RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472075.1

LRRN1-202, Transcript of leucine rich repeat neuronal 1, humanhuman

TSL 5

Gene LRRN1, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1-202ENST00000472075 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.28■■■■■ 5.16
LRRN1-202ENST00000472075 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.28■■■■■ 4.36
LRRN1-202ENST00000472075 ABCC9O60706 1549 aa41.43■■■■■ 4.22
LRRN1-202ENST00000472075 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.84■■■■□ 3.97
LRRN1-202ENST00000472075 NACADO15069 1562 aa39.75■■■■□ 3.95
LRRN1-202ENST00000472075 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.45■■■■□ 3.91
LRRN1-202ENST00000472075 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.42■■■■□ 3.9
LRRN1-202ENST00000472075 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
LRRN1-202ENST00000472075 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.18■■■■□ 3.86
LRRN1-202ENST00000472075 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.01■■■■□ 3.84
LRRN1-202ENST00000472075 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.62■■■■□ 3.77
LRRN1-202ENST00000472075 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.59■■■■□ 3.77
LRRN1-202ENST00000472075 SCRIBQ14160 1630 aa38.43■■■■□ 3.74
LRRN1-202ENST00000472075 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.28■■■■□ 3.72
LRRN1-202ENST00000472075 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.17■■■■□ 3.7
LRRN1-202ENST00000472075 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
LRRN1-202ENST00000472075 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.53■■■■□ 3.6
LRRN1-202ENST00000472075 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.28■■■■□ 3.56
LRRN1-202ENST00000472075 SMARCA4P51532 1647 aa36.78■■■■□ 3.48
LRRN1-202ENST00000472075 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.46
LRRN1-202ENST00000472075 NCAPD3P42695 1498 aa36.62■■■■□ 3.45
LRRN1-202ENST00000472075 SMARCA2P51531 1590 aa36.6■■■■□ 3.45
LRRN1-202ENST00000472075 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.59■■■■□ 3.45
LRRN1-202ENST00000472075 HMGXB3Q12766 1538 aa36.48■■■■□ 3.43
LRRN1-202ENST00000472075 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.45■■■■□ 3.43
LRRN1-202ENST00000472075 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.4■■■■□ 3.42
LRRN1-202ENST00000472075 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
LRRN1-202ENST00000472075 WIZO95785 1651 aa36.03■■■■□ 3.36
LRRN1-202ENST00000472075 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
LRRN1-202ENST00000472075 NESP48681 1621 aa35.77■■■■□ 3.32
LRRN1-202ENST00000472075 ERCC6Q03468 1493 aa35.76■■■■□ 3.32
LRRN1-202ENST00000472075 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.75■■■■□ 3.31
LRRN1-202ENST00000472075 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
LRRN1-202ENST00000472075 CUX2O14529 1486 aa35.53■■■■□ 3.28
LRRN1-202ENST00000472075 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.51■■■■□ 3.27
LRRN1-202ENST00000472075 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.46■■■■□ 3.27
LRRN1-202ENST00000472075 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.46■■■■□ 3.27
LRRN1-202ENST00000472075 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
LRRN1-202ENST00000472075 CFTRP13569 1480 aa35.28■■■■□ 3.24
LRRN1-202ENST00000472075 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.17■■■■□ 3.22
LRRN1-202ENST00000472075 PRDM2Q13029 1718 aa35.17■■■■□ 3.22
LRRN1-202ENST00000472075 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.13■■■■□ 3.21
LRRN1-202ENST00000472075 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.12■■■■□ 3.21
LRRN1-202ENST00000472075 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.12■■■■□ 3.21
LRRN1-202ENST00000472075 WDR62O43379 1518 aa35.05■■■■□ 3.2
LRRN1-202ENST00000472075 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
LRRN1-202ENST00000472075 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
LRRN1-202ENST00000472075 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.64■■■■□ 3.14
LRRN1-202ENST00000472075 ABCC8Q09428 1581 aa34.57■■■■□ 3.12
LRRN1-202ENST00000472075 TOPBP1Q92547 1522 aa34.55■■■■□ 3.12
LRRN1-202ENST00000472075 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.52■■■■□ 3.12
LRRN1-202ENST00000472075 IFT140Q96RY7 1462 aa34.39■■■■□ 3.1
LRRN1-202ENST00000472075 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
LRRN1-202ENST00000472075 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
LRRN1-202ENST00000472075 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
LRRN1-202ENST00000472075 CUX1P39880 1505 aa34.18■■■■□ 3.06
LRRN1-202ENST00000472075 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
LRRN1-202ENST00000472075 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.1■■■■□ 3.05
LRRN1-202ENST00000472075 SOGA1O94964 1423 aa34.04■■■■□ 3.04
LRRN1-202ENST00000472075 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.03■■■■□ 3.04
LRRN1-202ENST00000472075 WDR97A6NE52 1622 aa34.01■■■■□ 3.04
LRRN1-202ENST00000472075 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.96■■■■□ 3.03
LRRN1-202ENST00000472075 OSCARQ8IYS5 282 aa33.91■■■■□ 3.02
LRRN1-202ENST00000472075 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.9■■■■□ 3.02
LRRN1-202ENST00000472075 TOP2BQ02880 1626 aa33.87■■■■□ 3.01
LRRN1-202ENST00000472075 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.85■■■■□ 3.01
LRRN1-202ENST00000472075 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
LRRN1-202ENST00000472075 SYNJ1O43426 1573 aa33.81■■■■□ 3
LRRN1-202ENST00000472075 CHD1O14646 1710 aa33.81■■■■□ 3
LRRN1-202ENST00000472075 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.79■■■■□ 3
LRRN1-202ENST00000472075 PBRM1Q86U86 1689 aa33.72■■■□□ 2.99
LRRN1-202ENST00000472075 GRIN2BQ13224 1484 aa33.72■■■□□ 2.99
LRRN1-202ENST00000472075 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.71■■■□□ 2.99
LRRN1-202ENST00000472075 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.69■■■□□ 2.98
LRRN1-202ENST00000472075 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
LRRN1-202ENST00000472075 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.68■■■□□ 2.98
LRRN1-202ENST00000472075 FBLN2P98095 1184 aa33.56■■■□□ 2.96
LRRN1-202ENST00000472075 SYNJ2O15056 1496 aa33.55■■■□□ 2.96
LRRN1-202ENST00000472075 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.49■■■□□ 2.95
LRRN1-202ENST00000472075 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.49■■■□□ 2.95
LRRN1-202ENST00000472075 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.49■■■□□ 2.95
LRRN1-202ENST00000472075 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
LRRN1-202ENST00000472075 ARHGEF11O15085 1522 aa33.43■■■□□ 2.94
LRRN1-202ENST00000472075 ADAMTS12P58397 1594 aa33.4■■■□□ 2.94
LRRN1-202ENST00000472075 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.4■■■□□ 2.94
LRRN1-202ENST00000472075 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.4■■■□□ 2.94
LRRN1-202ENST00000472075 TRIM41Q8WV44 630 aa33.32■■■□□ 2.92
LRRN1-202ENST00000472075 GRIN2AQ12879 1464 aa33.3■■■□□ 2.92
LRRN1-202ENST00000472075 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.28■■■□□ 2.92
LRRN1-202ENST00000472075 KIF27Q86VH2 1401 aa33.18■■■□□ 2.9
LRRN1-202ENST00000472075 NUP160Q12769 1436 aa33.16■■■□□ 2.9
LRRN1-202ENST00000472075 CEP170Q5SW79 1584 aa33.15■■■□□ 2.9
LRRN1-202ENST00000472075 ARAP1Q96P48 1450 aa33.13■■■□□ 2.89
LRRN1-202ENST00000472075 CUL7Q14999 1698 aa33.09■■■□□ 2.89
LRRN1-202ENST00000472075 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.03■■■□□ 2.88
LRRN1-202ENST00000472075 IGF1RP08069 1367 aa33.02■■■□□ 2.88
LRRN1-202ENST00000472075 SHROOM2Q13796 1616 aa33■■■□□ 2.87
LRRN1-202ENST00000472075 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.92■■■□□ 2.86
LRRN1-202ENST00000472075 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.85■■■□□ 2.85
LRRN1-202ENST00000472075 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.83■■■□□ 2.85
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