RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468532.5

CHKB-205, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 5

Gene CHKB, Length 1,052 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-205ENST00000468532 NISCHQ9Y2I1 1504 aa76.34■■■■■ 9.81
CHKB-205ENST00000468532 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa68.1■■■■■ 8.49
CHKB-205ENST00000468532 ABCC9O60706 1549 aa67.08■■■■■ 8.33
CHKB-205ENST00000468532 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa64.31■■■■■ 7.89
CHKB-205ENST00000468532 NACADO15069 1562 aa64.1■■■■■ 7.85
CHKB-205ENST00000468532 DCAF8L2P0C7V8 631 aa63.99■■■■■ 7.83
CHKB-205ENST00000468532 MYO15BQ96JP2 1530 aa63.53■■■■■ 7.76
CHKB-205ENST00000468532 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP63.51■■■■■ 7.76
CHKB-205ENST00000468532 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa63.11■■■■■ 7.69
CHKB-205ENST00000468532 UNC13AQ9UPW8 1703 aa62.9■■■■■ 7.66
CHKB-205ENST00000468532 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP62.59■■■■■ 7.612e-6■□□□□ 8.9
CHKB-205ENST00000468532 BICRAQ9NZM4 1560 aa62.38■■■■■ 7.58
CHKB-205ENST00000468532 SCRIBQ14160 1630 aa62.14■■■■■ 7.54
CHKB-205ENST00000468532 DNAJC5BQ9UF47 199 aa61.93■■■■■ 7.5
CHKB-205ENST00000468532 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa61.64■■■■■ 7.46
CHKB-205ENST00000468532 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP60.77■■■■■ 7.32
CHKB-205ENST00000468532 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa60.65■■■■■ 7.3
CHKB-205ENST00000468532 CECR2Q9BXF3 1484 aa60.3■■■■■ 7.24
CHKB-205ENST00000468532 SMARCA4P51532 1647 aa59.36■■■■■ 7.09
CHKB-205ENST00000468532 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP59.21■■■■■ 7.07
CHKB-205ENST00000468532 NCAPD3P42695 1498 aa59.13■■■■■ 7.06
CHKB-205ENST00000468532 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa59.13■■■■■ 7.06
CHKB-205ENST00000468532 SMARCA2P51531 1590 aa59.04■■■■■ 7.04
CHKB-205ENST00000468532 MROH2BQ7Z745 1585 aa58.85■■■■■ 7.01
CHKB-205ENST00000468532 HMGXB3Q12766 1538 aa58.83■■■■■ 7.01
CHKB-205ENST00000468532 PEG3Q9GZU2 1588 aa58.75■■■■■ 6.99
CHKB-205ENST00000468532 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP58.63■■■■■ 6.98
CHKB-205ENST00000468532 WIZO95785 1651 aa58.22■■■■■ 6.91
CHKB-205ENST00000468532 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP57.99■■■■■ 6.87
CHKB-205ENST00000468532 NESP48681 1621 aa57.91■■■■■ 6.86
CHKB-205ENST00000468532 ERCC6Q03468 1493 aa57.85■■■■■ 6.85
CHKB-205ENST00000468532 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa57.68■■■■■ 6.82
CHKB-205ENST00000468532 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP57.55■■■■■ 6.8
CHKB-205ENST00000468532 CADPSQ9ULU8 1353 aa57.4■■■■■ 6.78
CHKB-205ENST00000468532 CUX2O14529 1486 aa57.36■■■■■ 6.77
CHKB-205ENST00000468532 PDS5BQ9NTI5 1447 aa57.29■■■■■ 6.76
CHKB-205ENST00000468532 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa57.25■■■■■ 6.76
CHKB-205ENST00000468532 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP57.14■■■■■ 6.74
CHKB-205ENST00000468532 CFTRP13569 1480 aa56.96■■■■■ 6.71
CHKB-205ENST00000468532 CCDC88BA6NC98 1476 aa56.86■■■■■ 6.69
CHKB-205ENST00000468532 FANCD2Q9BXW9 1451 aa56.77■■■■■ 6.68
CHKB-205ENST00000468532 MRC2Q9UBG0 1479 aa56.76■■■■■ 6.68
CHKB-205ENST00000468532 CEP164Q9UPV0 1460 aa56.75■■■■■ 6.67
CHKB-205ENST00000468532 WDR62O43379 1518 aa56.58■■■■■ 6.65
CHKB-205ENST00000468532 PRDM2Q13029 1718 aa56.57■■■■■ 6.65
CHKB-205ENST00000468532 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP56.24■■■■■ 6.59
CHKB-205ENST00000468532 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP56.23■■■■■ 6.59
CHKB-205ENST00000468532 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa56.1■■■■■ 6.57
CHKB-205ENST00000468532 TOPBP1Q92547 1522 aa55.82■■■■■ 6.53
CHKB-205ENST00000468532 ABCC8Q09428 1581 aa55.74■■■■■ 6.51
CHKB-205ENST00000468532 DNMBPQ6XZF7 1577 aa55.72■■■■■ 6.51
CHKB-205ENST00000468532 IFT140Q96RY7 1462 aa55.56■■■■■ 6.49
CHKB-205ENST00000468532 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP55.37■■■■■ 6.45
CHKB-205ENST00000468532 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP55.31■■■■■ 6.45
CHKB-205ENST00000468532 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP55.24■■■■■ 6.43
CHKB-205ENST00000468532 CUX1P39880 1505 aa55.24■■■■■ 6.43
CHKB-205ENST00000468532 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP55.16■■■■■ 6.42
CHKB-205ENST00000468532 FGD5Q6ZNL6 1462 aa55.13■■■■■ 6.42
CHKB-205ENST00000468532 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa55.1■■■■■ 6.41
CHKB-205ENST00000468532 SOGA1O94964 1423 aa55.06■■■■■ 6.41
CHKB-205ENST00000468532 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP54.99■■■■■ 6.393e-8■■■■■ 28.1
CHKB-205ENST00000468532 OSCARQ8IYS5 282 aa54.89■■■■■ 6.38
CHKB-205ENST00000468532 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP54.82■■■■■ 6.37
CHKB-205ENST00000468532 WDR97A6NE52 1622 aa54.76■■■■■ 6.36
CHKB-205ENST00000468532 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP54.7■■■■■ 6.35
CHKB-205ENST00000468532 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa54.66■■■■■ 6.34
CHKB-205ENST00000468532 TOP2BQ02880 1626 aa54.64■■■■■ 6.34
CHKB-205ENST00000468532 SYNJ1O43426 1573 aa54.63■■■■■ 6.34
CHKB-205ENST00000468532 CHD1O14646 1710 aa54.57■■■■■ 6.33
CHKB-205ENST00000468532 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa54.54■■■■■ 6.32
CHKB-205ENST00000468532 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa54.5■■■■■ 6.32
CHKB-205ENST00000468532 GRIN2BQ13224 1484 aa54.48■■■■■ 6.31
CHKB-205ENST00000468532 FBLN2P98095 1184 aa54.44■■■■■ 6.31
CHKB-205ENST00000468532 GAPVD1Q14C86 1478 aa54.43■■■■■ 6.3
CHKB-205ENST00000468532 PBRM1Q86U86 1689 aa54.4■■■■■ 6.3
CHKB-205ENST00000468532 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa54.4■■■■■ 6.3
CHKB-205ENST00000468532 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP54.38■■■■■ 6.3
CHKB-205ENST00000468532 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP54.2■■■■■ 6.27
CHKB-205ENST00000468532 SYNJ2O15056 1496 aa54.18■■■■■ 6.26
CHKB-205ENST00000468532 TRIM41Q8WV44 630 aa54.14■■■■■ 6.26
CHKB-205ENST00000468532 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa54.13■■■■■ 6.26
CHKB-205ENST00000468532 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa54.13■■■■■ 6.26
CHKB-205ENST00000468532 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa54.13■■■■■ 6.26
CHKB-205ENST00000468532 ARHGEF11O15085 1522 aa54.05■■■■■ 6.24
CHKB-205ENST00000468532 CLASP1Q7Z460 1538 aa53.93■■■■■ 6.22
CHKB-205ENST00000468532 ADAMTS12P58397 1594 aa53.92■■■■■ 6.22
CHKB-205ENST00000468532 ERICH3Q5RHP9 1530 aa53.88■■■■■ 6.22
CHKB-205ENST00000468532 GRIN2AQ12879 1464 aa53.79■■■■■ 6.2
CHKB-205ENST00000468532 FHAD1B1AJZ9 1412 aa53.77■■■■■ 6.2
CHKB-205ENST00000468532 KIF27Q86VH2 1401 aa53.59■■■■■ 6.17
CHKB-205ENST00000468532 ARAP1Q96P48 1450 aa53.58■■■■■ 6.17
CHKB-205ENST00000468532 CEP170Q5SW79 1584 aa53.57■■■■■ 6.17
CHKB-205ENST00000468532 CYB5RLQ6IPT4 315 aa53.56■■■■■ 6.16
CHKB-205ENST00000468532 NUP160Q12769 1436 aa53.55■■■■■ 6.16
CHKB-205ENST00000468532 IGF1RP08069 1367 aa53.4■■■■■ 6.14
CHKB-205ENST00000468532 CUL7Q14999 1698 aa53.34■■■■■ 6.13
CHKB-205ENST00000468532 SHROOM2Q13796 1616 aa53.22■■■■■ 6.11
CHKB-205ENST00000468532 ERCC6L2Q5T890 1561 aa53.18■■■■■ 6.1
CHKB-205ENST00000468532 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa53.14■■■■■ 6.1
CHKB-205ENST00000468532 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa53.1■■■■■ 6.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms