RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.67■■■□□ 2.02
NISCH-206ENST00000474188 ABCC9O60706 1549 aa25.02■■□□□ 1.6
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NISCH-206ENST00000474188 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.76■■□□□ 1.39
NISCH-206ENST00000474188 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.61■■□□□ 1.37
NISCH-206ENST00000474188 NACADO15069 1562 aa23.45■■□□□ 1.34
NISCH-206ENST00000474188 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-206ENST00000474188 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
NISCH-206ENST00000474188 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.16■■□□□ 1.3
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NISCH-206ENST00000474188 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.1■■□□□ 1.29
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NISCH-206ENST00000474188 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.78■■□□□ 1.24
NISCH-206ENST00000474188 SCRIBQ14160 1630 aa22.64■■□□□ 1.22
NISCH-206ENST00000474188 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-206ENST00000474188 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-206ENST00000474188 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.51■■□□□ 1.19
NISCH-206ENST00000474188 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
NISCH-206ENST00000474188 NCAPD3P42695 1498 aa21.74■■□□□ 1.07
NISCH-206ENST00000474188 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-206ENST00000474188 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.68■■□□□ 1.06
NISCH-206ENST00000474188 SMARCA4P51532 1647 aa21.58■■□□□ 1.04
NISCH-206ENST00000474188 NESP48681 1621 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-206ENST00000474188 HMGXB3Q12766 1538 aa21.5■■□□□ 1.03
NISCH-206ENST00000474188 CUX2O14529 1486 aa21.49■■□□□ 1.03
NISCH-206ENST00000474188 SMARCA2P51531 1590 aa21.48■■□□□ 1.03
NISCH-206ENST00000474188 ERCC6Q03468 1493 aa21.47■■□□□ 1.03
NISCH-206ENST00000474188 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NISCH-206ENST00000474188 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.39■■□□□ 1.01
NISCH-206ENST00000474188 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NISCH-206ENST00000474188 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-206ENST00000474188 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
NISCH-206ENST00000474188 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.17■□□□□ 0.98
NISCH-206ENST00000474188 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.12■□□□□ 0.97
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NISCH-206ENST00000474188 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.07■□□□□ 0.96
NISCH-206ENST00000474188 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.05■□□□□ 0.96
NISCH-206ENST00000474188 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.93■□□□□ 0.94
NISCH-206ENST00000474188 WDR62O43379 1518 aa20.9■□□□□ 0.94
NISCH-206ENST00000474188 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
NISCH-206ENST00000474188 CFTRP13569 1480 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-206ENST00000474188 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-206ENST00000474188 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.79■□□□□ 0.92
NISCH-206ENST00000474188 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
NISCH-206ENST00000474188 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
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NISCH-206ENST00000474188 OSCARQ8IYS5 282 aa20.52■□□□□ 0.88
NISCH-206ENST00000474188 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
NISCH-206ENST00000474188 PRDM2Q13029 1718 aa20.43■□□□□ 0.86
NISCH-206ENST00000474188 TOPBP1Q92547 1522 aa20.43■□□□□ 0.86
NISCH-206ENST00000474188 IFT140Q96RY7 1462 aa20.39■□□□□ 0.85
NISCH-206ENST00000474188 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-206ENST00000474188 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.31■□□□□ 0.84
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NISCH-206ENST00000474188 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NISCH-206ENST00000474188 ARHGEF11O15085 1522 aa20.24■□□□□ 0.83
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NISCH-206ENST00000474188 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NISCH-206ENST00000474188 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.21■□□□□ 0.83
NISCH-206ENST00000474188 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NISCH-206ENST00000474188 CHD1O14646 1710 aa20.13■□□□□ 0.81
NISCH-206ENST00000474188 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.11■□□□□ 0.81
NISCH-206ENST00000474188 SOGA1O94964 1423 aa20.1■□□□□ 0.81
NISCH-206ENST00000474188 ARAP1Q96P48 1450 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-206ENST00000474188 CUX1P39880 1505 aa20.08■□□□□ 0.81
NISCH-206ENST00000474188 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.07■□□□□ 0.8
NISCH-206ENST00000474188 FBLN2P98095 1184 aa20.07■□□□□ 0.8
NISCH-206ENST00000474188 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-206ENST00000474188 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.96■□□□□ 0.79
NISCH-206ENST00000474188 WDR97A6NE52 1622 aa19.91■□□□□ 0.78
NISCH-206ENST00000474188 GRIN2BQ13224 1484 aa19.9■□□□□ 0.78
NISCH-206ENST00000474188 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
NISCH-206ENST00000474188 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
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NISCH-206ENST00000474188 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.83■□□□□ 0.76
NISCH-206ENST00000474188 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-206ENST00000474188 SYNJ1O43426 1573 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-206ENST00000474188 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-206ENST00000474188 PBRM1Q86U86 1689 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-206ENST00000474188 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.74■□□□□ 0.75
NISCH-206ENST00000474188 GRIN2AQ12879 1464 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-206ENST00000474188 ADAMTS12P58397 1594 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-206ENST00000474188 CEP170Q5SW79 1584 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-206ENST00000474188 NUP160Q12769 1436 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-206ENST00000474188 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.65■□□□□ 0.74
NISCH-206ENST00000474188 TOP2BQ02880 1626 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-206ENST00000474188 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-206ENST00000474188 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-206ENST00000474188 SHROOM2Q13796 1616 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-206ENST00000474188 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.51■□□□□ 0.71
NISCH-206ENST00000474188 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
NISCH-206ENST00000474188 JPH4Q96JJ6 628 aa19.43■□□□□ 0.7
NISCH-206ENST00000474188 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-206ENST00000474188 IGF1RP08069 1367 aa19.36■□□□□ 0.69
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