RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468249.1

ODF3B-208, Transcript of outer dense fiber of sperm tails 3B, human

TSL 1 (best)

Gene ODF3B, Length 1,722 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ODF3B-208	ENST00000468249	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.68	■■■■■ 6.66
ODF3B-208	ENST00000468249	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		49.37	■■■■■ 5.49
ODF3B-208	ENST00000468249	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	47.62	■■■■■ 5.21
ODF3B-208	ENST00000468249	ABCC9	O60706	1549 aa		47.29	■■■■■ 5.16
ODF3B-208	ENST00000468249	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.85	■■■■■ 5.09
ODF3B-208	ENST00000468249	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		46.84	■■■■■ 5.09
ODF3B-208	ENST00000468249	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		46.34	■■■■■ 5.01
ODF3B-208	ENST00000468249	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.25	■■■■■ 5
ODF3B-208	ENST00000468249	NACAD	O15069	1562 aa		45.96	■■■■■ 4.95
ODF3B-208	ENST00000468249	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		45.63	■■■■■ 4.9
ODF3B-208	ENST00000468249	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.43	■■■■■ 4.86
ODF3B-208	ENST00000468249	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	44.65	■■■■■ 4.74
ODF3B-208	ENST00000468249	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		44.64	■■■■■ 4.74
ODF3B-208	ENST00000468249	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	44.33	■■■■■ 4.69
ODF3B-208	ENST00000468249	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		44.31	■■■■■ 4.68
ODF3B-208	ENST00000468249	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.04	■■■■■ 4.64
ODF3B-208	ENST00000468249	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.01	■■■■■ 4.64
ODF3B-208	ENST00000468249	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.8	■■■■■ 4.6
ODF3B-208	ENST00000468249	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.76	■■■■■ 4.6
ODF3B-208	ENST00000468249	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.55	■■■■■ 4.56
ODF3B-208	ENST00000468249	WIZ	O95785	1651 aa		43.46	■■■■■ 4.55
ODF3B-208	ENST00000468249	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		43.11	■■■■■ 4.49
ODF3B-208	ENST00000468249	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	43.07	■■■■■ 4.49
ODF3B-208	ENST00000468249	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43	■■■■■ 4.47
ODF3B-208	ENST00000468249	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.99	■■■■■ 4.47
ODF3B-208	ENST00000468249	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		42.81	■■■■■ 4.44
ODF3B-208	ENST00000468249	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.79	■■■■■ 4.44
ODF3B-208	ENST00000468249	SMARCA2	P51531	1590 aa		42.79	■■■■■ 4.44
ODF3B-208	ENST00000468249	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		42.78	■■■■■ 4.44
ODF3B-208	ENST00000468249	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	42.58	■■■■■ 4.41
ODF3B-208	ENST00000468249	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.57	■■■■■ 4.41
ODF3B-208	ENST00000468249	NCAPD3	P42695	1498 aa		42.42	■■■■■ 4.38
ODF3B-208	ENST00000468249	HMGXB3	Q12766	1538 aa		42.37	■■■■■ 4.37
ODF3B-208	ENST00000468249	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.98	■■■■■ 4.31
ODF3B-208	ENST00000468249	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.71	■■■■■ 4.27
ODF3B-208	ENST00000468249	CFTR	P13569	1480 aa		41.51	■■■■■ 4.24
ODF3B-208	ENST00000468249	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.43	■■■■■ 4.22
ODF3B-208	ENST00000468249	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		41.36	■■■■■ 4.21
ODF3B-208	ENST00000468249	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.31	■■■■■ 4.2
ODF3B-208	ENST00000468249	SYNJ1	O43426	1573 aa		41.25	■■■■■ 4.19
ODF3B-208	ENST00000468249	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	41.22	■■■■■ 4.19
ODF3B-208	ENST00000468249	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.17	■■■■■ 4.18
ODF3B-208	ENST00000468249	NES	P48681	1621 aa		41.08	■■■■■ 4.17
ODF3B-208	ENST00000468249	TOP2B	Q02880	1626 aa		41.08	■■■■■ 4.17
ODF3B-208	ENST00000468249	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.04	■■■■■ 4.16
ODF3B-208	ENST00000468249	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		40.98	■■■■■ 4.15
ODF3B-208	ENST00000468249	SOGA1	O94964	1423 aa		40.95	■■■■■ 4.15
ODF3B-208	ENST00000468249	CUX1	P39880	1505 aa		40.94	■■■■■ 4.14
ODF3B-208	ENST00000468249	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		40.9	■■■■■ 4.14
ODF3B-208	ENST00000468249	EEA1	Q15075	1411 aa		40.9	■■■■■ 4.14
ODF3B-208	ENST00000468249	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		40.8	■■■■■ 4.12
ODF3B-208	ENST00000468249	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		40.72	■■■■■ 4.11
ODF3B-208	ENST00000468249	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		40.69	■■■■■ 4.1
ODF3B-208	ENST00000468249	ERCC6	Q03468	1493 aa		40.67	■■■■■ 4.1
ODF3B-208	ENST00000468249	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		40.64	■■■■■ 4.1
ODF3B-208	ENST00000468249	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		40.63	■■■■■ 4.09
ODF3B-208	ENST00000468249	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		40.55	■■■■■ 4.08
ODF3B-208	ENST00000468249	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		40.54	■■■■■ 4.08
ODF3B-208	ENST00000468249	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.49	■■■■■ 4.07
ODF3B-208	ENST00000468249	TOPBP1	Q92547	1522 aa		40.46	■■■■■ 4.07
ODF3B-208	ENST00000468249	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40.38	■■■■■ 4.05
ODF3B-208	ENST00000468249	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.05
ODF3B-208	ENST00000468249	KIF21B	O75037	1637 aa		40.35	■■■■■ 4.05
ODF3B-208	ENST00000468249	GOLGA3	Q08378	1498 aa		40.34	■■■■■ 4.05
ODF3B-208	ENST00000468249	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	40.3	■■■■■ 4.04
ODF3B-208	ENST00000468249	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.27	■■■■■ 4.04
ODF3B-208	ENST00000468249	CUX2	O14529	1486 aa		40.25	■■■■■ 4.03
ODF3B-208	ENST00000468249	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		40.25	■■■■■ 4.03
ODF3B-208	ENST00000468249	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		40.24	■■■■■ 4.03
ODF3B-208	ENST00000468249	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	40.19	■■■■■ 4.02
ODF3B-208	ENST00000468249	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.16	■■■■■ 4.02
ODF3B-208	ENST00000468249	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.12	■■■■■ 4.01
ODF3B-208	ENST00000468249	PRX	Q9BXM0	1461 aa		40.12	■■■■■ 4.01
ODF3B-208	ENST00000468249	WDR62	O43379	1518 aa		40.11	■■■■■ 4.01
ODF3B-208	ENST00000468249	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		40.11	■■■■■ 4.01
ODF3B-208	ENST00000468249	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.06	■■■■■ 4
ODF3B-208	ENST00000468249	CEP162	Q5TB80	1403 aa		40.02	■■■■■ 4
ODF3B-208	ENST00000468249	IGF1R	P08069	1367 aa		40.01	■■■■■ 4
ODF3B-208	ENST00000468249	WDR97	A6NE52	1622 aa		39.98	■■■■□ 3.99
ODF3B-208	ENST00000468249	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	39.85	■■■■□ 3.97
ODF3B-208	ENST00000468249	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		39.82	■■■■□ 3.97
ODF3B-208	ENST00000468249	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		39.78	■■■■□ 3.96
ODF3B-208	ENST00000468249	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	39.76	■■■■□ 3.96
ODF3B-208	ENST00000468249	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		39.71	■■■■□ 3.95
ODF3B-208	ENST00000468249	CLIP1	P30622	1438 aa		39.7	■■■■□ 3.95
ODF3B-208	ENST00000468249	CUL7	Q14999	1698 aa		39.69	■■■■□ 3.94
ODF3B-208	ENST00000468249	IFT140	Q96RY7	1462 aa		39.65	■■■■□ 3.94
ODF3B-208	ENST00000468249	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	39.51	■■■■□ 3.91
ODF3B-208	ENST00000468249	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	39.49	■■■■□ 3.91
ODF3B-208	ENST00000468249	PBRM1	Q86U86	1689 aa		39.48	■■■■□ 3.91
ODF3B-208	ENST00000468249	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	39.43	■■■■□ 3.9
ODF3B-208	ENST00000468249	GRIN2B	Q13224	1484 aa		39.39	■■■■□ 3.9
ODF3B-208	ENST00000468249	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		39.39	■■■■□ 3.9
ODF3B-208	ENST00000468249	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	39.37	■■■■□ 3.89
ODF3B-208	ENST00000468249	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		39.36	■■■■□ 3.89
ODF3B-208	ENST00000468249	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	39.29	■■■■□ 3.88
ODF3B-208	ENST00000468249	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.29	■■■■□ 3.88
ODF3B-208	ENST00000468249	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.29	■■■■□ 3.88
ODF3B-208	ENST00000468249	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		39.27	■■■■□ 3.88
ODF3B-208	ENST00000468249	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		39.27	■■■■□ 3.88

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