RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470711.6

LMAN1L-204, Transcript of lectin, mannose binding 1 like, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMAN1L, Length 1,398 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1L-204ENST00000470711 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.42■■■■■ 5.5
LMAN1L-204ENST00000470711 ABCC9O60706 1549 aa44.45■■■■■ 4.71
LMAN1L-204ENST00000470711 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.29■■■■■ 4.68
LMAN1L-204ENST00000470711 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.21■■■■■ 4.35
LMAN1L-204ENST00000470711 NACADO15069 1562 aa41.92■■■■■ 4.3
LMAN1L-204ENST00000470711 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.86■■■■■ 4.29
LMAN1L-204ENST00000470711 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.81■■■■■ 4.28
LMAN1L-204ENST00000470711 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.44■■■■■ 4.22
LMAN1L-204ENST00000470711 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.31■■■■■ 4.2
LMAN1L-204ENST00000470711 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.29■■■■■ 4.2
LMAN1L-204ENST00000470711 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.05■■■■■ 4.16
LMAN1L-204ENST00000470711 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
LMAN1L-204ENST00000470711 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.77■■■■■ 4.12
LMAN1L-204ENST00000470711 SCRIBQ14160 1630 aa40.41■■■■■ 4.06
LMAN1L-204ENST00000470711 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.37■■■■■ 4.05
LMAN1L-204ENST00000470711 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.12■■■■■ 4.01
LMAN1L-204ENST00000470711 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.02■■■■■ 4
LMAN1L-204ENST00000470711 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
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LMAN1L-204ENST00000470711 SMARCA4P51532 1647 aa38.54■■■■□ 3.76
LMAN1L-204ENST00000470711 SMARCA2P51531 1590 aa38.45■■■■□ 3.75
LMAN1L-204ENST00000470711 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.4■■■■□ 3.74
LMAN1L-204ENST00000470711 HMGXB3Q12766 1538 aa38.39■■■■□ 3.74
LMAN1L-204ENST00000470711 ERCC6Q03468 1493 aa38.32■■■■□ 3.73
LMAN1L-204ENST00000470711 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.73
LMAN1L-204ENST00000470711 CUX2O14529 1486 aa38.27■■■■□ 3.72
LMAN1L-204ENST00000470711 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
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LMAN1L-204ENST00000470711 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.15■■■■□ 3.7
LMAN1L-204ENST00000470711 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.11■■■■□ 3.69
LMAN1L-204ENST00000470711 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.83■■■■□ 3.65
LMAN1L-204ENST00000470711 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
LMAN1L-204ENST00000470711 WIZO95785 1651 aa37.64■■■■□ 3.62
LMAN1L-204ENST00000470711 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.64■■■■□ 3.62
LMAN1L-204ENST00000470711 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.63■■■■□ 3.62
LMAN1L-204ENST00000470711 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.57■■■■□ 3.61
LMAN1L-204ENST00000470711 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.31■■■■□ 3.56
LMAN1L-204ENST00000470711 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
LMAN1L-204ENST00000470711 WDR62O43379 1518 aa37.21■■■■□ 3.55
LMAN1L-204ENST00000470711 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.14■■■■□ 3.54
LMAN1L-204ENST00000470711 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.13■■■■□ 3.53
LMAN1L-204ENST00000470711 CFTRP13569 1480 aa37.12■■■■□ 3.53
LMAN1L-204ENST00000470711 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
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LMAN1L-204ENST00000470711 TRIM41Q8WV44 630 aa36.69■■■■□ 3.46
LMAN1L-204ENST00000470711 PRDM2Q13029 1718 aa36.67■■■■□ 3.46
LMAN1L-204ENST00000470711 OSCARQ8IYS5 282 aa36.58■■■■□ 3.45
LMAN1L-204ENST00000470711 TOPBP1Q92547 1522 aa36.42■■■■□ 3.42
LMAN1L-204ENST00000470711 IFT140Q96RY7 1462 aa36.41■■■■□ 3.42
LMAN1L-204ENST00000470711 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
LMAN1L-204ENST00000470711 ABCC8Q09428 1581 aa36.29■■■■□ 3.4
LMAN1L-204ENST00000470711 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.25■■■■□ 3.39
LMAN1L-204ENST00000470711 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
LMAN1L-204ENST00000470711 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
LMAN1L-204ENST00000470711 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.09■■■■□ 3.37
LMAN1L-204ENST00000470711 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.07■■■■□ 3.37
LMAN1L-204ENST00000470711 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.07■■■■□ 3.37
LMAN1L-204ENST00000470711 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.07■■■■□ 3.37
LMAN1L-204ENST00000470711 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
LMAN1L-204ENST00000470711 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.97■■■■□ 3.35
LMAN1L-204ENST00000470711 ARHGEF11O15085 1522 aa35.95■■■■□ 3.35
LMAN1L-204ENST00000470711 SOGA1O94964 1423 aa35.91■■■■□ 3.34
LMAN1L-204ENST00000470711 CHD1O14646 1710 aa35.9■■■■□ 3.34
LMAN1L-204ENST00000470711 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
LMAN1L-204ENST00000470711 FBLN2P98095 1184 aa35.87■■■■□ 3.33
LMAN1L-204ENST00000470711 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.82■■■■□ 3.32
LMAN1L-204ENST00000470711 CUX1P39880 1505 aa35.79■■■■□ 3.32
LMAN1L-204ENST00000470711 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.76■■■■□ 3.31
LMAN1L-204ENST00000470711 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.68■■■■□ 3.3
LMAN1L-204ENST00000470711 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
LMAN1L-204ENST00000470711 WDR97A6NE52 1622 aa35.65■■■■□ 3.3
LMAN1L-204ENST00000470711 ARAP1Q96P48 1450 aa35.61■■■■□ 3.29
LMAN1L-204ENST00000470711 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
LMAN1L-204ENST00000470711 GRIN2BQ13224 1484 aa35.56■■■■□ 3.28
LMAN1L-204ENST00000470711 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
LMAN1L-204ENST00000470711 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.5■■■■□ 3.27
LMAN1L-204ENST00000470711 SYNJ2O15056 1496 aa35.44■■■■□ 3.26
LMAN1L-204ENST00000470711 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.44■■■■□ 3.26
LMAN1L-204ENST00000470711 SYNJ1O43426 1573 aa35.44■■■■□ 3.26
LMAN1L-204ENST00000470711 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.4■■■■□ 3.26
LMAN1L-204ENST00000470711 PBRM1Q86U86 1689 aa35.39■■■■□ 3.26
LMAN1L-204ENST00000470711 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
LMAN1L-204ENST00000470711 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.33■■■■□ 3.25
LMAN1L-204ENST00000470711 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.24■■■■□ 3.23
LMAN1L-204ENST00000470711 TOP2BQ02880 1626 aa35.16■■■■□ 3.22
LMAN1L-204ENST00000470711 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.16■■■■□ 3.22
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LMAN1L-204ENST00000470711 ADAMTS12P58397 1594 aa35.06■■■■□ 3.2
LMAN1L-204ENST00000470711 NUP160Q12769 1436 aa35■■■■□ 3.19
LMAN1L-204ENST00000470711 CEP170Q5SW79 1584 aa35■■■■□ 3.19
LMAN1L-204ENST00000470711 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35■■■■□ 3.19
LMAN1L-204ENST00000470711 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.99■■■■□ 3.19
LMAN1L-204ENST00000470711 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.93■■■■□ 3.18
LMAN1L-204ENST00000470711 SHROOM2Q13796 1616 aa34.84■■■■□ 3.17
LMAN1L-204ENST00000470711 JPH4Q96JJ6 628 aa34.7■■■■□ 3.15
LMAN1L-204ENST00000470711 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
LMAN1L-204ENST00000470711 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.56■■■■□ 3.12
LMAN1L-204ENST00000470711 IGF1RP08069 1367 aa34.56■■■■□ 3.12
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