RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474206.1

SAG-211, Transcript of S-antigen visual arrestin, humanhuman

TSL 5

Gene SAG, Length 485 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAG-211ENST00000474206 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.03■■■□□ 2.88
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SAG-211ENST00000474206 ABCC9O60706 1549 aa29.06■■■□□ 2.24
SAG-211ENST00000474206 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.99■■■□□ 2.07
SAG-211ENST00000474206 NACADO15069 1562 aa27.9■■■□□ 2.06
SAG-211ENST00000474206 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.69■■■□□ 2.02
SAG-211ENST00000474206 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.5■■□□□ 1.99
SAG-211ENST00000474206 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SAG-211ENST00000474206 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.43■■□□□ 1.98
SAG-211ENST00000474206 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.28■■□□□ 1.96
SAG-211ENST00000474206 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.05■■□□□ 1.92
SAG-211ENST00000474206 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
SAG-211ENST00000474206 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.98■■□□□ 1.91
SAG-211ENST00000474206 SCRIBQ14160 1630 aa26.86■■□□□ 1.89
SAG-211ENST00000474206 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.79■■□□□ 1.88
SAG-211ENST00000474206 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SAG-211ENST00000474206 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.35■■□□□ 1.81
SAG-211ENST00000474206 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.21■■□□□ 1.79
SAG-211ENST00000474206 SMARCA4P51532 1647 aa25.72■■□□□ 1.71
SAG-211ENST00000474206 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SAG-211ENST00000474206 NCAPD3P42695 1498 aa25.68■■□□□ 1.7
SAG-211ENST00000474206 SMARCA2P51531 1590 aa25.66■■□□□ 1.7
SAG-211ENST00000474206 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.62■■□□□ 1.69
SAG-211ENST00000474206 HMGXB3Q12766 1538 aa25.61■■□□□ 1.69
SAG-211ENST00000474206 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.54■■□□□ 1.68
SAG-211ENST00000474206 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SAG-211ENST00000474206 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.39■■□□□ 1.65
SAG-211ENST00000474206 ERCC6Q03468 1493 aa25.15■■□□□ 1.62
SAG-211ENST00000474206 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.12■■□□□ 1.61
SAG-211ENST00000474206 WIZO95785 1651 aa25.1■■□□□ 1.61
SAG-211ENST00000474206 CUX2O14529 1486 aa25.08■■□□□ 1.6
SAG-211ENST00000474206 NESP48681 1621 aa25.03■■□□□ 1.6
SAG-211ENST00000474206 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SAG-211ENST00000474206 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SAG-211ENST00000474206 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.91■■□□□ 1.58
SAG-211ENST00000474206 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.89■■□□□ 1.57
SAG-211ENST00000474206 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SAG-211ENST00000474206 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.83■■□□□ 1.57
SAG-211ENST00000474206 CFTRP13569 1480 aa24.7■■□□□ 1.55
SAG-211ENST00000474206 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.67■■□□□ 1.54
SAG-211ENST00000474206 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.64■■□□□ 1.54
SAG-211ENST00000474206 WDR62O43379 1518 aa24.63■■□□□ 1.53
SAG-211ENST00000474206 PRDM2Q13029 1718 aa24.61■■□□□ 1.53
SAG-211ENST00000474206 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.6■■□□□ 1.53
SAG-211ENST00000474206 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.52■■□□□ 1.52
SAG-211ENST00000474206 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.49■■□□□ 1.51
SAG-211ENST00000474206 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SAG-211ENST00000474206 ABCC8Q09428 1581 aa24.27■■□□□ 1.48
SAG-211ENST00000474206 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.18■■□□□ 1.46
SAG-211ENST00000474206 TOPBP1Q92547 1522 aa24.18■■□□□ 1.46
SAG-211ENST00000474206 IFT140Q96RY7 1462 aa24.15■■□□□ 1.46
SAG-211ENST00000474206 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SAG-211ENST00000474206 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
SAG-211ENST00000474206 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SAG-211ENST00000474206 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SAG-211ENST00000474206 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SAG-211ENST00000474206 WDR97A6NE52 1622 aa23.92■■□□□ 1.42
SAG-211ENST00000474206 CUX1P39880 1505 aa23.85■■□□□ 1.41
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SAG-211ENST00000474206 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.85■■□□□ 1.41
SAG-211ENST00000474206 SOGA1O94964 1423 aa23.81■■□□□ 1.4
SAG-211ENST00000474206 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.76■■□□□ 1.39
SAG-211ENST00000474206 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.75■■□□□ 1.39
SAG-211ENST00000474206 CHD1O14646 1710 aa23.69■■□□□ 1.38
SAG-211ENST00000474206 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.66■■□□□ 1.38
SAG-211ENST00000474206 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SAG-211ENST00000474206 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SAG-211ENST00000474206 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.64■■□□□ 1.38
SAG-211ENST00000474206 TOP2BQ02880 1626 aa23.64■■□□□ 1.38
SAG-211ENST00000474206 GRIN2BQ13224 1484 aa23.63■■□□□ 1.37
SAG-211ENST00000474206 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
SAG-211ENST00000474206 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.61■■□□□ 1.37
SAG-211ENST00000474206 PBRM1Q86U86 1689 aa23.6■■□□□ 1.37
SAG-211ENST00000474206 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.59■■□□□ 1.37
SAG-211ENST00000474206 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.57■■□□□ 1.36
SAG-211ENST00000474206 SYNJ1O43426 1573 aa23.56■■□□□ 1.36
SAG-211ENST00000474206 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.55■■□□□ 1.36
SAG-211ENST00000474206 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.55■■□□□ 1.36
SAG-211ENST00000474206 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.55■■□□□ 1.36
SAG-211ENST00000474206 SYNJ2O15056 1496 aa23.53■■□□□ 1.36
SAG-211ENST00000474206 ARHGEF11O15085 1522 aa23.53■■□□□ 1.36
SAG-211ENST00000474206 FBLN2P98095 1184 aa23.49■■□□□ 1.35
SAG-211ENST00000474206 TRIM41Q8WV44 630 aa23.48■■□□□ 1.35
SAG-211ENST00000474206 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SAG-211ENST00000474206 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.44■■□□□ 1.34
SAG-211ENST00000474206 ADAMTS12P58397 1594 aa23.4■■□□□ 1.34
SAG-211ENST00000474206 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.39■■□□□ 1.34
SAG-211ENST00000474206 GRIN2AQ12879 1464 aa23.33■■□□□ 1.33
SAG-211ENST00000474206 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.31■■□□□ 1.32
SAG-211ENST00000474206 ARAP1Q96P48 1450 aa23.29■■□□□ 1.32
SAG-211ENST00000474206 NUP160Q12769 1436 aa23.25■■□□□ 1.31
SAG-211ENST00000474206 CEP170Q5SW79 1584 aa23.19■■□□□ 1.3
SAG-211ENST00000474206 KIF27Q86VH2 1401 aa23.18■■□□□ 1.3
SAG-211ENST00000474206 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.18■■□□□ 1.3
SAG-211ENST00000474206 CUL7Q14999 1698 aa23.16■■□□□ 1.3
SAG-211ENST00000474206 SHROOM2Q13796 1616 aa23.14■■□□□ 1.29
SAG-211ENST00000474206 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.06■■□□□ 1.28
SAG-211ENST00000474206 IGF1RP08069 1367 aa23.01■■□□□ 1.27
SAG-211ENST00000474206 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.97■■□□□ 1.27
SAG-211ENST00000474206 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.94■■□□□ 1.26
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