RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469385.1

TAGLN3-204, Transcript of transgelin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TAGLN3, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAGLN3-204ENST00000469385 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.7■■■□□ 2.99
TAGLN3-204ENST00000469385 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.07■■■□□ 2.4
TAGLN3-204ENST00000469385 ABCC9O60706 1549 aa29.28■■■□□ 2.28
TAGLN3-204ENST00000469385 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.28■■■□□ 2.12
TAGLN3-204ENST00000469385 NACADO15069 1562 aa28.25■■■□□ 2.11
TAGLN3-204ENST00000469385 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.13■■■□□ 2.09
TAGLN3-204ENST00000469385 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
TAGLN3-204ENST00000469385 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28■■■□□ 2.07
TAGLN3-204ENST00000469385 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.97■■■□□ 2.07
TAGLN3-204ENST00000469385 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.61■■■□□ 2.01
TAGLN3-204ENST00000469385 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.37■■□□□ 1.97
TAGLN3-204ENST00000469385 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
TAGLN3-204ENST00000469385 SCRIBQ14160 1630 aa27.29■■□□□ 1.96
TAGLN3-204ENST00000469385 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.25■■□□□ 1.95
TAGLN3-204ENST00000469385 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.85■■□□□ 1.89
TAGLN3-204ENST00000469385 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
TAGLN3-204ENST00000469385 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.55■■□□□ 1.84
TAGLN3-204ENST00000469385 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.36■■□□□ 1.81
TAGLN3-204ENST00000469385 SMARCA4P51532 1647 aa26.16■■□□□ 1.78
TAGLN3-204ENST00000469385 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
TAGLN3-204ENST00000469385 NCAPD3P42695 1498 aa26.04■■□□□ 1.76
TAGLN3-204ENST00000469385 SMARCA2P51531 1590 aa26.04■■□□□ 1.76
TAGLN3-204ENST00000469385 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.01■■□□□ 1.75
TAGLN3-204ENST00000469385 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.97■■□□□ 1.75
TAGLN3-204ENST00000469385 HMGXB3Q12766 1538 aa25.94■■□□□ 1.74
TAGLN3-204ENST00000469385 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.91■■□□□ 1.74
TAGLN3-204ENST00000469385 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
TAGLN3-204ENST00000469385 WIZO95785 1651 aa25.63■■□□□ 1.69
TAGLN3-204ENST00000469385 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
TAGLN3-204ENST00000469385 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
TAGLN3-204ENST00000469385 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.39■■□□□ 1.65
TAGLN3-204ENST00000469385 NESP48681 1621 aa25.32■■□□□ 1.64
TAGLN3-204ENST00000469385 ERCC6Q03468 1493 aa25.29■■□□□ 1.64
TAGLN3-204ENST00000469385 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.25■■□□□ 1.63
TAGLN3-204ENST00000469385 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.2■■□□□ 1.62
TAGLN3-204ENST00000469385 CUX2O14529 1486 aa25.12■■□□□ 1.61
TAGLN3-204ENST00000469385 CFTRP13569 1480 aa25.11■■□□□ 1.61
TAGLN3-204ENST00000469385 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.08■■□□□ 1.61
TAGLN3-204ENST00000469385 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.07■■□□□ 1.6
TAGLN3-204ENST00000469385 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TAGLN3-204ENST00000469385 PRDM2Q13029 1718 aa24.99■■□□□ 1.59
TAGLN3-204ENST00000469385 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.95■■□□□ 1.58
TAGLN3-204ENST00000469385 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.95■■□□□ 1.58
TAGLN3-204ENST00000469385 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.92■■□□□ 1.58
TAGLN3-204ENST00000469385 WDR62O43379 1518 aa24.86■■□□□ 1.57
TAGLN3-204ENST00000469385 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
TAGLN3-204ENST00000469385 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
