RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471664.1

GLIS3-210, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 1,569 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-210ENST00000471664 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.93■■■□□ 2.38
GLIS3-210ENST00000471664 ABCC9O60706 1549 aa27.35■■□□□ 1.97
GLIS3-210ENST00000471664 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.93■■□□□ 1.9
GLIS3-210ENST00000471664 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.03■■□□□ 1.76
GLIS3-210ENST00000471664 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.85■■□□□ 1.73
GLIS3-210ENST00000471664 NACADO15069 1562 aa25.58■■□□□ 1.69
GLIS3-210ENST00000471664 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.57■■□□□ 1.68
GLIS3-210ENST00000471664 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
GLIS3-210ENST00000471664 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.26■■□□□ 1.63
GLIS3-210ENST00000471664 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.11■■□□□ 1.61
GLIS3-210ENST00000471664 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.09■■□□□ 1.61
GLIS3-210ENST00000471664 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
GLIS3-210ENST00000471664 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.67■■□□□ 1.54
GLIS3-210ENST00000471664 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.67■■□□□ 1.54
GLIS3-210ENST00000471664 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.66■■□□□ 1.54
GLIS3-210ENST00000471664 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.66■■□□□ 1.54
GLIS3-210ENST00000471664 SCRIBQ14160 1630 aa24.58■■□□□ 1.53
GLIS3-210ENST00000471664 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
GLIS3-210ENST00000471664 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.13■■□□□ 1.45
GLIS3-210ENST00000471664 CUX2O14529 1486 aa23.67■■□□□ 1.38
GLIS3-210ENST00000471664 NCAPD3P42695 1498 aa23.64■■□□□ 1.38
GLIS3-210ENST00000471664 ERCC6Q03468 1493 aa23.64■■□□□ 1.38
GLIS3-210ENST00000471664 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.53■■□□□ 1.36
GLIS3-210ENST00000471664 SMARCA2P51531 1590 aa23.42■■□□□ 1.34
GLIS3-210ENST00000471664 NESP48681 1621 aa23.41■■□□□ 1.34
GLIS3-210ENST00000471664 SMARCA4P51532 1647 aa23.39■■□□□ 1.34
GLIS3-210ENST00000471664 HMGXB3Q12766 1538 aa23.38■■□□□ 1.33
GLIS3-210ENST00000471664 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GLIS3-210ENST00000471664 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GLIS3-210ENST00000471664 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
GLIS3-210ENST00000471664 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.15■■□□□ 1.3
GLIS3-210ENST00000471664 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.14■■□□□ 1.29
GLIS3-210ENST00000471664 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.07■■□□□ 1.28
GLIS3-210ENST00000471664 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.06■■□□□ 1.28
GLIS3-210ENST00000471664 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.06■■□□□ 1.28
GLIS3-210ENST00000471664 TRIM41Q8WV44 630 aa22.97■■□□□ 1.27
GLIS3-210ENST00000471664 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.94■■□□□ 1.26
GLIS3-210ENST00000471664 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.85■■□□□ 1.25
GLIS3-210ENST00000471664 WDR62O43379 1518 aa22.78■■□□□ 1.24
GLIS3-210ENST00000471664 WIZO95785 1651 aa22.78■■□□□ 1.24
GLIS3-210ENST00000471664 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.69■■□□□ 1.22
GLIS3-210ENST00000471664 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.66■■□□□ 1.22
GLIS3-210ENST00000471664 OSCARQ8IYS5 282 aa22.64■■□□□ 1.22
GLIS3-210ENST00000471664 CFTRP13569 1480 aa22.57■■□□□ 1.2
GLIS3-210ENST00000471664 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GLIS3-210ENST00000471664 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
GLIS3-210ENST00000471664 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
GLIS3-210ENST00000471664 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.29■■□□□ 1.16
GLIS3-210ENST00000471664 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.29■■□□□ 1.16
GLIS3-210ENST00000471664 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.29■■□□□ 1.16
GLIS3-210ENST00000471664 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
GLIS3-210ENST00000471664 PRDM2Q13029 1718 aa22.27■■□□□ 1.16
GLIS3-210ENST00000471664 IFT140Q96RY7 1462 aa22.26■■□□□ 1.15
GLIS3-210ENST00000471664 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.24■■□□□ 1.15
GLIS3-210ENST00000471664 ARHGEF11O15085 1522 aa22.18■■□□□ 1.14
GLIS3-210ENST00000471664 TOPBP1Q92547 1522 aa22.18■■□□□ 1.14
GLIS3-210ENST00000471664 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.16■■□□□ 1.14
GLIS3-210ENST00000471664 ABCC8Q09428 1581 aa22.12■■□□□ 1.13
GLIS3-210ENST00000471664 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GLIS3-210ENST00000471664 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
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GLIS3-210ENST00000471664 FBLN2P98095 1184 aa22.05■■□□□ 1.12
GLIS3-210ENST00000471664 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
GLIS3-210ENST00000471664 CHD1O14646 1710 aa22.01■■□□□ 1.11
GLIS3-210ENST00000471664 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
GLIS3-210ENST00000471664 ARAP1Q96P48 1450 aa21.94■■□□□ 1.1
GLIS3-210ENST00000471664 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GLIS3-210ENST00000471664 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.9■■□□□ 1.1
GLIS3-210ENST00000471664 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
GLIS3-210ENST00000471664 SOGA1O94964 1423 aa21.88■■□□□ 1.09
GLIS3-210ENST00000471664 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
GLIS3-210ENST00000471664 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.78■■□□□ 1.08
GLIS3-210ENST00000471664 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.75■■□□□ 1.07
GLIS3-210ENST00000471664 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.73■■□□□ 1.07
GLIS3-210ENST00000471664 WDR97A6NE52 1622 aa21.71■■□□□ 1.07
GLIS3-210ENST00000471664 SYNJ1O43426 1573 aa21.7■■□□□ 1.07
GLIS3-210ENST00000471664 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
GLIS3-210ENST00000471664 GRIN2BQ13224 1484 aa21.69■■□□□ 1.06
GLIS3-210ENST00000471664 CUX1P39880 1505 aa21.68■■□□□ 1.06
GLIS3-210ENST00000471664 SYNJ2O15056 1496 aa21.64■■□□□ 1.06
GLIS3-210ENST00000471664 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
GLIS3-210ENST00000471664 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.58■■□□□ 1.05
GLIS3-210ENST00000471664 PBRM1Q86U86 1689 aa21.55■■□□□ 1.04
GLIS3-210ENST00000471664 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.48■■□□□ 1.03
GLIS3-210ENST00000471664 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.44■■□□□ 1.02
GLIS3-210ENST00000471664 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.41■■□□□ 1.02
GLIS3-210ENST00000471664 GRIN2AQ12879 1464 aa21.39■■□□□ 1.01
GLIS3-210ENST00000471664 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
GLIS3-210ENST00000471664 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
GLIS3-210ENST00000471664 NUP160Q12769 1436 aa21.33■■□□□ 1.01
GLIS3-210ENST00000471664 CEP170Q5SW79 1584 aa21.33■■□□□ 1.01
GLIS3-210ENST00000471664 ADAMTS12P58397 1594 aa21.3■■□□□ 1
GLIS3-210ENST00000471664 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.29■■□□□ 1
GLIS3-210ENST00000471664 SHROOM2Q13796 1616 aa21.25■□□□□ 0.99
GLIS3-210ENST00000471664 TOP2BQ02880 1626 aa21.23■□□□□ 0.99
GLIS3-210ENST00000471664 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.21■□□□□ 0.99
GLIS3-210ENST00000471664 JPH4Q96JJ6 628 aa21.21■□□□□ 0.99
GLIS3-210ENST00000471664 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
GLIS3-210ENST00000471664 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.2■□□□□ 0.98
GLIS3-210ENST00000471664 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.17■□□□□ 0.98
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