RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473600.1

C1orf159-214, Transcript of chromosome 1 open reading frame 159, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf159, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf159-214ENST00000473600 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.48■■■■■ 4.07
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C1orf159-214ENST00000473600 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.19■■■□□ 2.9
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C1orf159-214ENST00000473600 SCRIBQ14160 1630 aa32.83■■■□□ 2.85
C1orf159-214ENST00000473600 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.62■■■□□ 2.81
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C1orf159-214ENST00000473600 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.97■■■□□ 2.71
C1orf159-214ENST00000473600 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.78■■■□□ 2.68
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C1orf159-214ENST00000473600 NCAPD3P42695 1498 aa31.31■■■□□ 2.6
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C1orf159-214ENST00000473600 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.17■■■□□ 2.58
C1orf159-214ENST00000473600 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.14■■■□□ 2.58
C1orf159-214ENST00000473600 HMGXB3Q12766 1538 aa31.13■■■□□ 2.57
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C1orf159-214ENST00000473600 NESP48681 1621 aa30.55■■■□□ 2.48
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C1orf159-214ENST00000473600 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.49■■■□□ 2.47
C1orf159-214ENST00000473600 ERCC6Q03468 1493 aa30.47■■■□□ 2.47
C1orf159-214ENST00000473600 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.39■■■□□ 2.45
C1orf159-214ENST00000473600 CUX2O14529 1486 aa30.36■■■□□ 2.45
C1orf159-214ENST00000473600 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.3■■■□□ 2.44
C1orf159-214ENST00000473600 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.19■■■□□ 2.42
C1orf159-214ENST00000473600 CFTRP13569 1480 aa30.18■■■□□ 2.42
C1orf159-214ENST00000473600 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.16■■■□□ 2.42
C1orf159-214ENST00000473600 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
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C1orf159-214ENST00000473600 PRDM2Q13029 1718 aa29.93■■■□□ 2.38
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C1orf159-214ENST00000473600 CUX1P39880 1505 aa29.25■■■□□ 2.27
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C1orf159-214ENST00000473600 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.13■■■□□ 2.25
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C1orf159-214ENST00000473600 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.78■■■□□ 2.2
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C1orf159-214ENST00000473600 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
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C1orf159-214ENST00000473600 CEP170Q5SW79 1584 aa28.29■■■□□ 2.12
C1orf159-214ENST00000473600 CUL7Q14999 1698 aa28.27■■■□□ 2.12
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C1orf159-214ENST00000473600 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.21■■■□□ 2.11
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C1orf159-214ENST00000473600 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.13■■■□□ 2.09
C1orf159-214ENST00000473600 JPH4Q96JJ6 628 aa28.07■■■□□ 2.08
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