TAGLN3-204ENST00000469385 ABCC8Q09428 1581 aa24.63■■□□□ 1.53
TAGLN3-204ENST00000469385 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.55■■□□□ 1.52
TAGLN3-204ENST00000469385 TOPBP1Q92547 1522 aa24.55■■□□□ 1.52
TAGLN3-204ENST00000469385 IFT140Q96RY7 1462 aa24.45■■□□□ 1.5
TAGLN3-204ENST00000469385 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
TAGLN3-204ENST00000469385 CUX1P39880 1505 aa24.33■■□□□ 1.49
TAGLN3-204ENST00000469385 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.32■■□□□ 1.48
TAGLN3-204ENST00000469385 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TAGLN3-204ENST00000469385 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.26■■□□□ 1.47
TAGLN3-204ENST00000469385 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TAGLN3-204ENST00000469385 WDR97A6NE52 1622 aa24.22■■□□□ 1.47
TAGLN3-204ENST00000469385 SOGA1O94964 1423 aa24.22■■□□□ 1.47
TAGLN3-204ENST00000469385 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TAGLN3-204ENST00000469385 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
TAGLN3-204ENST00000469385 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.17■■□□□ 1.46
TAGLN3-204ENST00000469385 TOP2BQ02880 1626 aa24.17■■□□□ 1.46
TAGLN3-204ENST00000469385 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.16■■□□□ 1.46
TAGLN3-204ENST00000469385 SYNJ1O43426 1573 aa24.09■■□□□ 1.45
TAGLN3-204ENST00000469385 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
TAGLN3-204ENST00000469385 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.07■■□□□ 1.44
TAGLN3-204ENST00000469385 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
TAGLN3-204ENST00000469385 OSCARQ8IYS5 282 aa24■■□□□ 1.43
TAGLN3-204ENST00000469385 GRIN2BQ13224 1484 aa23.98■■□□□ 1.43
TAGLN3-204ENST00000469385 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.98■■□□□ 1.43
TAGLN3-204ENST00000469385 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.96■■□□□ 1.43
TAGLN3-204ENST00000469385 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
TAGLN3-204ENST00000469385 PBRM1Q86U86 1689 aa23.93■■□□□ 1.42
TAGLN3-204ENST00000469385 CHD1O14646 1710 aa23.91■■□□□ 1.42
TAGLN3-204ENST00000469385 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.91■■□□□ 1.42
TAGLN3-204ENST00000469385 SYNJ2O15056 1496 aa23.84■■□□□ 1.41
TAGLN3-204ENST00000469385 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.8■■□□□ 1.4
TAGLN3-204ENST00000469385 FBLN2P98095 1184 aa23.78■■□□□ 1.4
TAGLN3-204ENST00000469385 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
TAGLN3-204ENST00000469385 ADAMTS12P58397 1594 aa23.74■■□□□ 1.39
TAGLN3-204ENST00000469385 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.7■■□□□ 1.38
TAGLN3-204ENST00000469385 KIF27Q86VH2 1401 aa23.69■■□□□ 1.38
TAGLN3-204ENST00000469385 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.67■■□□□ 1.38
TAGLN3-204ENST00000469385 GRIN2AQ12879 1464 aa23.66■■□□□ 1.38
TAGLN3-204ENST00000469385 ARHGEF11O15085 1522 aa23.62■■□□□ 1.37
TAGLN3-204ENST00000469385 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.62■■□□□ 1.37
TAGLN3-204ENST00000469385 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.62■■□□□ 1.37
TAGLN3-204ENST00000469385 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.62■■□□□ 1.37
TAGLN3-204ENST00000469385 CUL7Q14999 1698 aa23.6■■□□□ 1.37
TAGLN3-204ENST00000469385 NUP160Q12769 1436 aa23.58■■□□□ 1.36
TAGLN3-204ENST00000469385 IGF1RP08069 1367 aa23.56■■□□□ 1.36
TAGLN3-204ENST00000469385 CEP170Q5SW79 1584 aa23.52■■□□□ 1.36
TAGLN3-204ENST00000469385 TRIM41Q8WV44 630 aa23.52■■□□□ 1.36
TAGLN3-204ENST00000469385 SHROOM2Q13796 1616 aa23.43■■□□□ 1.34
TAGLN3-204ENST00000469385 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.42■■□□□ 1.34
TAGLN3-204ENST00000469385 ARAP1Q96P48 1450 aa23.41■■□□□ 1.34
TAGLN3-204ENST00000469385 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.39■■□□□ 1.34
TAGLN3-204ENST00000469385 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.34■■□□□ 1.33
TAGLN3-204ENST00000469385 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms