RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469298.5

UHRF2-206, Transcript of ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2, humanhuman

TSL 5

Gene UHRF2, Length 990 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF2-206ENST00000469298 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.19■■■■■ 5.79
UHRF2-206ENST00000469298 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.74■■■■■ 4.91
UHRF2-206ENST00000469298 ABCC9O60706 1549 aa45.21■■■■■ 4.83
UHRF2-206ENST00000469298 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.26■■■■■ 4.52
UHRF2-206ENST00000469298 NACADO15069 1562 aa43.09■■■■■ 4.49
UHRF2-206ENST00000469298 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.92■■■■■ 4.46
UHRF2-206ENST00000469298 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.67■■■■■ 4.42
UHRF2-206ENST00000469298 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
UHRF2-206ENST00000469298 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.37■■■■■ 4.37
UHRF2-206ENST00000469298 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.32■■■■■ 4.37
UHRF2-206ENST00000469298 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.15■■■■■ 4.34
UHRF2-206ENST00000469298 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.01■■■■■ 4.32
UHRF2-206ENST00000469298 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.96■■■■■ 4.31
UHRF2-206ENST00000469298 SCRIBQ14160 1630 aa41.7■■■■■ 4.27
UHRF2-206ENST00000469298 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.47■■■■■ 4.23
UHRF2-206ENST00000469298 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
UHRF2-206ENST00000469298 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.89■■■■■ 4.14
UHRF2-206ENST00000469298 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.66■■■■■ 4.1
UHRF2-206ENST00000469298 SMARCA4P51532 1647 aa39.83■■■■□ 3.97
UHRF2-206ENST00000469298 NCAPD3P42695 1498 aa39.77■■■■□ 3.96
UHRF2-206ENST00000469298 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.73■■■■□ 3.95
UHRF2-206ENST00000469298 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
UHRF2-206ENST00000469298 SMARCA2P51531 1590 aa39.64■■■■□ 3.94
UHRF2-206ENST00000469298 HMGXB3Q12766 1538 aa39.54■■■■□ 3.92
UHRF2-206ENST00000469298 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.46■■■■□ 3.91
UHRF2-206ENST00000469298 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.46■■■■□ 3.91
UHRF2-206ENST00000469298 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
UHRF2-206ENST00000469298 WIZO95785 1651 aa39.03■■■■□ 3.84
UHRF2-206ENST00000469298 NESP48681 1621 aa39■■■■□ 3.83
UHRF2-206ENST00000469298 ERCC6Q03468 1493 aa38.97■■■■□ 3.83
UHRF2-206ENST00000469298 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.81■■■■□ 3.8
UHRF2-206ENST00000469298 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.8■■■■□ 3.8
UHRF2-206ENST00000469298 CUX2O14529 1486 aa38.74■■■■□ 3.79
UHRF2-206ENST00000469298 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.57■■■■□ 3.77
UHRF2-206ENST00000469298 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
UHRF2-206ENST00000469298 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.55■■■■□ 3.76
UHRF2-206ENST00000469298 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.53■■■■□ 3.76
UHRF2-206ENST00000469298 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
UHRF2-206ENST00000469298 CFTRP13569 1480 aa38.26■■■■□ 3.72
UHRF2-206ENST00000469298 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.19■■■■□ 3.7
UHRF2-206ENST00000469298 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.14■■■■□ 3.7
UHRF2-206ENST00000469298 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.13■■■■□ 3.69
UHRF2-206ENST00000469298 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.13■■■■□ 3.69
UHRF2-206ENST00000469298 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.1■■■■□ 3.69
UHRF2-206ENST00000469298 WDR62O43379 1518 aa38.09■■■■□ 3.69
UHRF2-206ENST00000469298 PRDM2Q13029 1718 aa37.99■■■■□ 3.67
UHRF2-206ENST00000469298 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
UHRF2-206ENST00000469298 TOPBP1Q92547 1522 aa37.49■■■■□ 3.59
UHRF2-206ENST00000469298 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
UHRF2-206ENST00000469298 ABCC8Q09428 1581 aa37.42■■■■□ 3.58
UHRF2-206ENST00000469298 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.41■■■■□ 3.58
UHRF2-206ENST00000469298 IFT140Q96RY7 1462 aa37.35■■■■□ 3.57
UHRF2-206ENST00000469298 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
UHRF2-206ENST00000469298 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
UHRF2-206ENST00000469298 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
UHRF2-206ENST00000469298 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
UHRF2-206ENST00000469298 CUX1P39880 1505 aa37.04■■■■□ 3.52
UHRF2-206ENST00000469298 OSCARQ8IYS5 282 aa37.03■■■■□ 3.52
UHRF2-206ENST00000469298 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.99■■■■□ 3.51
UHRF2-206ENST00000469298 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.98■■■■□ 3.516e-6■■■■□ 23.2
UHRF2-206ENST00000469298 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.98■■■■□ 3.51
UHRF2-206ENST00000469298 SOGA1O94964 1423 aa36.95■■■■□ 3.51
UHRF2-206ENST00000469298 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.49
UHRF2-206ENST00000469298 WDR97A6NE52 1622 aa36.77■■■■□ 3.48
UHRF2-206ENST00000469298 CHD1O14646 1710 aa36.75■■■■□ 3.47
UHRF2-206ENST00000469298 TRIM41Q8WV44 630 aa36.65■■■■□ 3.46
UHRF2-206ENST00000469298 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.62■■■■□ 3.45
UHRF2-206ENST00000469298 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.6■■■■□ 3.45
UHRF2-206ENST00000469298 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.45
UHRF2-206ENST00000469298 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.59■■■■□ 3.45
UHRF2-206ENST00000469298 TOP2BQ02880 1626 aa36.59■■■■□ 3.45
UHRF2-206ENST00000469298 GRIN2BQ13224 1484 aa36.58■■■■□ 3.45
UHRF2-206ENST00000469298 FBLN2P98095 1184 aa36.58■■■■□ 3.45
UHRF2-206ENST00000469298 SYNJ1O43426 1573 aa36.57■■■■□ 3.45
UHRF2-206ENST00000469298 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.55■■■■□ 3.44
UHRF2-206ENST00000469298 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.55■■■■□ 3.44
UHRF2-206ENST00000469298 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.55■■■■□ 3.44
UHRF2-206ENST00000469298 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
UHRF2-206ENST00000469298 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.53■■■■□ 3.44
UHRF2-206ENST00000469298 PBRM1Q86U86 1689 aa36.53■■■■□ 3.44
UHRF2-206ENST00000469298 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.52■■■■□ 3.44
UHRF2-206ENST00000469298 ARHGEF11O15085 1522 aa36.48■■■■□ 3.43
UHRF2-206ENST00000469298 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
UHRF2-206ENST00000469298 SYNJ2O15056 1496 aa36.41■■■■□ 3.42
UHRF2-206ENST00000469298 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.32■■■■□ 3.4
UHRF2-206ENST00000469298 ADAMTS12P58397 1594 aa36.19■■■■□ 3.38
UHRF2-206ENST00000469298 ARAP1Q96P48 1450 aa36.16■■■■□ 3.38
UHRF2-206ENST00000469298 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.14■■■■□ 3.38
UHRF2-206ENST00000469298 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.14■■■■□ 3.38
UHRF2-206ENST00000469298 GRIN2AQ12879 1464 aa36.12■■■■□ 3.37
UHRF2-206ENST00000469298 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.08■■■■□ 3.37
UHRF2-206ENST00000469298 NUP160Q12769 1436 aa36■■■■□ 3.35
UHRF2-206ENST00000469298 CEP170Q5SW79 1584 aa35.99■■■■□ 3.35
UHRF2-206ENST00000469298 KIF27Q86VH2 1401 aa35.85■■■■□ 3.33
UHRF2-206ENST00000469298 SHROOM2Q13796 1616 aa35.8■■■■□ 3.32
UHRF2-206ENST00000469298 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.8■■■■□ 3.32
UHRF2-206ENST00000469298 IGF1RP08069 1367 aa35.79■■■■□ 3.32
UHRF2-206ENST00000469298 CUL7Q14999 1698 aa35.73■■■■□ 3.31
UHRF2-206ENST00000469298 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.67■■■■□ 3.3
UHRF2-206ENST00000469298 JPH4Q96JJ6 628 aa35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms