RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467070.1

GALE-209, Transcript of UDP-galactose-4-epimerase, humanhuman

TSL 3

Gene GALE, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALE-209ENST00000467070 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.36■■■■■ 5.65
GALE-209ENST00000467070 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.72■■■■■ 4.75
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GALE-209ENST00000467070 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
GALE-209ENST00000467070 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.01■■■■■ 4.32
GALE-209ENST00000467070 NACADO15069 1562 aa41.99■■■■■ 4.31
GALE-209ENST00000467070 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.96■■■■■ 4.31
GALE-209ENST00000467070 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.79■■■■■ 4.28
GALE-209ENST00000467070 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.68■■■■■ 4.26
GALE-209ENST00000467070 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.01■■■■■ 4.16
GALE-209ENST00000467070 SCRIBQ14160 1630 aa40.83■■■■■ 4.13
GALE-209ENST00000467070 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.71■■■■■ 4.11
GALE-209ENST00000467070 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.7■■■■■ 4.11
GALE-209ENST00000467070 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.34■■■■■ 4.05
GALE-209ENST00000467070 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.75■■■■□ 3.95
GALE-209ENST00000467070 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.63■■■■□ 3.94
GALE-209ENST00000467070 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.42■■■■□ 3.9
GALE-209ENST00000467070 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.19■■■■□ 3.86
GALE-209ENST00000467070 SMARCA4P51532 1647 aa39.05■■■■□ 3.84
GALE-209ENST00000467070 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.04■■■■□ 3.84
GALE-209ENST00000467070 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.81■■■■□ 3.8
GALE-209ENST00000467070 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.78■■■■□ 3.8
GALE-209ENST00000467070 SMARCA2P51531 1590 aa38.77■■■■□ 3.8
GALE-209ENST00000467070 NCAPD3P42695 1498 aa38.72■■■■□ 3.79
GALE-209ENST00000467070 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.65■■■■□ 3.78
GALE-209ENST00000467070 HMGXB3Q12766 1538 aa38.59■■■■□ 3.77
GALE-209ENST00000467070 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
GALE-209ENST00000467070 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.42■■■■□ 3.74
GALE-209ENST00000467070 WIZO95785 1651 aa38.39■■■■□ 3.74
GALE-209ENST00000467070 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
GALE-209ENST00000467070 NESP48681 1621 aa37.75■■■■□ 3.63
GALE-209ENST00000467070 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.7■■■■□ 3.63
GALE-209ENST00000467070 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.6■■■■□ 3.61
GALE-209ENST00000467070 ERCC6Q03468 1493 aa37.58■■■■□ 3.61
GALE-209ENST00000467070 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
GALE-209ENST00000467070 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.54■■■■□ 3.6
GALE-209ENST00000467070 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.44■■■■□ 3.58
GALE-209ENST00000467070 CFTRP13569 1480 aa37.43■■■■□ 3.58
GALE-209ENST00000467070 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.31■■■■□ 3.56
GALE-209ENST00000467070 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.2■■■■□ 3.55
GALE-209ENST00000467070 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
GALE-209ENST00000467070 PRDM2Q13029 1718 aa37.17■■■■□ 3.54
GALE-209ENST00000467070 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.16■■■■□ 3.54
GALE-209ENST00000467070 CUX2O14529 1486 aa37.1■■■■□ 3.53
GALE-209ENST00000467070 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.06■■■■□ 3.52
GALE-209ENST00000467070 WDR62O43379 1518 aa36.93■■■■□ 3.5
GALE-209ENST00000467070 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
GALE-209ENST00000467070 ABCC8Q09428 1581 aa36.62■■■■□ 3.45
GALE-209ENST00000467070 TOPBP1Q92547 1522 aa36.62■■■■□ 3.45
GALE-209ENST00000467070 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.61■■■■□ 3.45
GALE-209ENST00000467070 CUX1P39880 1505 aa36.41■■■■□ 3.42
GALE-209ENST00000467070 IFT140Q96RY7 1462 aa36.36■■■■□ 3.41
GALE-209ENST00000467070 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.41
GALE-209ENST00000467070 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.27■■■■□ 3.4
GALE-209ENST00000467070 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.25■■■■□ 3.39
GALE-209ENST00000467070 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
GALE-209ENST00000467070 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
GALE-209ENST00000467070 SOGA1O94964 1423 aa36.16■■■■□ 3.38
GALE-209ENST00000467070 SYNJ1O43426 1573 aa36.15■■■■□ 3.38
GALE-209ENST00000467070 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.15■■■■□ 3.38
GALE-209ENST00000467070 TOP2BQ02880 1626 aa36.15■■■■□ 3.38
GALE-209ENST00000467070 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.14■■■■□ 3.38
GALE-209ENST00000467070 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
GALE-209ENST00000467070 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.96■■■■□ 3.351e-6■■■■□ 21.9
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GALE-209ENST00000467070 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
GALE-209ENST00000467070 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.92■■■■□ 3.34
GALE-209ENST00000467070 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.77■■■■□ 3.32
GALE-209ENST00000467070 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.76■■■■□ 3.32
GALE-209ENST00000467070 GRIN2BQ13224 1484 aa35.74■■■■□ 3.31
GALE-209ENST00000467070 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.69■■■■□ 3.3
GALE-209ENST00000467070 PBRM1Q86U86 1689 aa35.68■■■■□ 3.3
GALE-209ENST00000467070 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.68■■■■□ 3.3
GALE-209ENST00000467070 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
GALE-209ENST00000467070 CHD1O14646 1710 aa35.55■■■■□ 3.28
GALE-209ENST00000467070 OSCARQ8IYS5 282 aa35.54■■■■□ 3.28
GALE-209ENST00000467070 FBLN2P98095 1184 aa35.5■■■■□ 3.27
GALE-209ENST00000467070 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.5■■■■□ 3.27
GALE-209ENST00000467070 SYNJ2O15056 1496 aa35.49■■■■□ 3.27
GALE-209ENST00000467070 KIF27Q86VH2 1401 aa35.48■■■■□ 3.27
GALE-209ENST00000467070 TRIM41Q8WV44 630 aa35.47■■■■□ 3.27
GALE-209ENST00000467070 ADAMTS12P58397 1594 aa35.44■■■■□ 3.26
GALE-209ENST00000467070 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
GALE-209ENST00000467070 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.36■■■■□ 3.25
GALE-209ENST00000467070 GRIN2AQ12879 1464 aa35.29■■■■□ 3.24
GALE-209ENST00000467070 IGF1RP08069 1367 aa35.26■■■■□ 3.24
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GALE-209ENST00000467070 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.18■■■■□ 3.22
GALE-209ENST00000467070 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.16■■■■□ 3.22
GALE-209ENST00000467070 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.13■■■■□ 3.21
GALE-209ENST00000467070 NUP160Q12769 1436 aa35.11■■■■□ 3.21
GALE-209ENST00000467070 CEP170Q5SW79 1584 aa35.1■■■■□ 3.21
GALE-209ENST00000467070 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.08■■■■□ 3.21
GALE-209ENST00000467070 ARHGEF11O15085 1522 aa35.01■■■■□ 3.2
GALE-209ENST00000467070 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.99■■■■□ 3.19
GALE-209ENST00000467070 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.99■■■■□ 3.19
GALE-209ENST00000467070 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.99■■■■□ 3.19
GALE-209ENST00000467070 EEA1Q15075 1411 aa34.92■■■■□ 3.18
GALE-209ENST00000467070 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.91■■■■□ 3.18
GALE-209ENST00000467070 SHROOM2Q13796 1616 aa34.83■■■■□ 3.17
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