RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468170.1

GUCD1-208, Transcript of guanylyl cyclase domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene GUCD1, Length 619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GUCD1-208ENST00000468170 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.42■■■■■ 5.34
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GUCD1-208ENST00000468170 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.95■■■■■ 4.15
GUCD1-208ENST00000468170 NACADO15069 1562 aa40.77■■■■■ 4.12
GUCD1-208ENST00000468170 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.47■■■■■ 4.07
GUCD1-208ENST00000468170 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.36■■■■■ 4.05
GUCD1-208ENST00000468170 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.03
GUCD1-208ENST00000468170 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.25■■■■■ 4.03
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GUCD1-208ENST00000468170 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.94■■■■□ 3.98
GUCD1-208ENST00000468170 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.94■■■■□ 3.98
GUCD1-208ENST00000468170 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.92■■■■□ 3.98
GUCD1-208ENST00000468170 SCRIBQ14160 1630 aa39.49■■■■□ 3.91
GUCD1-208ENST00000468170 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.22■■■■□ 3.87
GUCD1-208ENST00000468170 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.8■■■■□ 3.8
GUCD1-208ENST00000468170 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.8■■■■□ 3.8
GUCD1-208ENST00000468170 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.54■■■■□ 3.76
GUCD1-208ENST00000468170 SMARCA4P51532 1647 aa37.72■■■■□ 3.63
GUCD1-208ENST00000468170 NCAPD3P42695 1498 aa37.64■■■■□ 3.62
GUCD1-208ENST00000468170 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.62■■■■□ 3.61
GUCD1-208ENST00000468170 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.59
GUCD1-208ENST00000468170 SMARCA2P51531 1590 aa37.47■■■■□ 3.59
GUCD1-208ENST00000468170 HMGXB3Q12766 1538 aa37.43■■■■□ 3.58
GUCD1-208ENST00000468170 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.38■■■■□ 3.57
GUCD1-208ENST00000468170 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.35■■■■□ 3.57
GUCD1-208ENST00000468170 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
GUCD1-208ENST00000468170 NESP48681 1621 aa37.03■■■■□ 3.52
GUCD1-208ENST00000468170 WIZO95785 1651 aa36.96■■■■□ 3.51
GUCD1-208ENST00000468170 ERCC6Q03468 1493 aa36.87■■■■□ 3.49
GUCD1-208ENST00000468170 CUX2O14529 1486 aa36.73■■■■□ 3.47
GUCD1-208ENST00000468170 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.73■■■■□ 3.47
GUCD1-208ENST00000468170 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
GUCD1-208ENST00000468170 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
GUCD1-208ENST00000468170 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.59■■■■□ 3.45
GUCD1-208ENST00000468170 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.48■■■■□ 3.43
GUCD1-208ENST00000468170 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
GUCD1-208ENST00000468170 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.4■■■■□ 3.42
GUCD1-208ENST00000468170 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.24■■■■□ 3.39
GUCD1-208ENST00000468170 CFTRP13569 1480 aa36.2■■■■□ 3.39
GUCD1-208ENST00000468170 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.16■■■■□ 3.38
GUCD1-208ENST00000468170 WDR62O43379 1518 aa36.12■■■■□ 3.37
GUCD1-208ENST00000468170 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.1■■■■□ 3.37
GUCD1-208ENST00000468170 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.08■■■■□ 3.37
GUCD1-208ENST00000468170 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.03■■■■□ 3.36
GUCD1-208ENST00000468170 PRDM2Q13029 1718 aa35.97■■■■□ 3.35
GUCD1-208ENST00000468170 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
GUCD1-208ENST00000468170 TOPBP1Q92547 1522 aa35.5■■■■□ 3.27
GUCD1-208ENST00000468170 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.4■■■■□ 3.26
GUCD1-208ENST00000468170 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
GUCD1-208ENST00000468170 IFT140Q96RY7 1462 aa35.33■■■■□ 3.25
GUCD1-208ENST00000468170 ABCC8Q09428 1581 aa35.3■■■■□ 3.24
GUCD1-208ENST00000468170 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
GUCD1-208ENST00000468170 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
GUCD1-208ENST00000468170 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
GUCD1-208ENST00000468170 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
GUCD1-208ENST00000468170 CUX1P39880 1505 aa35.09■■■■□ 3.21
GUCD1-208ENST00000468170 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.04■■■■□ 3.2
GUCD1-208ENST00000468170 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.02■■■■□ 3.29e-10■■■■■ 41.2
GUCD1-208ENST00000468170 OSCARQ8IYS5 282 aa35.01■■■■□ 3.2
GUCD1-208ENST00000468170 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.99■■■■□ 3.19
GUCD1-208ENST00000468170 SOGA1O94964 1423 aa34.92■■■■□ 3.18
GUCD1-208ENST00000468170 CHD1O14646 1710 aa34.87■■■■□ 3.17
GUCD1-208ENST00000468170 WDR97A6NE52 1622 aa34.85■■■■□ 3.17
GUCD1-208ENST00000468170 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
GUCD1-208ENST00000468170 TRIM41Q8WV44 630 aa34.76■■■■□ 3.16
GUCD1-208ENST00000468170 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.73■■■■□ 3.15
GUCD1-208ENST00000468170 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.73■■■■□ 3.15
GUCD1-208ENST00000468170 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.73■■■■□ 3.15
GUCD1-208ENST00000468170 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.68■■■■□ 3.14
GUCD1-208ENST00000468170 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.63■■■■□ 3.13
GUCD1-208ENST00000468170 SYNJ1O43426 1573 aa34.62■■■■□ 3.13
GUCD1-208ENST00000468170 ARHGEF11O15085 1522 aa34.62■■■■□ 3.13
GUCD1-208ENST00000468170 PBRM1Q86U86 1689 aa34.61■■■■□ 3.13
GUCD1-208ENST00000468170 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.6■■■■□ 3.13
GUCD1-208ENST00000468170 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.6■■■■□ 3.13
GUCD1-208ENST00000468170 TOP2BQ02880 1626 aa34.59■■■■□ 3.13
GUCD1-208ENST00000468170 GRIN2BQ13224 1484 aa34.58■■■■□ 3.13
GUCD1-208ENST00000468170 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
GUCD1-208ENST00000468170 FBLN2P98095 1184 aa34.54■■■■□ 3.12
GUCD1-208ENST00000468170 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.54■■■■□ 3.12
GUCD1-208ENST00000468170 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.53■■■■□ 3.12
GUCD1-208ENST00000468170 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.46■■■■□ 3.11
GUCD1-208ENST00000468170 SYNJ2O15056 1496 aa34.45■■■■□ 3.1
GUCD1-208ENST00000468170 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
GUCD1-208ENST00000468170 ARAP1Q96P48 1450 aa34.34■■■■□ 3.09
GUCD1-208ENST00000468170 ADAMTS12P58397 1594 aa34.29■■■■□ 3.08
GUCD1-208ENST00000468170 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.21■■■■□ 3.07
GUCD1-208ENST00000468170 GRIN2AQ12879 1464 aa34.19■■■■□ 3.06
GUCD1-208ENST00000468170 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.16■■■■□ 3.06
GUCD1-208ENST00000468170 CEP170Q5SW79 1584 aa34.13■■■■□ 3.05
GUCD1-208ENST00000468170 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.09■■■■□ 3.05
GUCD1-208ENST00000468170 NUP160Q12769 1436 aa34.08■■■■□ 3.05
GUCD1-208ENST00000468170 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.02■■■■□ 3.04
GUCD1-208ENST00000468170 SHROOM2Q13796 1616 aa33.95■■■■□ 3.03
GUCD1-208ENST00000468170 IGF1RP08069 1367 aa33.82■■■■□ 3
GUCD1-208ENST00000468170 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.81■■■■□ 3
GUCD1-208ENST00000468170 KIF27Q86VH2 1401 aa33.79■■■■□ 3
GUCD1-208ENST00000468170 CUL7Q14999 1698 aa33.75■■■□□ 2.99
GUCD1-208ENST00000468170 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
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