RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.06■■■■■ 4.96
SYF2-203ENST00000474160 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.02■■■■■ 4.16
SYF2-203ENST00000474160 ABCC9O60706 1549 aa40.01■■■■□ 3.99
SYF2-203ENST00000474160 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.61■■■■□ 3.77
SYF2-203ENST00000474160 NACADO15069 1562 aa38.6■■■■□ 3.77
SYF2-203ENST00000474160 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.44■■■■□ 3.74
SYF2-203ENST00000474160 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
SYF2-203ENST00000474160 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.34■■■■□ 3.73
SYF2-203ENST00000474160 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.22■■■■□ 3.71
SYF2-203ENST00000474160 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.59■■■■□ 3.61
SYF2-203ENST00000474160 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.35■■■■□ 3.57
SYF2-203ENST00000474160 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.34■■■■□ 3.57
SYF2-203ENST00000474160 SCRIBQ14160 1630 aa37.26■■■■□ 3.56
SYF2-203ENST00000474160 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.21■■■■□ 3.55
SYF2-203ENST00000474160 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.7■■■■□ 3.47
SYF2-203ENST00000474160 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
SYF2-203ENST00000474160 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.24■■■■□ 3.39
SYF2-203ENST00000474160 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.03■■■■□ 3.36
SYF2-203ENST00000474160 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
SYF2-203ENST00000474160 SMARCA4P51532 1647 aa35.72■■■■□ 3.31
SYF2-203ENST00000474160 NCAPD3P42695 1498 aa35.6■■■■□ 3.29
SYF2-203ENST00000474160 SMARCA2P51531 1590 aa35.58■■■■□ 3.29
SYF2-203ENST00000474160 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.56■■■■□ 3.28
SYF2-203ENST00000474160 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.47■■■■□ 3.27
SYF2-203ENST00000474160 HMGXB3Q12766 1538 aa35.43■■■■□ 3.26
SYF2-203ENST00000474160 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.41■■■■□ 3.26
SYF2-203ENST00000474160 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
SYF2-203ENST00000474160 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
SYF2-203ENST00000474160 WIZO95785 1651 aa35■■■■□ 3.19
SYF2-203ENST00000474160 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
SYF2-203ENST00000474160 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.66■■■■□ 3.14
SYF2-203ENST00000474160 NESP48681 1621 aa34.58■■■■□ 3.13
SYF2-203ENST00000474160 ERCC6Q03468 1493 aa34.57■■■■□ 3.12
SYF2-203ENST00000474160 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.54■■■■□ 3.12
SYF2-203ENST00000474160 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.46■■■■□ 3.11
SYF2-203ENST00000474160 CFTRP13569 1480 aa34.33■■■■□ 3.09
SYF2-203ENST00000474160 CUX2O14529 1486 aa34.32■■■■□ 3.08
SYF2-203ENST00000474160 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.27■■■■□ 3.08
SYF2-203ENST00000474160 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.19■■■■□ 3.06
SYF2-203ENST00000474160 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
SYF2-203ENST00000474160 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.1■■■■□ 3.05
SYF2-203ENST00000474160 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.08■■■■□ 3.05
SYF2-203ENST00000474160 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.05■■■■□ 3.04
SYF2-203ENST00000474160 PRDM2Q13029 1718 aa34.04■■■■□ 3.04
SYF2-203ENST00000474160 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
SYF2-203ENST00000474160 WDR62O43379 1518 aa33.94■■■■□ 3.02
SYF2-203ENST00000474160 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
SYF2-203ENST00000474160 ABCC8Q09428 1581 aa33.68■■■□□ 2.98
SYF2-203ENST00000474160 TOPBP1Q92547 1522 aa33.54■■■□□ 2.96
