RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467683.5

UBE2Q1-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 370 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-202ENST00000467683 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.34■■■□□ 2.29
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UBE2Q1-202ENST00000467683 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.56■■□□□ 1.84
UBE2Q1-202ENST00000467683 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2Q1-202ENST00000467683 NACADO15069 1562 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2Q1-202ENST00000467683 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2Q1-202ENST00000467683 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.72■■□□□ 1.55
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UBE2Q1-202ENST00000467683 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.34■■□□□ 1.49
UBE2Q1-202ENST00000467683 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.29■■□□□ 1.48
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
UBE2Q1-202ENST00000467683 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.12■■□□□ 1.45
UBE2Q1-202ENST00000467683 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.06■■□□□ 1.44
UBE2Q1-202ENST00000467683 SCRIBQ14160 1630 aa24.06■■□□□ 1.44
UBE2Q1-202ENST00000467683 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
UBE2Q1-202ENST00000467683 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2Q1-202ENST00000467683 CUX2O14529 1486 aa23.17■■□□□ 1.3
UBE2Q1-202ENST00000467683 NCAPD3P42695 1498 aa23.14■■□□□ 1.29
UBE2Q1-202ENST00000467683 ERCC6Q03468 1493 aa23.07■■□□□ 1.28
UBE2Q1-202ENST00000467683 SMARCA2P51531 1590 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-202ENST00000467683 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-202ENST00000467683 HMGXB3Q12766 1538 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-202ENST00000467683 SMARCA4P51532 1647 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1-202ENST00000467683 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
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UBE2Q1-202ENST00000467683 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 NESP48681 1621 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1-202ENST00000467683 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1-202ENST00000467683 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1-202ENST00000467683 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.56■■□□□ 1.2
UBE2Q1-202ENST00000467683 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2Q1-202ENST00000467683 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2Q1-202ENST00000467683 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q1-202ENST00000467683 WDR62O43379 1518 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1-202ENST00000467683 WIZO95785 1651 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1-202ENST00000467683 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 TRIM41Q8WV44 630 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 CFTRP13569 1480 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1-202ENST00000467683 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1-202ENST00000467683 PRDM2Q13029 1718 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2Q1-202ENST00000467683 OSCARQ8IYS5 282 aa21.98■■□□□ 1.11
UBE2Q1-202ENST00000467683 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1-202ENST00000467683 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
UBE2Q1-202ENST00000467683 IFT140Q96RY7 1462 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 ABCC8Q09428 1581 aa21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 TOPBP1Q92547 1522 aa21.71■■□□□ 1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
UBE2Q1-202ENST00000467683 ARHGEF11O15085 1522 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2Q1-202ENST00000467683 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.65■■□□□ 1.06
UBE2Q1-202ENST00000467683 CHD1O14646 1710 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-202ENST00000467683 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1-202ENST00000467683 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 29.1
UBE2Q1-202ENST00000467683 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-202ENST00000467683 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-202ENST00000467683 WDR97A6NE52 1622 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-202ENST00000467683 ARAP1Q96P48 1450 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2Q1-202ENST00000467683 FBLN2P98095 1184 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2Q1-202ENST00000467683 SOGA1O94964 1423 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2Q1-202ENST00000467683 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2Q1-202ENST00000467683 SYNJ1O43426 1573 aa21.3■■□□□ 1
UBE2Q1-202ENST00000467683 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.29■■□□□ 1
UBE2Q1-202ENST00000467683 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.29■■□□□ 1
UBE2Q1-202ENST00000467683 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.29■■□□□ 1
UBE2Q1-202ENST00000467683 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
UBE2Q1-202ENST00000467683 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
UBE2Q1-202ENST00000467683 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
UBE2Q1-202ENST00000467683 GRIN2BQ13224 1484 aa21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1-202ENST00000467683 CUX1P39880 1505 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1-202ENST00000467683 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1-202ENST00000467683 SYNJ2O15056 1496 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-202ENST00000467683 PBRM1Q86U86 1689 aa21.19■□□□□ 0.98
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UBE2Q1-202ENST00000467683 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.08■□□□□ 0.97
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UBE2Q1-202ENST00000467683 ADAMTS12P58397 1594 aa20.93■□□□□ 0.94
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UBE2Q1-202ENST00000467683 NUP160Q12769 1436 aa20.89■□□□□ 0.94
UBE2Q1-202ENST00000467683 SHROOM2Q13796 1616 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1-202ENST00000467683 CEP170Q5SW79 1584 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1-202ENST00000467683 TOP2BQ02880 1626 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1-202ENST00000467683 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1-202ENST00000467683 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2Q1-202ENST00000467683 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.83■□□□□ 0.92
UBE2Q1-202ENST00000467683 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2Q1-202ENST00000467683 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
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UBE2Q1-202ENST00000467683 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.65■□□□□ 0.9
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