RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472084.2

MTSS1-204, Transcript of MTSS1, I-BAR domain containing, humanhuman

TSL 2

Gene MTSS1, Length 707 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1-204ENST00000472084 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.69■■■■□ 3.78
MTSS1-204ENST00000472084 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.6■■■■□ 3.13
MTSS1-204ENST00000472084 ABCC9O60706 1549 aa34.19■■■■□ 3.06
MTSS1-204ENST00000472084 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.79■■■□□ 2.84
MTSS1-204ENST00000472084 NACADO15069 1562 aa32.66■■■□□ 2.82
MTSS1-204ENST00000472084 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.54■■■□□ 2.8
MTSS1-204ENST00000472084 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.35■■■□□ 2.77
MTSS1-204ENST00000472084 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
MTSS1-204ENST00000472084 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.05■■■□□ 2.72
MTSS1-204ENST00000472084 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.87■■■□□ 2.69
MTSS1-204ENST00000472084 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.86■■■□□ 2.69
MTSS1-204ENST00000472084 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.68■■■□□ 2.66
MTSS1-204ENST00000472084 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.65■■■□□ 2.66
MTSS1-204ENST00000472084 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.51■■■□□ 2.63
MTSS1-204ENST00000472084 SCRIBQ14160 1630 aa31.49■■■□□ 2.63
MTSS1-204ENST00000472084 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
MTSS1-204ENST00000472084 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.91■■■□□ 2.54
MTSS1-204ENST00000472084 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.81■■■□□ 2.52
MTSS1-204ENST00000472084 NCAPD3P42695 1498 aa30.12■■■□□ 2.41
MTSS1-204ENST00000472084 SMARCA4P51532 1647 aa30.1■■■□□ 2.41
MTSS1-204ENST00000472084 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
MTSS1-204ENST00000472084 SMARCA2P51531 1590 aa30.05■■■□□ 2.4
MTSS1-204ENST00000472084 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.05■■■□□ 2.4
MTSS1-204ENST00000472084 HMGXB3Q12766 1538 aa29.94■■■□□ 2.38
MTSS1-204ENST00000472084 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.84■■■□□ 2.37
MTSS1-204ENST00000472084 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
MTSS1-204ENST00000472084 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.77■■■□□ 2.36
MTSS1-204ENST00000472084 ERCC6Q03468 1493 aa29.59■■■□□ 2.33
MTSS1-204ENST00000472084 NESP48681 1621 aa29.42■■■□□ 2.3
MTSS1-204ENST00000472084 CUX2O14529 1486 aa29.42■■■□□ 2.3
MTSS1-204ENST00000472084 WIZO95785 1651 aa29.4■■■□□ 2.3
MTSS1-204ENST00000472084 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.4■■■□□ 2.3
MTSS1-204ENST00000472084 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
MTSS1-204ENST00000472084 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.27■■■□□ 2.28
MTSS1-204ENST00000472084 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.23■■■□□ 2.27
MTSS1-204ENST00000472084 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
MTSS1-204ENST00000472084 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
MTSS1-204ENST00000472084 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.06■■■□□ 2.24
MTSS1-204ENST00000472084 CFTRP13569 1480 aa28.96■■■□□ 2.23
MTSS1-204ENST00000472084 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.94■■■□□ 2.22
MTSS1-204ENST00000472084 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.93■■■□□ 2.22
MTSS1-204ENST00000472084 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.91■■■□□ 2.22
MTSS1-204ENST00000472084 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.88■■■□□ 2.21
MTSS1-204ENST00000472084 WDR62O43379 1518 aa28.83■■■□□ 2.21
MTSS1-204ENST00000472084 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.78■■■□□ 2.2
MTSS1-204ENST00000472084 PRDM2Q13029 1718 aa28.65■■■□□ 2.18
MTSS1-204ENST00000472084 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
MTSS1-204ENST00000472084 ABCC8Q09428 1581 aa28.43■■■□□ 2.14
MTSS1-204ENST00000472084 TOPBP1Q92547 1522 aa28.35■■■□□ 2.13
MTSS1-204ENST00000472084 IFT140Q96RY7 1462 aa28.33■■■□□ 2.13
MTSS1-204ENST00000472084 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.31■■■□□ 2.12
MTSS1-204ENST00000472084 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
MTSS1-204ENST00000472084 OSCARQ8IYS5 282 aa28.14■■■□□ 2.1
MTSS1-204ENST00000472084 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
MTSS1-204ENST00000472084 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
MTSS1-204ENST00000472084 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
MTSS1-204ENST00000472084 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
MTSS1-204ENST00000472084 SOGA1O94964 1423 aa28.01■■■□□ 2.07
MTSS1-204ENST00000472084 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.96■■■□□ 2.07
MTSS1-204ENST00000472084 CUX1P39880 1505 aa27.96■■■□□ 2.07
MTSS1-204ENST00000472084 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.07
MTSS1-204ENST00000472084 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.93■■■□□ 2.06
MTSS1-204ENST00000472084 WDR97A6NE52 1622 aa27.91■■■□□ 2.06
MTSS1-204ENST00000472084 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
MTSS1-204ENST00000472084 TRIM41Q8WV44 630 aa27.81■■■□□ 2.04
MTSS1-204ENST00000472084 FBLN2P98095 1184 aa27.77■■■□□ 2.04
MTSS1-204ENST00000472084 GRIN2BQ13224 1484 aa27.73■■■□□ 2.03
MTSS1-204ENST00000472084 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
MTSS1-204ENST00000472084 CHD1O14646 1710 aa27.71■■■□□ 2.03
MTSS1-204ENST00000472084 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.03
MTSS1-204ENST00000472084 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.7■■■□□ 2.02
MTSS1-204ENST00000472084 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.69■■■□□ 2.02
MTSS1-204ENST00000472084 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.67■■■□□ 2.02
MTSS1-204ENST00000472084 TOP2BQ02880 1626 aa27.66■■■□□ 2.02
MTSS1-204ENST00000472084 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
MTSS1-204ENST00000472084 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.63■■■□□ 2.01
MTSS1-204ENST00000472084 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.63■■■□□ 2.01
MTSS1-204ENST00000472084 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.63■■■□□ 2.01
MTSS1-204ENST00000472084 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.63■■■□□ 2.01
MTSS1-204ENST00000472084 ARHGEF11O15085 1522 aa27.62■■■□□ 2.01
MTSS1-204ENST00000472084 SYNJ2O15056 1496 aa27.6■■■□□ 2.01
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MTSS1-204ENST00000472084 SYNJ1O43426 1573 aa27.57■■■□□ 2
MTSS1-204ENST00000472084 PBRM1Q86U86 1689 aa27.56■■■□□ 2
MTSS1-204ENST00000472084 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.45■■□□□ 1.98
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MTSS1-204ENST00000472084 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.38■■□□□ 1.97
MTSS1-204ENST00000472084 ADAMTS12P58397 1594 aa27.35■■□□□ 1.97
MTSS1-204ENST00000472084 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.35■■□□□ 1.97
MTSS1-204ENST00000472084 GRIN2AQ12879 1464 aa27.35■■□□□ 1.97
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MTSS1-204ENST00000472084 NUP160Q12769 1436 aa27.24■■□□□ 1.95
MTSS1-204ENST00000472084 KIF27Q86VH2 1401 aa27.19■■□□□ 1.94
MTSS1-204ENST00000472084 CEP170Q5SW79 1584 aa27.18■■□□□ 1.94
MTSS1-204ENST00000472084 IGF1RP08069 1367 aa27.07■■□□□ 1.92
MTSS1-204ENST00000472084 CUL7Q14999 1698 aa27.05■■□□□ 1.92
MTSS1-204ENST00000472084 SHROOM2Q13796 1616 aa27.05■■□□□ 1.92
MTSS1-204ENST00000472084 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
MTSS1-204ENST00000472084 JPH4Q96JJ6 628 aa26.98■■□□□ 1.91
MTSS1-204ENST00000472084 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.97■■□□□ 1.91
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