RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470048.1

DRC3-204, Transcript of dynein regulatory complex subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene DRC3, Length 805 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DRC3-204ENST00000470048 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.25■■■□□ 2.27
DRC3-204ENST00000470048 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.16■■□□□ 1.78
DRC3-204ENST00000470048 ABCC9O60706 1549 aa26.1■■□□□ 1.77
DRC3-204ENST00000470048 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.88■■□□□ 1.57
DRC3-204ENST00000470048 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.8■■□□□ 1.56
DRC3-204ENST00000470048 NACADO15069 1562 aa24.73■■□□□ 1.55
DRC3-204ENST00000470048 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.39■■□□□ 1.49
DRC3-204ENST00000470048 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.49
DRC3-204ENST00000470048 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.33■■□□□ 1.49
DRC3-204ENST00000470048 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.27■■□□□ 1.48
DRC3-204ENST00000470048 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
DRC3-204ENST00000470048 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.14■■□□□ 1.45
DRC3-204ENST00000470048 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.09■■□□□ 1.45
DRC3-204ENST00000470048 SCRIBQ14160 1630 aa23.9■■□□□ 1.42
DRC3-204ENST00000470048 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.79■■□□□ 1.4
DRC3-204ENST00000470048 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.55■■□□□ 1.36
DRC3-204ENST00000470048 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
DRC3-204ENST00000470048 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.49■■□□□ 1.35
DRC3-204ENST00000470048 NCAPD3P42695 1498 aa22.82■■□□□ 1.24
DRC3-204ENST00000470048 SMARCA4P51532 1647 aa22.79■■□□□ 1.24
DRC3-204ENST00000470048 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.78■■□□□ 1.24
DRC3-204ENST00000470048 SMARCA2P51531 1590 aa22.74■■□□□ 1.23
DRC3-204ENST00000470048 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
DRC3-204ENST00000470048 HMGXB3Q12766 1538 aa22.65■■□□□ 1.22
DRC3-204ENST00000470048 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
DRC3-204ENST00000470048 ERCC6Q03468 1493 aa22.56■■□□□ 1.2
DRC3-204ENST00000470048 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.55■■□□□ 1.2
DRC3-204ENST00000470048 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.53■■□□□ 1.2
DRC3-204ENST00000470048 NESP48681 1621 aa22.44■■□□□ 1.18
DRC3-204ENST00000470048 CUX2O14529 1486 aa22.41■■□□□ 1.18
DRC3-204ENST00000470048 WIZO95785 1651 aa22.29■■□□□ 1.16
DRC3-204ENST00000470048 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.29■■□□□ 1.16
DRC3-204ENST00000470048 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.26■■□□□ 1.15
DRC3-204ENST00000470048 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.2■■□□□ 1.14
DRC3-204ENST00000470048 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.17■■□□□ 1.14
DRC3-204ENST00000470048 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
DRC3-204ENST00000470048 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
DRC3-204ENST00000470048 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.14■■□□□ 1.13
DRC3-204ENST00000470048 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
DRC3-204ENST00000470048 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.97■■□□□ 1.11
DRC3-204ENST00000470048 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.93■■□□□ 1.1
DRC3-204ENST00000470048 CFTRP13569 1480 aa21.92■■□□□ 1.1
DRC3-204ENST00000470048 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.91■■□□□ 1.1
DRC3-204ENST00000470048 WDR62O43379 1518 aa21.89■■□□□ 1.09
DRC3-204ENST00000470048 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.77■■□□□ 1.08
DRC3-204ENST00000470048 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
DRC3-204ENST00000470048 PRDM2Q13029 1718 aa21.69■■□□□ 1.06
DRC3-204ENST00000470048 TOPBP1Q92547 1522 aa21.5■■□□□ 1.03
DRC3-204ENST00000470048 ABCC8Q09428 1581 aa21.48■■□□□ 1.03
DRC3-204ENST00000470048 IFT140Q96RY7 1462 aa21.48■■□□□ 1.03
DRC3-204ENST00000470048 OSCARQ8IYS5 282 aa21.48■■□□□ 1.03
DRC3-204ENST00000470048 TRIM41Q8WV44 630 aa21.43■■□□□ 1.02
DRC3-204ENST00000470048 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.43■■□□□ 1.02
DRC3-204ENST00000470048 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
DRC3-204ENST00000470048 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
DRC3-204ENST00000470048 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
DRC3-204ENST00000470048 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
DRC3-204ENST00000470048 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 1
DRC3-204ENST00000470048 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
DRC3-204ENST00000470048 SOGA1O94964 1423 aa21.23■□□□□ 0.99
DRC3-204ENST00000470048 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.23■□□□□ 0.99
DRC3-204ENST00000470048 FBLN2P98095 1184 aa21.2■□□□□ 0.98
DRC3-204ENST00000470048 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.2■□□□□ 0.98
DRC3-204ENST00000470048 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
DRC3-204ENST00000470048 CUX1P39880 1505 aa21.17■□□□□ 0.98
DRC3-204ENST00000470048 CHD1O14646 1710 aa21.12■□□□□ 0.97
DRC3-204ENST00000470048 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.11■□□□□ 0.97
DRC3-204ENST00000470048 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.11■□□□□ 0.97
DRC3-204ENST00000470048 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.11■□□□□ 0.97
DRC3-204ENST00000470048 ARHGEF11O15085 1522 aa21.07■□□□□ 0.96
DRC3-204ENST00000470048 WDR97A6NE52 1622 aa21.06■□□□□ 0.96
DRC3-204ENST00000470048 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.05■□□□□ 0.96
DRC3-204ENST00000470048 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
DRC3-204ENST00000470048 GRIN2BQ13224 1484 aa21.01■□□□□ 0.95
DRC3-204ENST00000470048 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.99■□□□□ 0.95
DRC3-204ENST00000470048 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
DRC3-204ENST00000470048 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.96■□□□□ 0.95
DRC3-204ENST00000470048 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.94■□□□□ 0.94
DRC3-204ENST00000470048 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
DRC3-204ENST00000470048 SYNJ2O15056 1496 aa20.92■□□□□ 0.94
DRC3-204ENST00000470048 PBRM1Q86U86 1689 aa20.92■□□□□ 0.94
DRC3-204ENST00000470048 SYNJ1O43426 1573 aa20.91■□□□□ 0.94
DRC3-204ENST00000470048 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.88■□□□□ 0.93
DRC3-204ENST00000470048 TOP2BQ02880 1626 aa20.87■□□□□ 0.93
DRC3-204ENST00000470048 ARAP1Q96P48 1450 aa20.86■□□□□ 0.93
DRC3-204ENST00000470048 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.86■□□□□ 0.93
DRC3-204ENST00000470048 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.85■□□□□ 0.93
DRC3-204ENST00000470048 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
DRC3-204ENST00000470048 GRIN2AQ12879 1464 aa20.74■□□□□ 0.91
DRC3-204ENST00000470048 ADAMTS12P58397 1594 aa20.72■□□□□ 0.91
DRC3-204ENST00000470048 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.7■□□□□ 0.9
DRC3-204ENST00000470048 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.68■□□□□ 0.9
DRC3-204ENST00000470048 NUP160Q12769 1436 aa20.64■□□□□ 0.89
DRC3-204ENST00000470048 CEP170Q5SW79 1584 aa20.63■□□□□ 0.89
DRC3-204ENST00000470048 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.56■□□□□ 0.88
DRC3-204ENST00000470048 KIF27Q86VH2 1401 aa20.53■□□□□ 0.88
DRC3-204ENST00000470048 SHROOM2Q13796 1616 aa20.51■□□□□ 0.87
DRC3-204ENST00000470048 JPH4Q96JJ6 628 aa20.5■□□□□ 0.87
DRC3-204ENST00000470048 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
DRC3-204ENST00000470048 IGF1RP08069 1367 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms