RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472885.1

SIAH2-202, Transcript of siah E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 4

Gene SIAH2, Length 452 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2-202ENST00000472885 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.35■■■■■ 4.53
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SIAH2-202ENST00000472885 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.83■■■■□ 3.49
SIAH2-202ENST00000472885 NACADO15069 1562 aa36.62■■■■□ 3.45
SIAH2-202ENST00000472885 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.56■■■■□ 3.44
SIAH2-202ENST00000472885 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.18■■■■□ 3.38
SIAH2-202ENST00000472885 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36■■■■□ 3.35
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SIAH2-202ENST00000472885 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.99■■■■□ 3.35
SIAH2-202ENST00000472885 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
SIAH2-202ENST00000472885 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.81■■■■□ 3.32
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SIAH2-202ENST00000472885 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.27■■■■□ 3.24
SIAH2-202ENST00000472885 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.87■■■■□ 3.17
SIAH2-202ENST00000472885 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
SIAH2-202ENST00000472885 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.74■■■■□ 3.15
SIAH2-202ENST00000472885 NCAPD3P42695 1498 aa33.81■■■■□ 3
SIAH2-202ENST00000472885 SMARCA4P51532 1647 aa33.76■■■■□ 3
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SIAH2-202ENST00000472885 SMARCA2P51531 1590 aa33.67■■■□□ 2.98
SIAH2-202ENST00000472885 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
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SIAH2-202ENST00000472885 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.42■■■□□ 2.94
SIAH2-202ENST00000472885 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.41■■■□□ 2.94
SIAH2-202ENST00000472885 ERCC6Q03468 1493 aa33.31■■■□□ 2.92
SIAH2-202ENST00000472885 NESP48681 1621 aa33.22■■■□□ 2.91
SIAH2-202ENST00000472885 CUX2O14529 1486 aa33.16■■■□□ 2.9
SIAH2-202ENST00000472885 WIZO95785 1651 aa33.03■■■□□ 2.88
SIAH2-202ENST00000472885 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.01■■■□□ 2.88
SIAH2-202ENST00000472885 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.95■■■□□ 2.87
SIAH2-202ENST00000472885 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.84■■■□□ 2.85
SIAH2-202ENST00000472885 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.82■■■□□ 2.84
SIAH2-202ENST00000472885 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
SIAH2-202ENST00000472885 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
SIAH2-202ENST00000472885 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.78■■■□□ 2.84
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SIAH2-202ENST00000472885 CFTRP13569 1480 aa32.48■■■□□ 2.79
SIAH2-202ENST00000472885 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.45■■■□□ 2.79
SIAH2-202ENST00000472885 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.43■■■□□ 2.78
SIAH2-202ENST00000472885 WDR62O43379 1518 aa32.42■■■□□ 2.78
SIAH2-202ENST00000472885 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.25■■■□□ 2.75
SIAH2-202ENST00000472885 PRDM2Q13029 1718 aa32.16■■■□□ 2.74
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SIAH2-202ENST00000472885 TOPBP1Q92547 1522 aa31.84■■■□□ 2.69
SIAH2-202ENST00000472885 ABCC8Q09428 1581 aa31.79■■■□□ 2.68
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SIAH2-202ENST00000472885 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.74■■■□□ 2.67
SIAH2-202ENST00000472885 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
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SIAH2-202ENST00000472885 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.37■■■□□ 2.61
SIAH2-202ENST00000472885 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
SIAH2-202ENST00000472885 CHD1O14646 1710 aa31.27■■■□□ 2.6
SIAH2-202ENST00000472885 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.25■■■□□ 2.59
SIAH2-202ENST00000472885 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.25■■■□□ 2.59
SIAH2-202ENST00000472885 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.25■■■□□ 2.59
SIAH2-202ENST00000472885 FBLN2P98095 1184 aa31.25■■■□□ 2.59
SIAH2-202ENST00000472885 WDR97A6NE52 1622 aa31.22■■■□□ 2.59
SIAH2-202ENST00000472885 ARHGEF11O15085 1522 aa31.18■■■□□ 2.58
SIAH2-202ENST00000472885 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.14■■■□□ 2.58
SIAH2-202ENST00000472885 GRIN2BQ13224 1484 aa31.1■■■□□ 2.57
SIAH2-202ENST00000472885 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
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SIAH2-202ENST00000472885 SYNJ2O15056 1496 aa30.96■■■□□ 2.55
SIAH2-202ENST00000472885 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.96■■■□□ 2.55
SIAH2-202ENST00000472885 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.94■■■□□ 2.54
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SIAH2-202ENST00000472885 SYNJ1O43426 1573 aa30.92■■■□□ 2.54
SIAH2-202ENST00000472885 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.92■■■□□ 2.54
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SIAH2-202ENST00000472885 ARAP1Q96P48 1450 aa30.89■■■□□ 2.53
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SIAH2-202ENST00000472885 GRIN2AQ12879 1464 aa30.7■■■□□ 2.5
SIAH2-202ENST00000472885 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.64■■■□□ 2.5
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SIAH2-202ENST00000472885 NUP160Q12769 1436 aa30.58■■■□□ 2.49
SIAH2-202ENST00000472885 CEP170Q5SW79 1584 aa30.57■■■□□ 2.48
SIAH2-202ENST00000472885 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
SIAH2-202ENST00000472885 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.45■■■□□ 2.47
SIAH2-202ENST00000472885 SHROOM2Q13796 1616 aa30.4■■■□□ 2.46
SIAH2-202ENST00000472885 KIF27Q86VH2 1401 aa30.35■■■□□ 2.45
SIAH2-202ENST00000472885 IGF1RP08069 1367 aa30.31■■■□□ 2.44
SIAH2-202ENST00000472885 JPH4Q96JJ6 628 aa30.31■■■□□ 2.44
SIAH2-202ENST00000472885 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
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