RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470383.1

GALE-212, Transcript of UDP-galactose-4-epimerase, humanhuman

TSL 2

Gene GALE, Length 2,073 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALE-212ENST00000470383 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.87■■■■■ 7.18
GALE-212ENST00000470383 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.31■■■■■ 5.97
GALE-212ENST00000470383 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.25■■■■■ 5.63
GALE-212ENST00000470383 ABCC9O60706 1549 aa49.8■■■■■ 5.56
GALE-212ENST00000470383 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.66■■■■■ 5.54
GALE-212ENST00000470383 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.43■■■■■ 5.5
GALE-212ENST00000470383 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.92■■■■■ 5.42
GALE-212ENST00000470383 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.81■■■■■ 5.4
GALE-212ENST00000470383 NACADO15069 1562 aa48.76■■■■■ 5.4
GALE-212ENST00000470383 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.44■■■■■ 5.34
GALE-212ENST00000470383 SCRIBQ14160 1630 aa48.18■■■■■ 5.3
GALE-212ENST00000470383 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.58■■■■■ 5.21
GALE-212ENST00000470383 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.02■■■■■ 5.12
GALE-212ENST00000470383 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.93■■■■■ 5.1
GALE-212ENST00000470383 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.81■■■■■ 5.08
GALE-212ENST00000470383 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.6■■■■■ 5.05
GALE-212ENST00000470383 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.37■■■■■ 5.01
GALE-212ENST00000470383 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.29■■■■■ 5
GALE-212ENST00000470383 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.25■■■■■ 4.99
GALE-212ENST00000470383 SMARCA4P51532 1647 aa46.11■■■■■ 4.97
GALE-212ENST00000470383 WIZO95785 1651 aa45.94■■■■■ 4.95
GALE-212ENST00000470383 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.89
GALE-212ENST00000470383 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.5■■■■■ 4.87
GALE-212ENST00000470383 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.39■■■■■ 4.86
GALE-212ENST00000470383 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.38■■■■■ 4.85
GALE-212ENST00000470383 SMARCA2P51531 1590 aa45.34■■■■■ 4.85
GALE-212ENST00000470383 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
GALE-212ENST00000470383 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.04■■■■■ 4.8
GALE-212ENST00000470383 NCAPD3P42695 1498 aa45■■■■■ 4.79
GALE-212ENST00000470383 HMGXB3Q12766 1538 aa44.94■■■■■ 4.78
GALE-212ENST00000470383 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.93■■■■■ 4.78
GALE-212ENST00000470383 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.6■■■■■ 4.73
GALE-212ENST00000470383 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.15■■■■■ 4.66
GALE-212ENST00000470383 ABCC8Q09428 1581 aa43.99■■■■■ 4.63
GALE-212ENST00000470383 TRIM41Q8WV44 630 aa43.97■■■■■ 4.63
GALE-212ENST00000470383 CFTRP13569 1480 aa43.96■■■■■ 4.63
GALE-212ENST00000470383 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.86■■■■■ 4.61
GALE-212ENST00000470383 PRDM2Q13029 1718 aa43.78■■■■■ 4.6
GALE-212ENST00000470383 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.66■■■■■ 4.58
GALE-212ENST00000470383 NESP48681 1621 aa43.66■■■■■ 4.58
GALE-212ENST00000470383 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.54■■■■■ 4.56
GALE-212ENST00000470383 SYNJ1O43426 1573 aa43.53■■■■■ 4.56
GALE-212ENST00000470383 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.41■■■■■ 4.54
GALE-212ENST00000470383 TOP2BQ02880 1626 aa43.33■■■■■ 4.53
GALE-212ENST00000470383 CUX1P39880 1505 aa43.3■■■■■ 4.52
GALE-212ENST00000470383 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.29■■■■■ 4.52
GALE-212ENST00000470383 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
GALE-212ENST00000470383 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.2■■■■■ 4.51
GALE-212ENST00000470383 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.16■■■■■ 4.5
GALE-212ENST00000470383 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.14■■■■■ 4.5
GALE-212ENST00000470383 SOGA1O94964 1423 aa43.08■■■■■ 4.49
GALE-212ENST00000470383 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.96■■■■■ 4.47
GALE-212ENST00000470383 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.96■■■■■ 4.47
GALE-212ENST00000470383 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.94■■■■■ 4.46
GALE-212ENST00000470383 TOPBP1Q92547 1522 aa42.91■■■■■ 4.46
GALE-212ENST00000470383 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
GALE-212ENST00000470383 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.87■■■■■ 4.45
GALE-212ENST00000470383 EEA1Q15075 1411 aa42.81■■■■■ 4.44
GALE-212ENST00000470383 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.72■■■■■ 4.43
GALE-212ENST00000470383 ERCC6Q03468 1493 aa42.71■■■■■ 4.43
GALE-212ENST00000470383 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
GALE-212ENST00000470383 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.68■■■■■ 4.42
GALE-212ENST00000470383 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.66■■■■■ 4.42
GALE-212ENST00000470383 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.58■■■■■ 4.41
GALE-212ENST00000470383 KIF27Q86VH2 1401 aa42.55■■■■■ 4.4
GALE-212ENST00000470383 CUX2O14529 1486 aa42.54■■■■■ 4.4
GALE-212ENST00000470383 WDR62O43379 1518 aa42.48■■■■■ 4.39
GALE-212ENST00000470383 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
GALE-212ENST00000470383 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.43■■■■■ 4.38
GALE-212ENST00000470383 WDR97A6NE52 1622 aa42.37■■■■■ 4.37
GALE-212ENST00000470383 KIF21BO75037 1637 aa42.34■■■■■ 4.37
GALE-212ENST00000470383 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
GALE-212ENST00000470383 GOLGA3Q08378 1498 aa42.27■■■■■ 4.36
GALE-212ENST00000470383 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.2■■■■■ 4.35
GALE-212ENST00000470383 IGF1RP08069 1367 aa42.2■■■■■ 4.35
GALE-212ENST00000470383 PRXQ9BXM0 1461 aa42.2■■■■■ 4.35
GALE-212ENST00000470383 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
GALE-212ENST00000470383 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
GALE-212ENST00000470383 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.15■■■■■ 4.34
GALE-212ENST00000470383 IFT140Q96RY7 1462 aa42.1■■■■■ 4.33
GALE-212ENST00000470383 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.08■■■■■ 4.33
GALE-212ENST00000470383 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.07■■■■■ 4.33
GALE-212ENST00000470383 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.07■■■■■ 4.32
GALE-212ENST00000470383 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42■■■■■ 4.31
GALE-212ENST00000470383 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
GALE-212ENST00000470383 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.97■■■■■ 4.311e-6■■■■□ 23.1
GALE-212ENST00000470383 CUL7Q14999 1698 aa41.91■■■■■ 4.3
GALE-212ENST00000470383 PBRM1Q86U86 1689 aa41.9■■■■■ 4.3
GALE-212ENST00000470383 CEP162Q5TB80 1403 aa41.89■■■■■ 4.3
GALE-212ENST00000470383 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
GALE-212ENST00000470383 GRIN2BQ13224 1484 aa41.75■■■■■ 4.27
GALE-212ENST00000470383 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
GALE-212ENST00000470383 ADAMTS12P58397 1594 aa41.62■■■■■ 4.25
GALE-212ENST00000470383 CLIP1P30622 1438 aa41.61■■■■■ 4.25
GALE-212ENST00000470383 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.57■■■■■ 4.25
GALE-212ENST00000470383 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.56■■■■■ 4.24
GALE-212ENST00000470383 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.47■■■■■ 4.23
GALE-212ENST00000470383 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
GALE-212ENST00000470383 SYNJ2O15056 1496 aa41.29■■■■■ 4.2
GALE-212ENST00000470383 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.29■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms