RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468077.5

TARBP1-204, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, human

TSL 3

Gene TARBP1, Length 514 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP1-204	ENST00000468077	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.56	■■■■□ 3.92
TARBP1-204	ENST00000468077	ABCC9	O60706	1549 aa		36.08	■■■■□ 3.37
TARBP1-204	ENST00000468077	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.75	■■■■□ 3.31
TARBP1-204	ENST00000468077	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		34.2	■■■■□ 3.07
TARBP1-204	ENST00000468077	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		34.06	■■■■□ 3.04
TARBP1-204	ENST00000468077	NACAD	O15069	1562 aa		33.85	■■■■□ 3.01
TARBP1-204	ENST00000468077	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.49	■■■□□ 2.95
TARBP1-204	ENST00000468077	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.46	■■■□□ 2.95
TARBP1-204	ENST00000468077	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.4	■■■□□ 2.94
TARBP1-204	ENST00000468077	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TARBP1-204	ENST00000468077	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TARBP1-204	ENST00000468077	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TARBP1-204	ENST00000468077	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
TARBP1-204	ENST00000468077	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TARBP1-204	ENST00000468077	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TARBP1-204	ENST00000468077	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TARBP1-204	ENST00000468077	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TARBP1-204	ENST00000468077	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
TARBP1-204	ENST00000468077	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		31.62	■■■□□ 2.65
TARBP1-204	ENST00000468077	CUX2	O14529	1486 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TARBP1-204	ENST00000468077	ERCC6	Q03468	1493 aa		31.23	■■■□□ 2.59
TARBP1-204	ENST00000468077	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.21	■■■□□ 2.59
TARBP1-204	ENST00000468077	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.08	■■■□□ 2.57
TARBP1-204	ENST00000468077	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.02	■■■□□ 2.56
TARBP1-204	ENST00000468077	HMGXB3	Q12766	1538 aa		31.02	■■■□□ 2.56
TARBP1-204	ENST00000468077	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.99	■■■□□ 2.55
TARBP1-204	ENST00000468077	NES	P48681	1621 aa		30.86	■■■□□ 2.53
TARBP1-204	ENST00000468077	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.8	■■■□□ 2.52
TARBP1-204	ENST00000468077	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.78	■■■□□ 2.52
TARBP1-204	ENST00000468077	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.7	■■■□□ 2.5
TARBP1-204	ENST00000468077	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.67	■■■□□ 2.5
TARBP1-204	ENST00000468077	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.63	■■■□□ 2.49
TARBP1-204	ENST00000468077	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.5	■■■□□ 2.47
TARBP1-204	ENST00000468077	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.47	■■■□□ 2.47
TARBP1-204	ENST00000468077	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.45	■■■□□ 2.46
TARBP1-204	ENST00000468077	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.24	■■■□□ 2.43
TARBP1-204	ENST00000468077	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		30.24	■■■□□ 2.43
TARBP1-204	ENST00000468077	WDR62	O43379	1518 aa		30.17	■■■□□ 2.42
TARBP1-204	ENST00000468077	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.12	■■■□□ 2.41
TARBP1-204	ENST00000468077	WIZ	O95785	1651 aa		30.09	■■■□□ 2.41
TARBP1-204	ENST00000468077	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		30.05	■■■□□ 2.4
TARBP1-204	ENST00000468077	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.94	■■■□□ 2.38
TARBP1-204	ENST00000468077	CFTR	P13569	1480 aa		29.83	■■■□□ 2.37
TARBP1-204	ENST00000468077	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
TARBP1-204	ENST00000468077	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.71	■■■□□ 2.35
TARBP1-204	ENST00000468077	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
TARBP1-204	ENST00000468077	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.67	■■■□□ 2.34
TARBP1-204	ENST00000468077	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.58	■■■□□ 2.33
TARBP1-204	ENST00000468077	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.45	■■■□□ 2.3
TARBP1-204	ENST00000468077	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.45	■■■□□ 2.3
TARBP1-204	ENST00000468077	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.45	■■■□□ 2.3
TARBP1-204	ENST00000468077	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.44	■■■□□ 2.3
TARBP1-204	ENST00000468077	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.4	■■■□□ 2.3
TARBP1-204	ENST00000468077	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.33	■■■□□ 2.29
TARBP1-204	ENST00000468077	ARHGEF11	O15085	1522 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TARBP1-204	ENST00000468077	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TARBP1-204	ENST00000468077	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.29	■■■□□ 2.28
TARBP1-204	ENST00000468077	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.24	■■■□□ 2.27
TARBP1-204	ENST00000468077	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.22	■■■□□ 2.27
TARBP1-204	ENST00000468077	CHD1	O14646	1710 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TARBP1-204	ENST00000468077	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
TARBP1-204	ENST00000468077	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.06	■■■□□ 2.24
TARBP1-204	ENST00000468077	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TARBP1-204	ENST00000468077	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
TARBP1-204	ENST00000468077	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TARBP1-204	ENST00000468077	FBLN2	P98095	1184 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TARBP1-204	ENST00000468077	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TARBP1-204	ENST00000468077	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TARBP1-204	ENST00000468077	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TARBP1-204	ENST00000468077	SOGA1	O94964	1423 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TARBP1-204	ENST00000468077	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TARBP1-204	ENST00000468077	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
TARBP1-204	ENST00000468077	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TARBP1-204	ENST00000468077	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TARBP1-204	ENST00000468077	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TARBP1-204	ENST00000468077	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
TARBP1-204	ENST00000468077	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TARBP1-204	ENST00000468077	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
TARBP1-204	ENST00000468077	CUX1	P39880	1505 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TARBP1-204	ENST00000468077	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TARBP1-204	ENST00000468077	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TARBP1-204	ENST00000468077	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.51	■■■□□ 2.15
TARBP1-204	ENST00000468077	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TARBP1-204	ENST00000468077	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.42	■■■□□ 2.14
TARBP1-204	ENST00000468077	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
TARBP1-204	ENST00000468077	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TARBP1-204	ENST00000468077	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TARBP1-204	ENST00000468077	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TARBP1-204	ENST00000468077	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.22	■■■□□ 2.11
TARBP1-204	ENST00000468077	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TARBP1-204	ENST00000468077	NUP160	Q12769	1436 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TARBP1-204	ENST00000468077	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.14	■■■□□ 2.1
TARBP1-204	ENST00000468077	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.14	■■■□□ 2.09
TARBP1-204	ENST00000468077	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TARBP1-204	ENST00000468077	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TARBP1-204	ENST00000468077	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TARBP1-204	ENST00000468077	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
TARBP1-204	ENST00000468077	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TARBP1-204	ENST00000468077	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
TARBP1-204	ENST00000468077	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.89	■■■□□ 2.06

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