RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473188.5

FRMD4B-209, Transcript of FERM domain containing 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FRMD4B, Length 923 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4B-209ENST00000473188 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.94■■■■■ 7.19
FRMD4B-209ENST00000473188 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.46■■■■■ 6.15
FRMD4B-209ENST00000473188 ABCC9O60706 1549 aa52.95■■■■■ 6.07
FRMD4B-209ENST00000473188 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.62■■■■■ 5.69
FRMD4B-209ENST00000473188 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.45■■■■■ 5.67
FRMD4B-209ENST00000473188 NACADO15069 1562 aa50.43■■■■■ 5.66
FRMD4B-209ENST00000473188 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.9■■■■■ 5.58
FRMD4B-209ENST00000473188 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.79■■■■■ 5.56
FRMD4B-209ENST00000473188 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.5■■■■■ 5.52
FRMD4B-209ENST00000473188 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.47■■■■■ 5.51
FRMD4B-209ENST00000473188 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.44■■■■■ 5.51
FRMD4B-209ENST00000473188 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.13■■■■■ 5.46
FRMD4B-209ENST00000473188 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.12■■■■■ 5.45
FRMD4B-209ENST00000473188 SCRIBQ14160 1630 aa48.83■■■■■ 5.41
FRMD4B-209ENST00000473188 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.46■■■■■ 5.35
FRMD4B-209ENST00000473188 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.87■■■■■ 5.25
FRMD4B-209ENST00000473188 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.82■■■■■ 5.25
FRMD4B-209ENST00000473188 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.6■■■■■ 5.21
FRMD4B-209ENST00000473188 SMARCA4P51532 1647 aa46.61■■■■■ 5.05
FRMD4B-209ENST00000473188 NCAPD3P42695 1498 aa46.55■■■■■ 5.04
FRMD4B-209ENST00000473188 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.52■■■■■ 5.04
FRMD4B-209ENST00000473188 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.47■■■■■ 5.03
FRMD4B-209ENST00000473188 SMARCA2P51531 1590 aa46.4■■■■■ 5.02
FRMD4B-209ENST00000473188 HMGXB3Q12766 1538 aa46.23■■■■■ 4.99
FRMD4B-209ENST00000473188 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.21■■■■■ 4.99
FRMD4B-209ENST00000473188 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.13■■■■■ 4.97
FRMD4B-209ENST00000473188 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.11■■■■■ 4.97
FRMD4B-209ENST00000473188 WIZO95785 1651 aa45.69■■■■■ 4.9
FRMD4B-209ENST00000473188 ERCC6Q03468 1493 aa45.66■■■■■ 4.9
FRMD4B-209ENST00000473188 NESP48681 1621 aa45.66■■■■■ 4.9
FRMD4B-209ENST00000473188 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.49■■■■■ 4.87
FRMD4B-209ENST00000473188 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.38■■■■■ 4.86
FRMD4B-209ENST00000473188 CUX2O14529 1486 aa45.31■■■■■ 4.84
FRMD4B-209ENST00000473188 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.2■■■■■ 4.83
FRMD4B-209ENST00000473188 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.14■■■■■ 4.82
FRMD4B-209ENST00000473188 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.82
FRMD4B-209ENST00000473188 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.06■■■■■ 4.8
FRMD4B-209ENST00000473188 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
FRMD4B-209ENST00000473188 CFTRP13569 1480 aa44.79■■■■■ 4.76
FRMD4B-209ENST00000473188 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.71■■■■■ 4.75
FRMD4B-209ENST00000473188 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.68■■■■■ 4.74
FRMD4B-209ENST00000473188 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.66■■■■■ 4.74
FRMD4B-209ENST00000473188 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.65■■■■■ 4.74
FRMD4B-209ENST00000473188 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.63■■■■■ 4.74
FRMD4B-209ENST00000473188 WDR62O43379 1518 aa44.55■■■■■ 4.72
FRMD4B-209ENST00000473188 PRDM2Q13029 1718 aa44.36■■■■■ 4.69
FRMD4B-209ENST00000473188 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
FRMD4B-209ENST00000473188 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
FRMD4B-209ENST00000473188 TOPBP1Q92547 1522 aa43.9■■■■■ 4.62
FRMD4B-209ENST00000473188 ABCC8Q09428 1581 aa43.83■■■■■ 4.61
FRMD4B-209ENST00000473188 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.77■■■■■ 4.6
FRMD4B-209ENST00000473188 IFT140Q96RY7 1462 aa43.73■■■■■ 4.59
FRMD4B-209ENST00000473188 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.58
FRMD4B-209ENST00000473188 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
FRMD4B-209ENST00000473188 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
FRMD4B-209ENST00000473188 OSCARQ8IYS5 282 aa43.42■■■■■ 4.54
FRMD4B-209ENST00000473188 CUX1P39880 1505 aa43.38■■■■■ 4.54
FRMD4B-209ENST00000473188 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
FRMD4B-209ENST00000473188 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.35■■■■■ 4.53
FRMD4B-209ENST00000473188 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.33■■■■■ 4.53
FRMD4B-209ENST00000473188 SOGA1O94964 1423 aa43.33■■■■■ 4.53
FRMD4B-209ENST00000473188 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.32■■■■■ 4.52
FRMD4B-209ENST00000473188 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
FRMD4B-209ENST00000473188 TRIM41Q8WV44 630 aa43■■■■■ 4.47
FRMD4B-209ENST00000473188 WDR97A6NE52 1622 aa43■■■■■ 4.47
FRMD4B-209ENST00000473188 FBLN2P98095 1184 aa42.97■■■■■ 4.47
FRMD4B-209ENST00000473188 CHD1O14646 1710 aa42.95■■■■■ 4.47
FRMD4B-209ENST00000473188 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.89■■■■■ 4.46
FRMD4B-209ENST00000473188 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.88■■■■■ 4.46
FRMD4B-209ENST00000473188 GRIN2BQ13224 1484 aa42.86■■■■■ 4.45
FRMD4B-209ENST00000473188 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.84■■■■■ 4.45
FRMD4B-209ENST00000473188 TOP2BQ02880 1626 aa42.82■■■■■ 4.45
FRMD4B-209ENST00000473188 SYNJ1O43426 1573 aa42.82■■■■■ 4.44
FRMD4B-209ENST00000473188 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.81■■■■■ 4.44
FRMD4B-209ENST00000473188 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.81■■■■■ 4.44
FRMD4B-209ENST00000473188 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
FRMD4B-209ENST00000473188 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.74■■■■■ 4.43
FRMD4B-209ENST00000473188 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.74■■■■■ 4.43
FRMD4B-209ENST00000473188 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.74■■■■■ 4.43
FRMD4B-209ENST00000473188 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
FRMD4B-209ENST00000473188 PBRM1Q86U86 1689 aa42.71■■■■■ 4.43
FRMD4B-209ENST00000473188 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.7■■■■■ 4.43
FRMD4B-209ENST00000473188 ARHGEF11O15085 1522 aa42.67■■■■■ 4.42
FRMD4B-209ENST00000473188 SYNJ2O15056 1496 aa42.63■■■■■ 4.42
FRMD4B-209ENST00000473188 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.46■■■■■ 4.39
FRMD4B-209ENST00000473188 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.39■■■■■ 4.38
FRMD4B-209ENST00000473188 ADAMTS12P58397 1594 aa42.35■■■■■ 4.37
FRMD4B-209ENST00000473188 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.3■■■■■ 4.36
FRMD4B-209ENST00000473188 GRIN2AQ12879 1464 aa42.3■■■■■ 4.36
FRMD4B-209ENST00000473188 ARAP1Q96P48 1450 aa42.3■■■■■ 4.36
FRMD4B-209ENST00000473188 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.28■■■■■ 4.36
FRMD4B-209ENST00000473188 NUP160Q12769 1436 aa42.13■■■■■ 4.34
FRMD4B-209ENST00000473188 CEP170Q5SW79 1584 aa42.12■■■■■ 4.33
FRMD4B-209ENST00000473188 KIF27Q86VH2 1401 aa42.04■■■■■ 4.32
FRMD4B-209ENST00000473188 IGF1RP08069 1367 aa41.97■■■■■ 4.31
FRMD4B-209ENST00000473188 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.89■■■■■ 4.3
FRMD4B-209ENST00000473188 SHROOM2Q13796 1616 aa41.84■■■■■ 4.29
FRMD4B-209ENST00000473188 CUL7Q14999 1698 aa41.8■■■■■ 4.28
FRMD4B-209ENST00000473188 JPH4Q96JJ6 628 aa41.76■■■■■ 4.28
FRMD4B-209ENST00000473188 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms