RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470399.1

TTC19-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, humanhuman

TSL 5

Gene TTC19, Length 636 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19-204ENST00000470399 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.25■■■■■ 7.56
TTC19-204ENST00000470399 ABCC9O60706 1549 aa56.17■■■■■ 6.58
TTC19-204ENST00000470399 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.02■■■■■ 6.56
TTC19-204ENST00000470399 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.34■■■■■ 6.13
TTC19-204ENST00000470399 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.96■■■■■ 6.07
TTC19-204ENST00000470399 NACADO15069 1562 aa52.93■■■■■ 6.06
TTC19-204ENST00000470399 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.42■■■■■ 5.98
TTC19-204ENST00000470399 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.42■■■■■ 5.98
TTC19-204ENST00000470399 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.2■■■■■ 5.95
TTC19-204ENST00000470399 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.13■■■■■ 5.94
TTC19-204ENST00000470399 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.97■■■■■ 5.91
TTC19-204ENST00000470399 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.58■■■■■ 5.85
TTC19-204ENST00000470399 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.4■■■■■ 5.82
TTC19-204ENST00000470399 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.04■■■■■ 5.76
TTC19-204ENST00000470399 SCRIBQ14160 1630 aa51.02■■■■■ 5.76
TTC19-204ENST00000470399 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.8■■■■■ 5.72
TTC19-204ENST00000470399 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.61■■■■■ 5.69
TTC19-204ENST00000470399 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.59■■■■■ 5.69
TTC19-204ENST00000470399 NCAPD3P42695 1498 aa48.86■■■■■ 5.41
TTC19-204ENST00000470399 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.71■■■■■ 5.39
TTC19-204ENST00000470399 SMARCA4P51532 1647 aa48.67■■■■■ 5.38
TTC19-204ENST00000470399 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.66■■■■■ 5.38
TTC19-204ENST00000470399 HMGXB3Q12766 1538 aa48.52■■■■■ 5.36
TTC19-204ENST00000470399 SMARCA2P51531 1590 aa48.51■■■■■ 5.36
TTC19-204ENST00000470399 CUX2O14529 1486 aa48.46■■■■■ 5.35
TTC19-204ENST00000470399 ERCC6Q03468 1493 aa48.4■■■■■ 5.34
TTC19-204ENST00000470399 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.3■■■■■ 5.32
TTC19-204ENST00000470399 NESP48681 1621 aa48.26■■■■■ 5.32
TTC19-204ENST00000470399 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.19■■■■■ 5.31
TTC19-204ENST00000470399 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.16■■■■■ 5.3
TTC19-204ENST00000470399 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.01■■■■■ 5.28
TTC19-204ENST00000470399 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.87■■■■■ 5.25
TTC19-204ENST00000470399 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.81■■■■■ 5.24
TTC19-204ENST00000470399 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.71■■■■■ 5.23
TTC19-204ENST00000470399 WIZO95785 1651 aa47.48■■■■■ 5.19
TTC19-204ENST00000470399 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.43■■■■■ 5.18
TTC19-204ENST00000470399 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.32■■■■■ 5.17
TTC19-204ENST00000470399 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.13■■■■■ 5.13
TTC19-204ENST00000470399 WDR62O43379 1518 aa47.09■■■■■ 5.13
TTC19-204ENST00000470399 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.88■■■■■ 5.09
TTC19-204ENST00000470399 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.87■■■■■ 5.09
TTC19-204ENST00000470399 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.82■■■■■ 5.09
TTC19-204ENST00000470399 CFTRP13569 1480 aa46.79■■■■■ 5.08
TTC19-204ENST00000470399 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.78■■■■■ 5.08
TTC19-204ENST00000470399 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
TTC19-204ENST00000470399 PRDM2Q13029 1718 aa46.48■■■■■ 5.03
TTC19-204ENST00000470399 TRIM41Q8WV44 630 aa46.38■■■■■ 5.02
TTC19-204ENST00000470399 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.24■■■■■ 4.99
TTC19-204ENST00000470399 OSCARQ8IYS5 282 aa46.09■■■■■ 4.97
TTC19-204ENST00000470399 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.99■■■■■ 4.95
TTC19-204ENST00000470399 TOPBP1Q92547 1522 aa45.96■■■■■ 4.95
TTC19-204ENST00000470399 IFT140Q96RY7 1462 aa45.93■■■■■ 4.94
TTC19-204ENST00000470399 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.77■■■■■ 4.92
TTC19-204ENST00000470399 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.76■■■■■ 4.92
TTC19-204ENST00000470399 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.76■■■■■ 4.92
TTC19-204ENST00000470399 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.76■■■■■ 4.92
TTC19-204ENST00000470399 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.91
TTC19-204ENST00000470399 ABCC8Q09428 1581 aa45.71■■■■■ 4.91
TTC19-204ENST00000470399 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.64■■■■■ 4.9
TTC19-204ENST00000470399 ARHGEF11O15085 1522 aa45.53■■■■■ 4.88
TTC19-204ENST00000470399 CHD1O14646 1710 aa45.52■■■■■ 4.88
TTC19-204ENST00000470399 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.49■■■■■ 4.872e-8■■■□□ 18.9
TTC19-204ENST00000470399 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.48■■■■■ 4.87
TTC19-204ENST00000470399 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.32■■■■■ 4.85
TTC19-204ENST00000470399 SOGA1O94964 1423 aa45.17■■■■■ 4.82
TTC19-204ENST00000470399 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.15■■■■■ 4.82
TTC19-204ENST00000470399 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
TTC19-204ENST00000470399 CUX1P39880 1505 aa45.12■■■■■ 4.81
TTC19-204ENST00000470399 ARAP1Q96P48 1450 aa45.1■■■■■ 4.81
TTC19-204ENST00000470399 FBLN2P98095 1184 aa45.07■■■■■ 4.81
TTC19-204ENST00000470399 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.07■■■■■ 4.81
TTC19-204ENST00000470399 WDR97A6NE52 1622 aa45.05■■■■■ 4.8
TTC19-204ENST00000470399 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.03■■■■■ 4.8
TTC19-204ENST00000470399 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.93■■■■■ 4.78
TTC19-204ENST00000470399 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.85■■■■■ 4.77
TTC19-204ENST00000470399 GRIN2BQ13224 1484 aa44.81■■■■■ 4.76
TTC19-204ENST00000470399 PBRM1Q86U86 1689 aa44.8■■■■■ 4.76
TTC19-204ENST00000470399 SYNJ1O43426 1573 aa44.77■■■■■ 4.76
TTC19-204ENST00000470399 SYNJ2O15056 1496 aa44.72■■■■■ 4.75
TTC19-204ENST00000470399 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.7■■■■■ 4.75
TTC19-204ENST00000470399 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.65■■■■■ 4.74
TTC19-204ENST00000470399 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.64■■■■■ 4.74
TTC19-204ENST00000470399 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.61■■■■■ 4.73
TTC19-204ENST00000470399 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.57■■■■■ 4.73
TTC19-204ENST00000470399 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
TTC19-204ENST00000470399 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.38■■■■■ 4.69
TTC19-204ENST00000470399 TOP2BQ02880 1626 aa44.32■■■■■ 4.68
TTC19-204ENST00000470399 ADAMTS12P58397 1594 aa44.31■■■■■ 4.68
TTC19-204ENST00000470399 GRIN2AQ12879 1464 aa44.28■■■■■ 4.68
TTC19-204ENST00000470399 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.28■■■■■ 4.68
TTC19-204ENST00000470399 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.27■■■■■ 4.68
TTC19-204ENST00000470399 CEP170Q5SW79 1584 aa44.23■■■■■ 4.67
TTC19-204ENST00000470399 NUP160Q12769 1436 aa44.16■■■■■ 4.66
TTC19-204ENST00000470399 SHROOM2Q13796 1616 aa44.1■■■■■ 4.65
TTC19-204ENST00000470399 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.04■■■■■ 4.64
TTC19-204ENST00000470399 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.03■■■■■ 4.64
TTC19-204ENST00000470399 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.7■■■■■ 4.59
TTC19-204ENST00000470399 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.69■■■■■ 4.58
TTC19-204ENST00000470399 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.58
TTC19-204ENST00000470399 JPH4Q96JJ6 628 aa43.59■■■■■ 4.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.4 ms