RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469059.1

EPC1-205, Transcript of enhancer of polycomb homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene EPC1, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EPC1-205ENST00000469059 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.28■■■□□ 2.92
EPC1-205ENST00000469059 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.26■■■□□ 2.92
EPC1-205ENST00000469059 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
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EPC1-205ENST00000469059 SMARCA2P51531 1590 aa31.94■■■□□ 2.7
EPC1-205ENST00000469059 SMARCA4P51532 1647 aa31.94■■■□□ 2.7
EPC1-205ENST00000469059 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.91■■■□□ 2.7
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EPC1-205ENST00000469059 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.58■■■□□ 2.65
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EPC1-205ENST00000469059 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.39■■■□□ 2.62
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EPC1-205ENST00000469059 WIZO95785 1651 aa31.18■■■□□ 2.58
EPC1-205ENST00000469059 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.17■■■□□ 2.58
EPC1-205ENST00000469059 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.99■■■□□ 2.55
EPC1-205ENST00000469059 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
EPC1-205ENST00000469059 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.89■■■□□ 2.53
EPC1-205ENST00000469059 WDR62O43379 1518 aa30.85■■■□□ 2.53
EPC1-205ENST00000469059 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.85■■■□□ 2.53
EPC1-205ENST00000469059 CFTRP13569 1480 aa30.79■■■□□ 2.52
EPC1-205ENST00000469059 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
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EPC1-205ENST00000469059 OSCARQ8IYS5 282 aa30.48■■■□□ 2.47
EPC1-205ENST00000469059 PRDM2Q13029 1718 aa30.34■■■□□ 2.45
EPC1-205ENST00000469059 IFT140Q96RY7 1462 aa30.26■■■□□ 2.44
EPC1-205ENST00000469059 TOPBP1Q92547 1522 aa30.23■■■□□ 2.43
EPC1-205ENST00000469059 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
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EPC1-205ENST00000469059 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.92■■■□□ 2.38
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EPC1-205ENST00000469059 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
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EPC1-205ENST00000469059 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.85■■■□□ 2.37
EPC1-205ENST00000469059 ARHGEF11O15085 1522 aa29.85■■■□□ 2.37
EPC1-205ENST00000469059 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
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EPC1-205ENST00000469059 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
EPC1-205ENST00000469059 CHD1O14646 1710 aa29.75■■■□□ 2.35
EPC1-205ENST00000469059 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.74■■■□□ 2.35
EPC1-205ENST00000469059 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
EPC1-205ENST00000469059 CUX1P39880 1505 aa29.67■■■□□ 2.34
EPC1-205ENST00000469059 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.64■■■□□ 2.34
EPC1-205ENST00000469059 WDR97A6NE52 1622 aa29.56■■■□□ 2.32
EPC1-205ENST00000469059 GRIN2BQ13224 1484 aa29.56■■■□□ 2.32
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EPC1-205ENST00000469059 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
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EPC1-205ENST00000469059 SYNJ1O43426 1573 aa29.46■■■□□ 2.31
EPC1-205ENST00000469059 SYNJ2O15056 1496 aa29.45■■■□□ 2.31
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EPC1-205ENST00000469059 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.37■■■□□ 2.29
EPC1-205ENST00000469059 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
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EPC1-205ENST00000469059 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.26■■■□□ 2.27
EPC1-205ENST00000469059 GRIN2AQ12879 1464 aa29.16■■■□□ 2.26
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EPC1-205ENST00000469059 JPH4Q96JJ6 628 aa28.88■■■□□ 2.21
EPC1-205ENST00000469059 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
EPC1-205ENST00000469059 SHROOM2Q13796 1616 aa28.83■■■□□ 2.21
EPC1-205ENST00000469059 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
EPC1-205ENST00000469059 KIF27Q86VH2 1401 aa28.7■■■□□ 2.19
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