RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468310.5

PRKCZ-208, Transcript of protein kinase C zeta, humanhuman

TSL 5

Gene PRKCZ, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZ-208ENST00000468310 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.45■■■■■ 6.15
PRKCZ-208ENST00000468310 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.9■■■■■ 5.26
PRKCZ-208ENST00000468310 ABCC9O60706 1549 aa47.63■■■■■ 5.22
PRKCZ-208ENST00000468310 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.47■■■■■ 4.87
PRKCZ-208ENST00000468310 NACADO15069 1562 aa45.2■■■■■ 4.83
PRKCZ-208ENST00000468310 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.08■■■■■ 4.81
PRKCZ-208ENST00000468310 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.6■■■■■ 4.73
PRKCZ-208ENST00000468310 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.47■■■■■ 4.71
PRKCZ-208ENST00000468310 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.37■■■■■ 4.69
PRKCZ-208ENST00000468310 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.36■■■■■ 4.69
PRKCZ-208ENST00000468310 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
PRKCZ-208ENST00000468310 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.14■■■■■ 4.66
PRKCZ-208ENST00000468310 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.08■■■■■ 4.65
PRKCZ-208ENST00000468310 SCRIBQ14160 1630 aa43.69■■■■■ 4.58
PRKCZ-208ENST00000468310 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.51■■■■■ 4.56
PRKCZ-208ENST00000468310 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.04■■■■■ 4.48
PRKCZ-208ENST00000468310 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
PRKCZ-208ENST00000468310 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.87■■■■■ 4.45
PRKCZ-208ENST00000468310 NCAPD3P42695 1498 aa41.67■■■■■ 4.26
PRKCZ-208ENST00000468310 SMARCA4P51532 1647 aa41.67■■■■■ 4.26
PRKCZ-208ENST00000468310 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.6■■■■■ 4.25
PRKCZ-208ENST00000468310 SMARCA2P51531 1590 aa41.54■■■■■ 4.24
PRKCZ-208ENST00000468310 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
PRKCZ-208ENST00000468310 HMGXB3Q12766 1538 aa41.43■■■■■ 4.22
PRKCZ-208ENST00000468310 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
PRKCZ-208ENST00000468310 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.22■■■■■ 4.19
PRKCZ-208ENST00000468310 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.2■■■■■ 4.19
PRKCZ-208ENST00000468310 ERCC6Q03468 1493 aa41.14■■■■■ 4.18
PRKCZ-208ENST00000468310 NESP48681 1621 aa40.98■■■■■ 4.15
PRKCZ-208ENST00000468310 CUX2O14529 1486 aa40.92■■■■■ 4.14
PRKCZ-208ENST00000468310 WIZO95785 1651 aa40.75■■■■■ 4.11
PRKCZ-208ENST00000468310 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.74■■■■■ 4.11
PRKCZ-208ENST00000468310 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.56■■■■■ 4.08
PRKCZ-208ENST00000468310 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
PRKCZ-208ENST00000468310 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.51■■■■■ 4.08
PRKCZ-208ENST00000468310 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.5■■■■■ 4.07
PRKCZ-208ENST00000468310 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.44■■■■■ 4.06
PRKCZ-208ENST00000468310 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
PRKCZ-208ENST00000468310 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
PRKCZ-208ENST00000468310 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.13■■■■■ 4.02
PRKCZ-208ENST00000468310 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.04■■■■■ 4
PRKCZ-208ENST00000468310 CFTRP13569 1480 aa40.03■■■■■ 4
PRKCZ-208ENST00000468310 WDR62O43379 1518 aa40.02■■■■■ 4
PRKCZ-208ENST00000468310 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40■■■■□ 3.99
PRKCZ-208ENST00000468310 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.76■■■■□ 3.96
PRKCZ-208ENST00000468310 PRDM2Q13029 1718 aa39.76■■■■□ 3.96
PRKCZ-208ENST00000468310 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
PRKCZ-208ENST00000468310 TOPBP1Q92547 1522 aa39.28■■■■□ 3.88
PRKCZ-208ENST00000468310 IFT140Q96RY7 1462 aa39.22■■■■□ 3.87
PRKCZ-208ENST00000468310 ABCC8Q09428 1581 aa39.21■■■■□ 3.87
PRKCZ-208ENST00000468310 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.17■■■■□ 3.86
PRKCZ-208ENST00000468310 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
PRKCZ-208ENST00000468310 OSCARQ8IYS5 282 aa39.1■■■■□ 3.85
PRKCZ-208ENST00000468310 TRIM41Q8WV44 630 aa38.98■■■■□ 3.83
PRKCZ-208ENST00000468310 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
PRKCZ-208ENST00000468310 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.92■■■■□ 3.82
PRKCZ-208ENST00000468310 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
PRKCZ-208ENST00000468310 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
PRKCZ-208ENST00000468310 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.8■■■■□ 3.8
PRKCZ-208ENST00000468310 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.74■■■■□ 3.79
PRKCZ-208ENST00000468310 SOGA1O94964 1423 aa38.72■■■■□ 3.79
PRKCZ-208ENST00000468310 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.7■■■■□ 3.79
PRKCZ-208ENST00000468310 CUX1P39880 1505 aa38.69■■■■□ 3.78
PRKCZ-208ENST00000468310 CHD1O14646 1710 aa38.65■■■■□ 3.78
PRKCZ-208ENST00000468310 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.61■■■■□ 3.77
PRKCZ-208ENST00000468310 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.6■■■■□ 3.77
PRKCZ-208ENST00000468310 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.6■■■■□ 3.77
PRKCZ-208ENST00000468310 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.6■■■■□ 3.77
PRKCZ-208ENST00000468310 FBLN2P98095 1184 aa38.55■■■■□ 3.76
PRKCZ-208ENST00000468310 WDR97A6NE52 1622 aa38.55■■■■□ 3.76
PRKCZ-208ENST00000468310 ARHGEF11O15085 1522 aa38.48■■■■□ 3.75
PRKCZ-208ENST00000468310 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.43■■■■□ 3.74
PRKCZ-208ENST00000468310 GRIN2BQ13224 1484 aa38.36■■■■□ 3.73
PRKCZ-208ENST00000468310 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
PRKCZ-208ENST00000468310 PBRM1Q86U86 1689 aa38.3■■■■□ 3.72
PRKCZ-208ENST00000468310 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
PRKCZ-208ENST00000468310 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.27■■■■□ 3.72
PRKCZ-208ENST00000468310 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.25■■■■□ 3.71
PRKCZ-208ENST00000468310 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.2■■■■□ 3.71
PRKCZ-208ENST00000468310 SYNJ2O15056 1496 aa38.2■■■■□ 3.71
PRKCZ-208ENST00000468310 SYNJ1O43426 1573 aa38.19■■■■□ 3.7
PRKCZ-208ENST00000468310 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.18■■■■□ 3.7
PRKCZ-208ENST00000468310 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.18■■■■□ 3.7
PRKCZ-208ENST00000468310 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.17■■■■□ 3.7
PRKCZ-208ENST00000468310 TOP2BQ02880 1626 aa38.16■■■■□ 3.7
PRKCZ-208ENST00000468310 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.14■■■■□ 3.7
PRKCZ-208ENST00000468310 ARAP1Q96P48 1450 aa38.1■■■■□ 3.69
PRKCZ-208ENST00000468310 ADAMTS12P58397 1594 aa37.9■■■■□ 3.66
PRKCZ-208ENST00000468310 GRIN2AQ12879 1464 aa37.86■■■■□ 3.65
PRKCZ-208ENST00000468310 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.79■■■■□ 3.64
PRKCZ-208ENST00000468310 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.78■■■■□ 3.64
PRKCZ-208ENST00000468310 CEP170Q5SW79 1584 aa37.73■■■■□ 3.63
PRKCZ-208ENST00000468310 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
PRKCZ-208ENST00000468310 NUP160Q12769 1436 aa37.7■■■■□ 3.62
PRKCZ-208ENST00000468310 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.58■■■■□ 3.61
PRKCZ-208ENST00000468310 SHROOM2Q13796 1616 aa37.54■■■■□ 3.6
PRKCZ-208ENST00000468310 KIF27Q86VH2 1401 aa37.43■■■■□ 3.58
PRKCZ-208ENST00000468310 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.36■■■■□ 3.57
PRKCZ-208ENST00000468310 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
PRKCZ-208ENST00000468310 CUL7Q14999 1698 aa37.34■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms