RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474088.1

PKD1-211, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 5

Gene PKD1, Length 923 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-211ENST00000474088 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.02■■■■■ 7.52
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PKD1-211ENST00000474088 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.04■■■■■ 5.6
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PKD1-211ENST00000474088 SMARCA2P51531 1590 aa48.25■■■■■ 5.31
PKD1-211ENST00000474088 HMGXB3Q12766 1538 aa48.15■■■■■ 5.3
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PKD1-211ENST00000474088 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.88■■■■■ 5.25
PKD1-211ENST00000474088 CUX2O14529 1486 aa47.84■■■■■ 5.25
PKD1-211ENST00000474088 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.81■■■■■ 5.24
PKD1-211ENST00000474088 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.79■■■■■ 5.24
PKD1-211ENST00000474088 NESP48681 1621 aa47.74■■■■■ 5.23
PKD1-211ENST00000474088 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.41■■■■■ 5.18
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PKD1-211ENST00000474088 WIZO95785 1651 aa47.19■■■■■ 5.15
PKD1-211ENST00000474088 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.17■■■■■ 5.14
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PKD1-211ENST00000474088 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.07■■■■■ 5.13
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PKD1-211ENST00000474088 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.73■■■■■ 5.07
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PKD1-211ENST00000474088 CFTRP13569 1480 aa46.55■■■■■ 5.04
PKD1-211ENST00000474088 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.52■■■■■ 5.04
PKD1-211ENST00000474088 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.13■■■■■ 4.98
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PKD1-211ENST00000474088 PRDM2Q13029 1718 aa45.99■■■■■ 4.95
PKD1-211ENST00000474088 OSCARQ8IYS5 282 aa45.75■■■■■ 4.91
PKD1-211ENST00000474088 TRIM41Q8WV44 630 aa45.72■■■■■ 4.91
PKD1-211ENST00000474088 TOPBP1Q92547 1522 aa45.65■■■■■ 4.9
PKD1-211ENST00000474088 IFT140Q96RY7 1462 aa45.64■■■■■ 4.9
PKD1-211ENST00000474088 ABCC8Q09428 1581 aa45.58■■■■■ 4.89
PKD1-211ENST00000474088 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.56■■■■■ 4.88
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PKD1-211ENST00000474088 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
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PKD1-211ENST00000474088 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.04■■■■■ 4.8
PKD1-211ENST00000474088 SOGA1O94964 1423 aa45.02■■■■■ 4.8
PKD1-211ENST00000474088 ARHGEF11O15085 1522 aa44.93■■■■■ 4.78
PKD1-211ENST00000474088 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
PKD1-211ENST00000474088 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.91■■■■■ 4.78
PKD1-211ENST00000474088 CHD1O14646 1710 aa44.9■■■■■ 4.78
PKD1-211ENST00000474088 FBLN2P98095 1184 aa44.9■■■■■ 4.78
PKD1-211ENST00000474088 CUX1P39880 1505 aa44.88■■■■■ 4.78
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PKD1-211ENST00000474088 WDR97A6NE52 1622 aa44.75■■■■■ 4.75
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PKD1-211ENST00000474088 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.67■■■■■ 4.74
PKD1-211ENST00000474088 GRIN2BQ13224 1484 aa44.59■■■■■ 4.73
PKD1-211ENST00000474088 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.58■■■■■ 4.73
PKD1-211ENST00000474088 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.58■■■■■ 4.73
PKD1-211ENST00000474088 ARAP1Q96P48 1450 aa44.5■■■■■ 4.71
PKD1-211ENST00000474088 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.46■■■■■ 4.71
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PKD1-211ENST00000474088 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.42■■■■■ 4.7
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PKD1-211ENST00000474088 PBRM1Q86U86 1689 aa44.35■■■■■ 4.69
PKD1-211ENST00000474088 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.31■■■■■ 4.68
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PKD1-211ENST00000474088 CEP170Q5SW79 1584 aa43.84■■■■■ 4.61
PKD1-211ENST00000474088 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.75■■■■■ 4.59
PKD1-211ENST00000474088 SHROOM2Q13796 1616 aa43.63■■■■■ 4.58
PKD1-211ENST00000474088 JPH4Q96JJ6 628 aa43.49■■■■■ 4.55
PKD1-211ENST00000474088 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
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PKD1-211ENST00000474088 KIF27Q86VH2 1401 aa43.36■■■■■ 4.53
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