RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467204.1

HCN3-202, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

TSL 5

Gene HCN3, Length 957 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-202ENST00000467204 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.66■■■□□ 2.18
HCN3-202ENST00000467204 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.57■■□□□ 1.68
HCN3-202ENST00000467204 ABCC9O60706 1549 aa25.46■■□□□ 1.67
HCN3-202ENST00000467204 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.26■■□□□ 1.47
HCN3-202ENST00000467204 NACADO15069 1562 aa24.16■■□□□ 1.46
HCN3-202ENST00000467204 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.1■■□□□ 1.45
HCN3-202ENST00000467204 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.89■■□□□ 1.42
HCN3-202ENST00000467204 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
HCN3-202ENST00000467204 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.77■■□□□ 1.4
HCN3-202ENST00000467204 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
HCN3-202ENST00000467204 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.7■■□□□ 1.39
HCN3-202ENST00000467204 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.67■■□□□ 1.38
HCN3-202ENST00000467204 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.61■■□□□ 1.37
HCN3-202ENST00000467204 SCRIBQ14160 1630 aa23.36■■□□□ 1.33
HCN3-202ENST00000467204 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.26■■□□□ 1.31
HCN3-202ENST00000467204 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
HCN3-202ENST00000467204 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.99■■□□□ 1.27
HCN3-202ENST00000467204 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.91■■□□□ 1.26
HCN3-202ENST00000467204 NCAPD3P42695 1498 aa22.34■■□□□ 1.17
HCN3-202ENST00000467204 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.3■■□□□ 1.16
HCN3-202ENST00000467204 SMARCA4P51532 1647 aa22.3■■□□□ 1.16
HCN3-202ENST00000467204 SMARCA2P51531 1590 aa22.21■■□□□ 1.15
HCN3-202ENST00000467204 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HCN3-202ENST00000467204 HMGXB3Q12766 1538 aa22.16■■□□□ 1.14
HCN3-202ENST00000467204 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.11■■□□□ 1.13
HCN3-202ENST00000467204 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.08■■□□□ 1.13
HCN3-202ENST00000467204 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HCN3-202ENST00000467204 NESP48681 1621 aa21.95■■□□□ 1.1
HCN3-202ENST00000467204 ERCC6Q03468 1493 aa21.93■■□□□ 1.1
HCN3-202ENST00000467204 CUX2O14529 1486 aa21.83■■□□□ 1.09
HCN3-202ENST00000467204 WIZO95785 1651 aa21.82■■□□□ 1.08
HCN3-202ENST00000467204 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.76■■□□□ 1.07
HCN3-202ENST00000467204 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
HCN3-202ENST00000467204 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.67■■□□□ 1.06
HCN3-202ENST00000467204 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HCN3-202ENST00000467204 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.64■■□□□ 1.05
HCN3-202ENST00000467204 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.63■■□□□ 1.05
HCN3-202ENST00000467204 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.6■■□□□ 1.05
HCN3-202ENST00000467204 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HCN3-202ENST00000467204 CFTRP13569 1480 aa21.46■■□□□ 1.03
HCN3-202ENST00000467204 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.45■■□□□ 1.03
HCN3-202ENST00000467204 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.41■■□□□ 1.02
HCN3-202ENST00000467204 WDR62O43379 1518 aa21.4■■□□□ 1.02
HCN3-202ENST00000467204 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.39■■□□□ 1.02
HCN3-202ENST00000467204 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.33■■□□□ 1.01
HCN3-202ENST00000467204 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
HCN3-202ENST00000467204 PRDM2Q13029 1718 aa21.17■□□□□ 0.98
HCN3-202ENST00000467204 TOPBP1Q92547 1522 aa21.04■□□□□ 0.96
HCN3-202ENST00000467204 IFT140Q96RY7 1462 aa20.98■□□□□ 0.95
HCN3-202ENST00000467204 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
HCN3-202ENST00000467204 ABCC8Q09428 1581 aa20.95■□□□□ 0.94
HCN3-202ENST00000467204 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.95■□□□□ 0.94
HCN3-202ENST00000467204 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
HCN3-202ENST00000467204 OSCARQ8IYS5 282 aa20.88■□□□□ 0.93
HCN3-202ENST00000467204 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HCN3-202ENST00000467204 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
HCN3-202ENST00000467204 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HCN3-202ENST00000467204 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 33.8
HCN3-202ENST00000467204 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.78■□□□□ 0.92
HCN3-202ENST00000467204 TRIM41Q8WV44 630 aa20.76■□□□□ 0.91
HCN3-202ENST00000467204 CUX1P39880 1505 aa20.75■□□□□ 0.91
HCN3-202ENST00000467204 SOGA1O94964 1423 aa20.73■□□□□ 0.91
HCN3-202ENST00000467204 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.73■□□□□ 0.91
HCN3-202ENST00000467204 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
HCN3-202ENST00000467204 CHD1O14646 1710 aa20.59■□□□□ 0.89
HCN3-202ENST00000467204 WDR97A6NE52 1622 aa20.58■□□□□ 0.89
HCN3-202ENST00000467204 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.58■□□□□ 0.89
HCN3-202ENST00000467204 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.58■□□□□ 0.89
HCN3-202ENST00000467204 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.58■□□□□ 0.89
HCN3-202ENST00000467204 FBLN2P98095 1184 aa20.58■□□□□ 0.89
HCN3-202ENST00000467204 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.57■□□□□ 0.88
HCN3-202ENST00000467204 ARHGEF11O15085 1522 aa20.55■□□□□ 0.88
HCN3-202ENST00000467204 GRIN2BQ13224 1484 aa20.52■□□□□ 0.88
HCN3-202ENST00000467204 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.5■□□□□ 0.87
HCN3-202ENST00000467204 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HCN3-202ENST00000467204 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.48■□□□□ 0.87
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HCN3-202ENST00000467204 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HCN3-202ENST00000467204 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.45■□□□□ 0.86
HCN3-202ENST00000467204 SYNJ1O43426 1573 aa20.44■□□□□ 0.86
HCN3-202ENST00000467204 TOP2BQ02880 1626 aa20.44■□□□□ 0.86
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HCN3-202ENST00000467204 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.43■□□□□ 0.86
HCN3-202ENST00000467204 PBRM1Q86U86 1689 aa20.42■□□□□ 0.86
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HCN3-202ENST00000467204 NUP160Q12769 1436 aa20.21■□□□□ 0.83
HCN3-202ENST00000467204 CEP170Q5SW79 1584 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN3-202ENST00000467204 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.13■□□□□ 0.81
HCN3-202ENST00000467204 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HCN3-202ENST00000467204 SHROOM2Q13796 1616 aa20.07■□□□□ 0.8
HCN3-202ENST00000467204 IGF1RP08069 1367 aa20.06■□□□□ 0.8
HCN3-202ENST00000467204 KIF27Q86VH2 1401 aa20.05■□□□□ 0.8
HCN3-202ENST00000467204 JPH4Q96JJ6 628 aa19.99■□□□□ 0.79
HCN3-202ENST00000467204 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
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