RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472908.1

CSAD-212, Transcript of cysteine sulfinic acid decarboxylase, humanhuman

TSL 4

Gene CSAD, Length 543 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAD-212ENST00000472908 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.01■■■■□ 3.84
CSAD-212ENST00000472908 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.8■■■■□ 3.16
CSAD-212ENST00000472908 ABCC9O60706 1549 aa34.4■■■■□ 3.1
CSAD-212ENST00000472908 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.93■■■□□ 2.86
CSAD-212ENST00000472908 NACADO15069 1562 aa32.82■■■□□ 2.84
CSAD-212ENST00000472908 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.81■■■□□ 2.84
CSAD-212ENST00000472908 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.51■■■□□ 2.79
CSAD-212ENST00000472908 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
CSAD-212ENST00000472908 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.25■■■□□ 2.75
CSAD-212ENST00000472908 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.2■■■□□ 2.75
CSAD-212ENST00000472908 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.13■■■□□ 2.73
CSAD-212ENST00000472908 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.96■■■□□ 2.71
CSAD-212ENST00000472908 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.95■■■□□ 2.71
CSAD-212ENST00000472908 SCRIBQ14160 1630 aa31.72■■■□□ 2.67
CSAD-212ENST00000472908 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.55■■■□□ 2.64
CSAD-212ENST00000472908 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
CSAD-212ENST00000472908 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.09■■■□□ 2.57
CSAD-212ENST00000472908 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.95■■■□□ 2.54
CSAD-212ENST00000472908 SMARCA4P51532 1647 aa30.33■■■□□ 2.45
CSAD-212ENST00000472908 NCAPD3P42695 1498 aa30.31■■■□□ 2.44
CSAD-212ENST00000472908 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.25■■■□□ 2.43
CSAD-212ENST00000472908 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
CSAD-212ENST00000472908 SMARCA2P51531 1590 aa30.2■■■□□ 2.42
CSAD-212ENST00000472908 HMGXB3Q12766 1538 aa30.08■■■□□ 2.41
CSAD-212ENST00000472908 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.06■■■□□ 2.4
CSAD-212ENST00000472908 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.03■■■□□ 2.4
CSAD-212ENST00000472908 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CSAD-212ENST00000472908 WIZO95785 1651 aa29.72■■■□□ 2.35
CSAD-212ENST00000472908 NESP48681 1621 aa29.67■■■□□ 2.34
CSAD-212ENST00000472908 ERCC6Q03468 1493 aa29.66■■■□□ 2.34
CSAD-212ENST00000472908 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
CSAD-212ENST00000472908 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.54■■■□□ 2.32
CSAD-212ENST00000472908 CUX2O14529 1486 aa29.46■■■□□ 2.31
CSAD-212ENST00000472908 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.41■■■□□ 2.3
CSAD-212ENST00000472908 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.37■■■□□ 2.29
CSAD-212ENST00000472908 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CSAD-212ENST00000472908 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.3■■■□□ 2.28
CSAD-212ENST00000472908 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CSAD-212ENST00000472908 CFTRP13569 1480 aa29.15■■■□□ 2.26
CSAD-212ENST00000472908 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.06■■■□□ 2.24
CSAD-212ENST00000472908 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.06■■■□□ 2.24
CSAD-212ENST00000472908 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.05■■■□□ 2.24
CSAD-212ENST00000472908 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.04■■■□□ 2.24
CSAD-212ENST00000472908 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.04■■■□□ 2.24
CSAD-212ENST00000472908 WDR62O43379 1518 aa28.96■■■□□ 2.23
CSAD-212ENST00000472908 PRDM2Q13029 1718 aa28.89■■■□□ 2.21
CSAD-212ENST00000472908 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CSAD-212ENST00000472908 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CSAD-212ENST00000472908 ABCC8Q09428 1581 aa28.55■■■□□ 2.16
CSAD-212ENST00000472908 TOPBP1Q92547 1522 aa28.55■■■□□ 2.16
CSAD-212ENST00000472908 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.47■■■□□ 2.15
CSAD-212ENST00000472908 IFT140Q96RY7 1462 aa28.45■■■□□ 2.14
CSAD-212ENST00000472908 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CSAD-212ENST00000472908 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CSAD-212ENST00000472908 OSCARQ8IYS5 282 aa28.27■■■□□ 2.12
CSAD-212ENST00000472908 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CSAD-212ENST00000472908 CUX1P39880 1505 aa28.21■■■□□ 2.11
CSAD-212ENST00000472908 SOGA1O94964 1423 aa28.2■■■□□ 2.11
CSAD-212ENST00000472908 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
CSAD-212ENST00000472908 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.14e-33■■■■■ 46.8
CSAD-212ENST00000472908 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.18■■■□□ 2.1
CSAD-212ENST00000472908 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.16■■■□□ 2.1
CSAD-212ENST00000472908 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CSAD-212ENST00000472908 WDR97A6NE52 1622 aa28■■■□□ 2.07
CSAD-212ENST00000472908 CHD1O14646 1710 aa27.93■■■□□ 2.06
CSAD-212ENST00000472908 FBLN2P98095 1184 aa27.93■■■□□ 2.06
CSAD-212ENST00000472908 TRIM41Q8WV44 630 aa27.91■■■□□ 2.06
CSAD-212ENST00000472908 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.06
CSAD-212ENST00000472908 TOP2BQ02880 1626 aa27.88■■■□□ 2.05
CSAD-212ENST00000472908 GRIN2BQ13224 1484 aa27.88■■■□□ 2.05
CSAD-212ENST00000472908 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.87■■■□□ 2.05
CSAD-212ENST00000472908 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.87■■■□□ 2.05
CSAD-212ENST00000472908 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.87■■■□□ 2.05
CSAD-212ENST00000472908 SYNJ1O43426 1573 aa27.85■■■□□ 2.05
CSAD-212ENST00000472908 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.84■■■□□ 2.05
CSAD-212ENST00000472908 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.04
CSAD-212ENST00000472908 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
CSAD-212ENST00000472908 PBRM1Q86U86 1689 aa27.78■■■□□ 2.04
CSAD-212ENST00000472908 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.78■■■□□ 2.04
CSAD-212ENST00000472908 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.78■■■□□ 2.04
CSAD-212ENST00000472908 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.78■■■□□ 2.04
CSAD-212ENST00000472908 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.78■■■□□ 2.04
CSAD-212ENST00000472908 SYNJ2O15056 1496 aa27.73■■■□□ 2.03
CSAD-212ENST00000472908 ARHGEF11O15085 1522 aa27.72■■■□□ 2.03
CSAD-212ENST00000472908 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.61■■■□□ 2.01
CSAD-212ENST00000472908 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.57■■■□□ 2
CSAD-212ENST00000472908 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.54■■■□□ 2
CSAD-212ENST00000472908 ADAMTS12P58397 1594 aa27.52■■■□□ 2
CSAD-212ENST00000472908 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.51■■□□□ 1.99
CSAD-212ENST00000472908 GRIN2AQ12879 1464 aa27.51■■□□□ 1.99
CSAD-212ENST00000472908 ARAP1Q96P48 1450 aa27.48■■□□□ 1.99
CSAD-212ENST00000472908 NUP160Q12769 1436 aa27.41■■□□□ 1.98
CSAD-212ENST00000472908 CEP170Q5SW79 1584 aa27.38■■□□□ 1.97
CSAD-212ENST00000472908 KIF27Q86VH2 1401 aa27.36■■□□□ 1.97
CSAD-212ENST00000472908 IGF1RP08069 1367 aa27.33■■□□□ 1.97
CSAD-212ENST00000472908 SHROOM2Q13796 1616 aa27.23■■□□□ 1.95
CSAD-212ENST00000472908 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.22■■□□□ 1.95
CSAD-212ENST00000472908 CUL7Q14999 1698 aa27.21■■□□□ 1.95
CSAD-212ENST00000472908 JPH4Q96JJ6 628 aa27.19■■□□□ 1.94
CSAD-212ENST00000472908 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms