RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468890.1

NHLRC2-202, Transcript of NHL repeat containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene NHLRC2, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2-202ENST00000468890 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.22■■■■■ 5.15
NHLRC2-202ENST00000468890 ABCC9O60706 1549 aa43.4■■■■■ 4.54
NHLRC2-202ENST00000468890 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.63■■■■■ 4.41
NHLRC2-202ENST00000468890 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.39■■■■■ 4.22
NHLRC2-202ENST00000468890 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.91■■■■■ 4.14
NHLRC2-202ENST00000468890 NACADO15069 1562 aa40.44■■■■■ 4.06
NHLRC2-202ENST00000468890 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.32■■■■■ 4.05
NHLRC2-202ENST00000468890 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.17■■■■■ 4.02
NHLRC2-202ENST00000468890 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.1■■■■■ 4.01
NHLRC2-202ENST00000468890 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.86■■■■□ 3.97
NHLRC2-202ENST00000468890 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.62■■■■□ 3.93
NHLRC2-202ENST00000468890 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.15■■■■□ 3.86
NHLRC2-202ENST00000468890 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.12■■■■□ 3.85
NHLRC2-202ENST00000468890 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.06■■■■□ 3.84
NHLRC2-202ENST00000468890 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
NHLRC2-202ENST00000468890 SCRIBQ14160 1630 aa38.91■■■■□ 3.82
NHLRC2-202ENST00000468890 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.89■■■■□ 3.82
NHLRC2-202ENST00000468890 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
NHLRC2-202ENST00000468890 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.38■■■■□ 3.73
NHLRC2-202ENST00000468890 CUX2O14529 1486 aa37.58■■■■□ 3.61
NHLRC2-202ENST00000468890 ERCC6Q03468 1493 aa37.45■■■■□ 3.59
NHLRC2-202ENST00000468890 NCAPD3P42695 1498 aa37.38■■■■□ 3.57
NHLRC2-202ENST00000468890 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.2■■■■□ 3.54
NHLRC2-202ENST00000468890 NESP48681 1621 aa37.14■■■■□ 3.54
NHLRC2-202ENST00000468890 HMGXB3Q12766 1538 aa37.03■■■■□ 3.52
NHLRC2-202ENST00000468890 SMARCA4P51532 1647 aa37■■■■□ 3.51
NHLRC2-202ENST00000468890 SMARCA2P51531 1590 aa37■■■■□ 3.51
NHLRC2-202ENST00000468890 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
NHLRC2-202ENST00000468890 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
NHLRC2-202ENST00000468890 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
NHLRC2-202ENST00000468890 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.63■■■■□ 3.45
NHLRC2-202ENST00000468890 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.61■■■■□ 3.45
NHLRC2-202ENST00000468890 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.61■■■■□ 3.45
NHLRC2-202ENST00000468890 TRIM41Q8WV44 630 aa36.48■■■■□ 3.43
NHLRC2-202ENST00000468890 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.44■■■■□ 3.42
NHLRC2-202ENST00000468890 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.42■■■■□ 3.42
NHLRC2-202ENST00000468890 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.2■■■■□ 3.39
NHLRC2-202ENST00000468890 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.2■■■■□ 3.39
NHLRC2-202ENST00000468890 WDR62O43379 1518 aa36.14■■■■□ 3.38
NHLRC2-202ENST00000468890 WIZO95785 1651 aa35.98■■■■□ 3.35
NHLRC2-202ENST00000468890 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.91■■■■□ 3.34
NHLRC2-202ENST00000468890 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.83■■■■□ 3.33
NHLRC2-202ENST00000468890 OSCARQ8IYS5 282 aa35.75■■■■□ 3.31
NHLRC2-202ENST00000468890 CFTRP13569 1480 aa35.67■■■■□ 3.3
NHLRC2-202ENST00000468890 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
NHLRC2-202ENST00000468890 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.46■■■■□ 3.27
NHLRC2-202ENST00000468890 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.46■■■■□ 3.27
NHLRC2-202ENST00000468890 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.46■■■■□ 3.27
NHLRC2-202ENST00000468890 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
NHLRC2-202ENST00000468890 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
NHLRC2-202ENST00000468890 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.25
NHLRC2-202ENST00000468890 ARHGEF11O15085 1522 aa35.26■■■■□ 3.23
NHLRC2-202ENST00000468890 PRDM2Q13029 1718 aa35.24■■■■□ 3.23
NHLRC2-202ENST00000468890 IFT140Q96RY7 1462 aa35.2■■■■□ 3.23
NHLRC2-202ENST00000468890 TOPBP1Q92547 1522 aa35.08■■■■□ 3.21
NHLRC2-202ENST00000468890 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
NHLRC2-202ENST00000468890 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.04■■■■□ 3.2
NHLRC2-202ENST00000468890 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.02■■■■□ 3.2
NHLRC2-202ENST00000468890 CHD1O14646 1710 aa34.94■■■■□ 3.18
NHLRC2-202ENST00000468890 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.89■■■■□ 3.18
NHLRC2-202ENST00000468890 ARAP1Q96P48 1450 aa34.89■■■■□ 3.18
NHLRC2-202ENST00000468890 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.87■■■■□ 3.17
NHLRC2-202ENST00000468890 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
NHLRC2-202ENST00000468890 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
NHLRC2-202ENST00000468890 ABCC8Q09428 1581 aa34.83■■■■□ 3.17
NHLRC2-202ENST00000468890 FBLN2P98095 1184 aa34.75■■■■□ 3.15
NHLRC2-202ENST00000468890 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
NHLRC2-202ENST00000468890 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.63■■■■□ 3.13
NHLRC2-202ENST00000468890 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
NHLRC2-202ENST00000468890 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.5■■■■□ 3.11
NHLRC2-202ENST00000468890 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.5■■■■□ 3.11
NHLRC2-202ENST00000468890 SOGA1O94964 1423 aa34.48■■■■□ 3.11
NHLRC2-202ENST00000468890 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.38■■■■□ 3.09
NHLRC2-202ENST00000468890 SYNJ1O43426 1573 aa34.36■■■■□ 3.09
NHLRC2-202ENST00000468890 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
NHLRC2-202ENST00000468890 WDR97A6NE52 1622 aa34.32■■■■□ 3.08
NHLRC2-202ENST00000468890 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
NHLRC2-202ENST00000468890 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
NHLRC2-202ENST00000468890 CUX1P39880 1505 aa34.26■■■■□ 3.08
NHLRC2-202ENST00000468890 GRIN2BQ13224 1484 aa34.25■■■■□ 3.07
NHLRC2-202ENST00000468890 SYNJ2O15056 1496 aa34.22■■■■□ 3.07
NHLRC2-202ENST00000468890 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.15■■■■□ 3.06
NHLRC2-202ENST00000468890 PBRM1Q86U86 1689 aa34.13■■■■□ 3.05
NHLRC2-202ENST00000468890 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34■■■■□ 3.03
NHLRC2-202ENST00000468890 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.96■■■■□ 3.03
NHLRC2-202ENST00000468890 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.91■■■■□ 3.02
NHLRC2-202ENST00000468890 GRIN2AQ12879 1464 aa33.84■■■■□ 3.01
NHLRC2-202ENST00000468890 CEP170Q5SW79 1584 aa33.81■■■■□ 3
NHLRC2-202ENST00000468890 ADAMTS12P58397 1594 aa33.76■■■□□ 2.99
NHLRC2-202ENST00000468890 NUP160Q12769 1436 aa33.75■■■□□ 2.99
NHLRC2-202ENST00000468890 SHROOM2Q13796 1616 aa33.69■■■□□ 2.98
NHLRC2-202ENST00000468890 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.65■■■□□ 2.98
NHLRC2-202ENST00000468890 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.61■■■□□ 2.97
NHLRC2-202ENST00000468890 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.58■■■□□ 2.97
NHLRC2-202ENST00000468890 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.5■■■□□ 2.95
NHLRC2-202ENST00000468890 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
NHLRC2-202ENST00000468890 TOP2BQ02880 1626 aa33.48■■■□□ 2.95
NHLRC2-202ENST00000468890 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.45■■■□□ 2.95
NHLRC2-202ENST00000468890 JPH4Q96JJ6 628 aa33.37■■■□□ 2.93
NHLRC2-202ENST00000468890 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.35■■■□□ 2.93
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