RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473188.5

FRMD4B-209, Transcript of FERM domain containing 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FRMD4B, Length 923 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4B-209ENST00000473188 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.94■■■■■ 7.19
FRMD4B-209ENST00000473188 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.46■■■■■ 6.15
FRMD4B-209ENST00000473188 ABCC9O60706 1549 aa52.95■■■■■ 6.07
FRMD4B-209ENST00000473188 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.62■■■■■ 5.69
FRMD4B-209ENST00000473188 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.45■■■■■ 5.67
FRMD4B-209ENST00000473188 NACADO15069 1562 aa50.43■■■■■ 5.66
FRMD4B-209ENST00000473188 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.9■■■■■ 5.58
FRMD4B-209ENST00000473188 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.79■■■■■ 5.56
FRMD4B-209ENST00000473188 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.5■■■■■ 5.52
FRMD4B-209ENST00000473188 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.47■■■■■ 5.51
FRMD4B-209ENST00000473188 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.44■■■■■ 5.51
FRMD4B-209ENST00000473188 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.13■■■■■ 5.46
FRMD4B-209ENST00000473188 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.12■■■■■ 5.45
FRMD4B-209ENST00000473188 SCRIBQ14160 1630 aa48.83■■■■■ 5.41
FRMD4B-209ENST00000473188 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.46■■■■■ 5.35
FRMD4B-209ENST00000473188 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.87■■■■■ 5.25
FRMD4B-209ENST00000473188 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.82■■■■■ 5.25
FRMD4B-209ENST00000473188 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.6■■■■■ 5.21
FRMD4B-209ENST00000473188 SMARCA4P51532 1647 aa46.61■■■■■ 5.05
FRMD4B-209ENST00000473188 NCAPD3P42695 1498 aa46.55■■■■■ 5.04
FRMD4B-209ENST00000473188 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.52■■■■■ 5.04
FRMD4B-209ENST00000473188 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.47■■■■■ 5.03
FRMD4B-209ENST00000473188 SMARCA2P51531 1590 aa46.4■■■■■ 5.02
FRMD4B-209ENST00000473188 HMGXB3Q12766 1538 aa46.23■■■■■ 4.99
FRMD4B-209ENST00000473188 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.21■■■■■ 4.99
FRMD4B-209ENST00000473188 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.13■■■■■ 4.97
FRMD4B-209ENST00000473188 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.11■■■■■ 4.97
FRMD4B-209ENST00000473188 WIZO95785 1651 aa45.69■■■■■ 4.9
FRMD4B-209ENST00000473188 ERCC6Q03468 1493 aa45.66■■■■■ 4.9
FRMD4B-209ENST00000473188 NESP48681 1621 aa45.66■■■■■ 4.9
FRMD4B-209ENST00000473188 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.49■■■■■ 4.87
FRMD4B-209ENST00000473188 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.38■■■■■ 4.86
FRMD4B-209ENST00000473188 CUX2O14529 1486 aa45.31■■■■■ 4.84
FRMD4B-209ENST00000473188 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.2■■■■■ 4.83
FRMD4B-209ENST00000473188 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.14■■■■■ 4.82
FRMD4B-209ENST00000473188 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.82
FRMD4B-209ENST00000473188 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.06■■■■■ 4.8
FRMD4B-209ENST00000473188 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
FRMD4B-209ENST00000473188 CFTRP13569 1480 aa44.79■■■■■ 4.76
FRMD4B-209ENST00000473188 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.71■■■■■ 4.75
FRMD4B-209ENST00000473188 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.68■■■■■ 4.74
FRMD4B-209ENST00000473188 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.66■■■■■ 4.74
FRMD4B-209ENST00000473188 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.65■■■■■ 4.74
FRMD4B-209ENST00000473188 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.63■■■■■ 4.74
FRMD4B-209ENST00000473188 WDR62O43379 1518 aa44.55■■■■■ 4.72
FRMD4B-209ENST00000473188 PRDM2Q13029 1718 aa44.36■■■■■ 4.69
FRMD4B-209ENST00000473188 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
FRMD4B-209ENST00000473188 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
FRMD4B-209ENST00000473188 TOPBP1Q92547 1522 aa43.9■■■■■ 4.62
FRMD4B-209ENST00000473188 ABCC8Q09428 1581 aa43.83■■■■■ 4.61
FRMD4B-209ENST00000473188 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.77■■■■■ 4.6
FRMD4B-209ENST00000473188 IFT140Q96RY7 1462 aa43.73■■■■■ 4.59
FRMD4B-209ENST00000473188 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.58
FRMD4B-209ENST00000473188 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
FRMD4B-209ENST00000473188 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
FRMD4B-209ENST00000473188 OSCARQ8IYS5 282 aa43.42■■■■■ 4.54
FRMD4B-209ENST00000473188 CUX1P39880 1505 aa43.38■■■■■ 4.54
FRMD4B-209ENST00000473188 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
FRMD4B-209ENST00000473188 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.35■■■■■ 4.53
FRMD4B-209ENST00000473188 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.33■■■■■ 4.53
FRMD4B-209ENST00000473188 SOGA1O94964 1423 aa43.33■■■■■ 4.53
FRMD4B-209ENST00000473188 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.32■■■■■ 4.52
FRMD4B-209ENST00000473188 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
FRMD4B-209ENST00000473188 TRIM41Q8WV44 630 aa43■■■■■ 4.47
FRMD4B-209ENST00000473188 WDR97A6NE52 1622 aa43■■■■■ 4.47
FRMD4B-209ENST00000473188 FBLN2P98095 1184 aa42.97■■■■■ 4.47
FRMD4B-209ENST00000473188 CHD1O14646 1710 aa42.95■■■■■ 4.47
FRMD4B-209ENST00000473188 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.89■■■■■ 4.46
FRMD4B-209ENST00000473188 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.88■■■■■ 4.46
FRMD4B-209ENST00000473188 GRIN2BQ13224 1484 aa42.86■■■■■ 4.45
FRMD4B-209ENST00000473188 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.84■■■■■ 4.45
FRMD4B-209ENST00000473188 TOP2BQ02880 1626 aa42.82■■■■■ 4.45
FRMD4B-209ENST00000473188 SYNJ1O43426 1573 aa42.82■■■■■ 4.44
FRMD4B-209ENST00000473188 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.81■■■■■ 4.44
FRMD4B-209ENST00000473188 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.81■■■■■ 4.44
FRMD4B-209ENST00000473188 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
FRMD4B-209ENST00000473188 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.74■■■■■ 4.43
FRMD4B-209ENST00000473188 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.74■■■■■ 4.43
FRMD4B-209ENST00000473188 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.74■■■■■ 4.43
FRMD4B-209ENST00000473188 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
FRMD4B-209ENST00000473188 PBRM1Q86U86 1689 aa42.71■■■■■ 4.43
FRMD4B-209ENST00000473188 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.7■■■■■ 4.43
FRMD4B-209ENST00000473188 ARHGEF11O15085 1522 aa42.67■■■■■ 4.42
FRMD4B-209ENST00000473188 SYNJ2O15056 1496 aa42.63■■■■■ 4.42
FRMD4B-209ENST00000473188 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.46■■■■■ 4.39
FRMD4B-209ENST00000473188 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.39■■■■■ 4.38
FRMD4B-209ENST00000473188 ADAMTS12P58397 1594 aa42.35■■■■■ 4.37
FRMD4B-209ENST00000473188 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.3■■■■■ 4.36
FRMD4B-209ENST00000473188 GRIN2AQ12879 1464 aa42.3■■■■■ 4.36
FRMD4B-209ENST00000473188 ARAP1Q96P48 1450 aa42.3■■■■■ 4.36
FRMD4B-209ENST00000473188 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.28■■■■■ 4.36
FRMD4B-209ENST00000473188 NUP160Q12769 1436 aa42.13■■■■■ 4.34
FRMD4B-209ENST00000473188 CEP170Q5SW79 1584 aa42.12■■■■■ 4.33
FRMD4B-209ENST00000473188 KIF27Q86VH2 1401 aa42.04■■■■■ 4.32
FRMD4B-209ENST00000473188 IGF1RP08069 1367 aa41.97■■■■■ 4.31
FRMD4B-209ENST00000473188 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.89■■■■■ 4.3
FRMD4B-209ENST00000473188 SHROOM2Q13796 1616 aa41.84■■■■■ 4.29
FRMD4B-209ENST00000473188 CUL7Q14999 1698 aa41.8■■■■■ 4.28
FRMD4B-209ENST00000473188 JPH4Q96JJ6 628 aa41.76■■■■■ 4.28
FRMD4B-209ENST00000473188 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 235.6 ms