 1423 aa45.93■■■■■ 4.94
ATXN7-205ENST00000474513 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.91■■■■■ 4.94
ATXN7-205ENST00000474513 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.87■■■■■ 4.939e-6■□□□□ 10.2
ATXN7-205ENST00000474513 WDR97A6NE52 1622 aa45.82■■■■■ 4.93
ATXN7-205ENST00000474513 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.7■■■■■ 4.91
ATXN7-205ENST00000474513 CHD1O14646 1710 aa45.58■■■■■ 4.89
ATXN7-205ENST00000474513 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.56■■■■■ 4.88
ATXN7-205ENST00000474513 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.55■■■■■ 4.88
ATXN7-205ENST00000474513 TOP2BQ02880 1626 aa45.55■■■■■ 4.88
ATXN7-205ENST00000474513 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.52■■■■■ 4.88
ATXN7-205ENST00000474513 GRIN2BQ13224 1484 aa45.49■■■■■ 4.87
ATXN7-205ENST00000474513 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.49■■■■■ 4.87
ATXN7-205ENST00000474513 SYNJ1O43426 1573 aa45.47■■■■■ 4.87
ATXN7-205ENST00000474513 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
ATXN7-205ENST00000474513 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.41■■■■■ 4.86
ATXN7-205ENST00000474513 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.4■■■■■ 4.86
ATXN7-205ENST00000474513 PBRM1Q86U86 1689 aa45.4■■■■■ 4.86
ATXN7-205ENST00000474513 FBLN2P98095 1184 aa45.38■■■■■ 4.86
ATXN7-205ENST00000474513 TRIM41Q8WV44 630 aa45.3■■■■■ 4.84
ATXN7-205ENST00000474513 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.3■■■■■ 4.84
ATXN7-205ENST00000474513 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.3■■■■■ 4.84
ATXN7-205ENST00000474513 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.3■■■■■ 4.84
ATXN7-205ENST00000474513 SYNJ2O15056 1496 aa45.26■■■■■ 4.84
ATXN7-205ENST00000474513 ARHGEF11O15085 1522 aa45.23■■■■■ 4.83
ATXN7-205ENST00000474513 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.22■■■■■ 4.83
ATXN7-205ENST00000474513 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.09■■■■■ 4.81
ATXN7-205ENST00000474513 ADAMTS12P58397 1594 aa45■■■■■ 4.79
ATXN7-205ENST00000474513 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.98■■■■■ 4.79
ATXN7-205ENST00000474513 GRIN2AQ12879 1464 aa44.91■■■■■ 4.78
ATXN7-205ENST00000474513 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.88■■■■■ 4.78
ATXN7-205ENST00000474513 ARAP1Q96P48 1450 aa44.82■■■■■ 4.77
ATXN7-205ENST00000474513 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.75■■■■■ 4.75
ATXN7-205ENST00000474513 NUP160Q12769 1436 aa44.73■■■■■ 4.75
ATXN7-205ENST00000474513 CEP170Q5SW79 1584 aa44.69■■■■■ 4.75
ATXN7-205ENST00000474513 KIF27Q86VH2 1401 aa44.65■■■■■ 4.74
ATXN7-205ENST00000474513 CUL7Q14999 1698 aa44.5■■■■■ 4.71
ATXN7-205ENST00000474513 IGF1RP08069 1367 aa44.48■■■■■ 4.71
ATXN7-205ENST00000474513 SHROOM2Q13796 1616 aa44.48■■■■■ 4.71
ATXN7-205ENST00000474513 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.35■■■■■ 4.69
ATXN7-205ENST00000474513 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.35■■■■■ 4.69
ATXN7-205ENST00000474513 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.23■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.6 ms