SYF2-203ENST00000474160 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.53■■■□□ 2.96
SYF2-203ENST00000474160 IFT140Q96RY7 1462 aa33.41■■■□□ 2.94
SYF2-203ENST00000474160 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
SYF2-203ENST00000474160 CUX1P39880 1505 aa33.24■■■□□ 2.91
SYF2-203ENST00000474160 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.23■■■□□ 2.91
SYF2-203ENST00000474160 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
SYF2-203ENST00000474160 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.15■■■□□ 2.9
SYF2-203ENST00000474160 SOGA1O94964 1423 aa33.13■■■□□ 2.89
SYF2-203ENST00000474160 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
SYF2-203ENST00000474160 WDR97A6NE52 1622 aa33.08■■■□□ 2.89
SYF2-203ENST00000474160 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.07■■■□□ 2.88
SYF2-203ENST00000474160 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.04■■■□□ 2.88
SYF2-203ENST00000474160 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
SYF2-203ENST00000474160 TOP2BQ02880 1626 aa33■■■□□ 2.87
SYF2-203ENST00000474160 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.99■■■□□ 2.87
SYF2-203ENST00000474160 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.94■■■□□ 2.867e-7■■■■□ 25.2
SYF2-203ENST00000474160 SYNJ1O43426 1573 aa32.91■■■□□ 2.86
SYF2-203ENST00000474160 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.9■■■□□ 2.86
SYF2-203ENST00000474160 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
SYF2-203ENST00000474160 OSCARQ8IYS5 282 aa32.83■■■□□ 2.85
SYF2-203ENST00000474160 GRIN2BQ13224 1484 aa32.79■■■□□ 2.84
SYF2-203ENST00000474160 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.76■■■□□ 2.84
SYF2-203ENST00000474160 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
SYF2-203ENST00000474160 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.73■■■□□ 2.83
SYF2-203ENST00000474160 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.67■■■□□ 2.82
SYF2-203ENST00000474160 PBRM1Q86U86 1689 aa32.63■■■□□ 2.81
SYF2-203ENST00000474160 CHD1O14646 1710 aa32.58■■■□□ 2.81
SYF2-203ENST00000474160 SYNJ2O15056 1496 aa32.58■■■□□ 2.81
SYF2-203ENST00000474160 FBLN2P98095 1184 aa32.54■■■□□ 2.8
SYF2-203ENST00000474160 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.53■■■□□ 2.8
SYF2-203ENST00000474160 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
SYF2-203ENST00000474160 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.42■■■□□ 2.78
SYF2-203ENST00000474160 KIF27Q86VH2 1401 aa32.42■■■□□ 2.78
SYF2-203ENST00000474160 ADAMTS12P58397 1594 aa32.41■■■□□ 2.78
SYF2-203ENST00000474160 GRIN2AQ12879 1464 aa32.34■■■□□ 2.77
SYF2-203ENST00000474160 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.31■■■□□ 2.76
SYF2-203ENST00000474160 ARHGEF11O15085 1522 aa32.26■■■□□ 2.75
SYF2-203ENST00000474160 IGF1RP08069 1367 aa32.25■■■□□ 2.75
SYF2-203ENST00000474160 NUP160Q12769 1436 aa32.23■■■□□ 2.75
SYF2-203ENST00000474160 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.22■■■□□ 2.75
SYF2-203ENST00000474160 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.22■■■□□ 2.75
SYF2-203ENST00000474160 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.22■■■□□ 2.75
SYF2-203ENST00000474160 TRIM41Q8WV44 630 aa32.22■■■□□ 2.75
SYF2-203ENST00000474160 CUL7Q14999 1698 aa32.21■■■□□ 2.75
SYF2-203ENST00000474160 CEP170Q5SW79 1584 aa32.12■■■□□ 2.73
SYF2-203ENST00000474160 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.07■■■□□ 2.72
SYF2-203ENST00000474160 ARAP1Q96P48 1450 aa31.97■■■□□ 2.71
SYF2-203ENST00000474160 SHROOM2Q13796 1616 aa31.97■■■□□ 2.71
SYF2-203ENST00000474160 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.93■■■□□ 2.7
SYF2-203ENST00000474160 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.91■■■□□ 2.7
SYF2-203ENST00000474160 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms