RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473100.1

TNNT3-212, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

TSL 3

Gene TNNT3, Length 334 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-212ENST00000473100 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.78■■■■□ 3.96
TNNT3-212ENST00000473100 ABCC9O60706 1549 aa35.64■■■■□ 3.3
TNNT3-212ENST00000473100 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.6■■■■□ 3.29
TNNT3-212ENST00000473100 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.87■■■■□ 3.01
TNNT3-212ENST00000473100 NACADO15069 1562 aa33.67■■■□□ 2.98
TNNT3-212ENST00000473100 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.54■■■□□ 2.96
TNNT3-212ENST00000473100 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.5■■■□□ 2.95
TNNT3-212ENST00000473100 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.24■■■□□ 2.91
TNNT3-212ENST00000473100 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.23■■■□□ 2.91
TNNT3-212ENST00000473100 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.16■■■□□ 2.9
TNNT3-212ENST00000473100 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.01■■■□□ 2.88
TNNT3-212ENST00000473100 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
TNNT3-212ENST00000473100 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.84■■■□□ 2.85
TNNT3-212ENST00000473100 SCRIBQ14160 1630 aa32.48■■■□□ 2.79
TNNT3-212ENST00000473100 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.42■■■□□ 2.78
TNNT3-212ENST00000473100 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.18■■■□□ 2.74
TNNT3-212ENST00000473100 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
TNNT3-212ENST00000473100 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.08■■■□□ 2.73
TNNT3-212ENST00000473100 NCAPD3P42695 1498 aa31.14■■■□□ 2.58
TNNT3-212ENST00000473100 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.06■■■□□ 2.56
TNNT3-212ENST00000473100 SMARCA4P51532 1647 aa31■■■□□ 2.55
TNNT3-212ENST00000473100 SMARCA2P51531 1590 aa30.88■■■□□ 2.53
TNNT3-212ENST00000473100 HMGXB3Q12766 1538 aa30.86■■■□□ 2.53
TNNT3-212ENST00000473100 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
TNNT3-212ENST00000473100 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.71■■■□□ 2.51
TNNT3-212ENST00000473100 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.69■■■□□ 2.5
TNNT3-212ENST00000473100 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
TNNT3-212ENST00000473100 NESP48681 1621 aa30.68■■■□□ 2.5
TNNT3-212ENST00000473100 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.67■■■□□ 2.5
TNNT3-212ENST00000473100 ERCC6Q03468 1493 aa30.67■■■□□ 2.5
TNNT3-212ENST00000473100 CUX2O14529 1486 aa30.64■■■□□ 2.5
TNNT3-212ENST00000473100 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.37■■■□□ 2.45
TNNT3-212ENST00000473100 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
TNNT3-212ENST00000473100 WIZO95785 1651 aa30.3■■■□□ 2.44
TNNT3-212ENST00000473100 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.2■■■□□ 2.43
TNNT3-212ENST00000473100 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.18■■■□□ 2.42
TNNT3-212ENST00000473100 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.17■■■□□ 2.42
TNNT3-212ENST00000473100 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
TNNT3-212ENST00000473100 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.94■■■□□ 2.38
TNNT3-212ENST00000473100 WDR62O43379 1518 aa29.89■■■□□ 2.38
TNNT3-212ENST00000473100 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
TNNT3-212ENST00000473100 CFTRP13569 1480 aa29.86■■■□□ 2.37
TNNT3-212ENST00000473100 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.82■■■□□ 2.36
TNNT3-212ENST00000473100 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.81■■■□□ 2.36
TNNT3-212ENST00000473100 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
TNNT3-212ENST00000473100 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.59■■■□□ 2.33
TNNT3-212ENST00000473100 PRDM2Q13029 1718 aa29.45■■■□□ 2.3
TNNT3-212ENST00000473100 TOPBP1Q92547 1522 aa29.28■■■□□ 2.28
TNNT3-212ENST00000473100 TRIM41Q8WV44 630 aa29.27■■■□□ 2.28
TNNT3-212ENST00000473100 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
TNNT3-212ENST00000473100 OSCARQ8IYS5 282 aa29.26■■■□□ 2.27
TNNT3-212ENST00000473100 IFT140Q96RY7 1462 aa29.23■■■□□ 2.27
TNNT3-212ENST00000473100 ABCC8Q09428 1581 aa29.13■■■□□ 2.25
TNNT3-212ENST00000473100 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.13■■■□□ 2.25
TNNT3-212ENST00000473100 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
TNNT3-212ENST00000473100 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
TNNT3-212ENST00000473100 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
TNNT3-212ENST00000473100 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
TNNT3-212ENST00000473100 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.91■■■□□ 2.22
TNNT3-212ENST00000473100 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.91■■■□□ 2.22
TNNT3-212ENST00000473100 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.91■■■□□ 2.22
TNNT3-212ENST00000473100 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.91■■■□□ 2.22
TNNT3-212ENST00000473100 SOGA1O94964 1423 aa28.84■■■□□ 2.21
TNNT3-212ENST00000473100 ARHGEF11O15085 1522 aa28.82■■■□□ 2.2
TNNT3-212ENST00000473100 CUX1P39880 1505 aa28.82■■■□□ 2.2
TNNT3-212ENST00000473100 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
TNNT3-212ENST00000473100 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.8■■■□□ 2.2
TNNT3-212ENST00000473100 CHD1O14646 1710 aa28.8■■■□□ 2.2
TNNT3-212ENST00000473100 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
TNNT3-212ENST00000473100 FBLN2P98095 1184 aa28.7■■■□□ 2.18
TNNT3-212ENST00000473100 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.65■■■□□ 2.18
TNNT3-212ENST00000473100 WDR97A6NE52 1622 aa28.64■■■□□ 2.18
TNNT3-212ENST00000473100 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.61■■■□□ 2.17
TNNT3-212ENST00000473100 ARAP1Q96P48 1450 aa28.57■■■□□ 2.16
TNNT3-212ENST00000473100 GRIN2BQ13224 1484 aa28.56■■■□□ 2.16
TNNT3-212ENST00000473100 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
TNNT3-212ENST00000473100 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.52■■■□□ 2.16
TNNT3-212ENST00000473100 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
TNNT3-212ENST00000473100 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.47■■■□□ 2.15
TNNT3-212ENST00000473100 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.47■■■□□ 2.15
TNNT3-212ENST00000473100 SYNJ2O15056 1496 aa28.46■■■□□ 2.15
TNNT3-212ENST00000473100 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.43■■■□□ 2.14
TNNT3-212ENST00000473100 PBRM1Q86U86 1689 aa28.43■■■□□ 2.14
TNNT3-212ENST00000473100 SYNJ1O43426 1573 aa28.41■■■□□ 2.14
TNNT3-212ENST00000473100 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.13
TNNT3-212ENST00000473100 TOP2BQ02880 1626 aa28.32■■■□□ 2.12
TNNT3-212ENST00000473100 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.32■■■□□ 2.12
TNNT3-212ENST00000473100 GRIN2AQ12879 1464 aa28.21■■■□□ 2.11
TNNT3-212ENST00000473100 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
TNNT3-212ENST00000473100 ADAMTS12P58397 1594 aa28.2■■■□□ 2.1
TNNT3-212ENST00000473100 NUP160Q12769 1436 aa28.14■■■□□ 2.1
TNNT3-212ENST00000473100 CEP170Q5SW79 1584 aa28.14■■■□□ 2.1
TNNT3-212ENST00000473100 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.14■■■□□ 2.1
TNNT3-212ENST00000473100 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.11■■■□□ 2.09
TNNT3-212ENST00000473100 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.08■■■□□ 2.09
TNNT3-212ENST00000473100 SHROOM2Q13796 1616 aa28■■■□□ 2.07
TNNT3-212ENST00000473100 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
TNNT3-212ENST00000473100 JPH4Q96JJ6 628 aa27.84■■■□□ 2.05
TNNT3-212ENST00000473100 IGF1RP08069 1367 aa27.82■■■□□ 2.04
TNNT3-212ENST00000473100 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.8■■■□□ 2.04
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