RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.57■■■■■ 5.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.69■■■■■ 4.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 ABCC9O60706 1549 aa40.9■■■■■ 4.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.31■■■■□ 3.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 NACADO15069 1562 aa39.19■■■■□ 3.86
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.89■■■■□ 3.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.8■■■■□ 3.8
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
TRAPPC10-208ENST00000469521 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.58■■■■□ 3.77
TRAPPC10-208ENST00000469521 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.49■■■■□ 3.75
TRAPPC10-208ENST00000469521 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.12■■■■□ 3.69
TRAPPC10-208ENST00000469521 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.06■■■■□ 3.68
TRAPPC10-208ENST00000469521 SCRIBQ14160 1630 aa37.9■■■■□ 3.66
TRAPPC10-208ENST00000469521 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.78■■■■□ 3.64
TRAPPC10-208ENST00000469521 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.73■■■■□ 3.63
TRAPPC10-208ENST00000469521 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
TRAPPC10-208ENST00000469521 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.07■■■■□ 3.52
TRAPPC10-208ENST00000469521 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.82■■■■□ 3.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMARCA4P51532 1647 aa36.25■■■■□ 3.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
TRAPPC10-208ENST00000469521 NCAPD3P42695 1498 aa36.11■■■■□ 3.37
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMARCA2P51531 1590 aa36.07■■■■□ 3.37
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.07■■■■□ 3.37
TRAPPC10-208ENST00000469521 HMGXB3Q12766 1538 aa35.98■■■■□ 3.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.93■■■■□ 3.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.85■■■■□ 3.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 WIZO95785 1651 aa35.49■■■■□ 3.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 ERCC6Q03468 1493 aa35.31■■■■□ 3.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 NESP48681 1621 aa35.3■■■■□ 3.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.28■■■■□ 3.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
TRAPPC10-208ENST00000469521 CUX2O14529 1486 aa35.11■■■■□ 3.21
TRAPPC10-208ENST00000469521 CADPSQ9ULU8 1353 aa35■■■■□ 3.19
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.99■■■■□ 3.19
TRAPPC10-208ENST00000469521 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
TRAPPC10-208ENST00000469521 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.97■■■■□ 3.19
TRAPPC10-208ENST00000469521 CFTRP13569 1480 aa34.77■■■■□ 3.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.66■■■■□ 3.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRDM2Q13029 1718 aa34.65■■■■□ 3.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.65■■■■□ 3.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.63■■■■□ 3.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.63■■■■□ 3.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 WDR62O43379 1518 aa34.61■■■■□ 3.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.27■■■■□ 3.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 ABCC8Q09428 1581 aa34.06■■■■□ 3.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 TOPBP1Q92547 1522 aa34.05■■■■□ 3.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.03■■■■□ 3.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 IFT140Q96RY7 1462 aa33.93■■■■□ 3.02
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.76■■■■□ 3
TRAPPC10-208ENST00000469521 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC10-208ENST00000469521 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
TRAPPC10-208ENST00000469521 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
TRAPPC10-208ENST00000469521 CUX1P39880 1505 aa33.69■■■□□ 2.98
TRAPPC10-208ENST00000469521 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.61■■■□□ 2.97
TRAPPC10-208ENST00000469521 WDR97A6NE52 1622 aa33.55■■■□□ 2.96
TRAPPC10-208ENST00000469521 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.54■■■□□ 2.96
TRAPPC10-208ENST00000469521 SOGA1O94964 1423 aa33.53■■■□□ 2.96
TRAPPC10-208ENST00000469521 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.5■■■□□ 2.95
TRAPPC10-208ENST00000469521 OSCARQ8IYS5 282 aa33.45■■■□□ 2.95
TRAPPC10-208ENST00000469521 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.38■■■□□ 2.93
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHD1O14646 1710 aa33.36■■■□□ 2.93
TRAPPC10-208ENST00000469521 TOP2BQ02880 1626 aa33.35■■■□□ 2.93
TRAPPC10-208ENST00000469521 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC10-208ENST00000469521 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.31■■■□□ 2.92
TRAPPC10-208ENST00000469521 SYNJ1O43426 1573 aa33.3■■■□□ 2.92
TRAPPC10-208ENST00000469521 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.29■■■□□ 2.92
TRAPPC10-208ENST00000469521 PBRM1Q86U86 1689 aa33.26■■■□□ 2.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.25■■■□□ 2.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.25■■■□□ 2.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 GRIN2BQ13224 1484 aa33.24■■■□□ 2.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.23■■■□□ 2.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.18■■■□□ 2.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.1■■■□□ 2.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.1■■■□□ 2.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.1■■■□□ 2.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 SYNJ2O15056 1496 aa33.08■■■□□ 2.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 FBLN2P98095 1184 aa33.07■■■□□ 2.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARHGEF11O15085 1522 aa33.03■■■□□ 2.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.98■■■□□ 2.87
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADAMTS12P58397 1594 aa32.96■■■□□ 2.87
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRIM41Q8WV44 630 aa32.95■■■□□ 2.87
TRAPPC10-208ENST00000469521 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.92■■■□□ 2.86
TRAPPC10-208ENST00000469521 GRIN2AQ12879 1464 aa32.83■■■□□ 2.85
TRAPPC10-208ENST00000469521 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.79■■■□□ 2.84
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARAP1Q96P48 1450 aa32.74■■■□□ 2.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 NUP160Q12769 1436 aa32.7■■■□□ 2.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 CEP170Q5SW79 1584 aa32.7■■■□□ 2.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIF27Q86VH2 1401 aa32.64■■■□□ 2.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 CUL7Q14999 1698 aa32.6■■■□□ 2.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.58■■■□□ 2.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 SHROOM2Q13796 1616 aa32.56■■■□□ 2.8
TRAPPC10-208ENST00000469521 IGF1RP08069 1367 aa32.49■■■□□ 2.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.49■■■□□ 2.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.43■■■□□ 2.78
TRAPPC10-208ENST00000469521 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.3■■■□□ 2.76
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