RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466671.5

EML3-209, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, humanhuman

TSL 4

Gene EML3, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EML3-209ENST00000466671 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.9■■■■□ 3.34
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EML3-209ENST00000466671 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.49■■■□□ 2.47
EML3-209ENST00000466671 NACADO15069 1562 aa30.33■■■□□ 2.45
EML3-209ENST00000466671 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.1■■■□□ 2.41
EML3-209ENST00000466671 MYO15BQ96JP2 1530 aa30■■■□□ 2.39
EML3-209ENST00000466671 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.9■■■□□ 2.38
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EML3-209ENST00000466671 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
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EML3-209ENST00000466671 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.64■■■□□ 2.33
EML3-209ENST00000466671 SCRIBQ14160 1630 aa29.29■■■□□ 2.28
EML3-209ENST00000466671 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.23■■■□□ 2.27
EML3-209ENST00000466671 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.87■■■□□ 2.21
EML3-209ENST00000466671 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
EML3-209ENST00000466671 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.72■■■□□ 2.19
EML3-209ENST00000466671 NCAPD3P42695 1498 aa27.99■■■□□ 2.07
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EML3-209ENST00000466671 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.93■■■□□ 2.06
EML3-209ENST00000466671 SMARCA2P51531 1590 aa27.87■■■□□ 2.05
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EML3-209ENST00000466671 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.73■■■□□ 2.03
EML3-209ENST00000466671 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.66■■■□□ 2.02
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EML3-209ENST00000466671 NESP48681 1621 aa27.49■■□□□ 1.99
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EML3-209ENST00000466671 WIZO95785 1651 aa27.36■■□□□ 1.97
EML3-209ENST00000466671 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.35■■□□□ 1.97
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EML3-209ENST00000466671 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.19■■□□□ 1.94
EML3-209ENST00000466671 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.17■■□□□ 1.94
EML3-209ENST00000466671 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
EML3-209ENST00000466671 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.14■■□□□ 1.93
EML3-209ENST00000466671 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.12■■□□□ 1.93
EML3-209ENST00000466671 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
EML3-209ENST00000466671 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.91■■□□□ 1.9
EML3-209ENST00000466671 CFTRP13569 1480 aa26.88■■□□□ 1.89
EML3-209ENST00000466671 WDR62O43379 1518 aa26.86■■□□□ 1.89
EML3-209ENST00000466671 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.84■■□□□ 1.89
EML3-209ENST00000466671 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.83■■□□□ 1.89
EML3-209ENST00000466671 PRDM2Q13029 1718 aa26.72■■□□□ 1.87
EML3-209ENST00000466671 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.69■■□□□ 1.86
EML3-209ENST00000466671 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
EML3-209ENST00000466671 TOPBP1Q92547 1522 aa26.36■■□□□ 1.81
EML3-209ENST00000466671 IFT140Q96RY7 1462 aa26.3■■□□□ 1.8
EML3-209ENST00000466671 ABCC8Q09428 1581 aa26.29■■□□□ 1.8
EML3-209ENST00000466671 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.29■■□□□ 1.8
EML3-209ENST00000466671 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
EML3-209ENST00000466671 OSCARQ8IYS5 282 aa26.17■■□□□ 1.78
EML3-209ENST00000466671 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
EML3-209ENST00000466671 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
EML3-209ENST00000466671 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
EML3-209ENST00000466671 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
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EML3-209ENST00000466671 TRIM41Q8WV44 630 aa26.01■■□□□ 1.75
EML3-209ENST00000466671 CUX1P39880 1505 aa25.98■■□□□ 1.75
EML3-209ENST00000466671 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.98■■□□□ 1.75
EML3-209ENST00000466671 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.96■■□□□ 1.75
EML3-209ENST00000466671 SOGA1O94964 1423 aa25.96■■□□□ 1.75
EML3-209ENST00000466671 CHD1O14646 1710 aa25.93■■□□□ 1.74
EML3-209ENST00000466671 WDR97A6NE52 1622 aa25.88■■□□□ 1.73
EML3-209ENST00000466671 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.88■■□□□ 1.73
EML3-209ENST00000466671 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.88■■□□□ 1.73
EML3-209ENST00000466671 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.88■■□□□ 1.73
EML3-209ENST00000466671 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
EML3-209ENST00000466671 ARHGEF11O15085 1522 aa25.8■■□□□ 1.72
EML3-209ENST00000466671 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.76■■□□□ 1.71
EML3-209ENST00000466671 FBLN2P98095 1184 aa25.74■■□□□ 1.71
EML3-209ENST00000466671 GRIN2BQ13224 1484 aa25.72■■□□□ 1.71
EML3-209ENST00000466671 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
EML3-209ENST00000466671 PBRM1Q86U86 1689 aa25.7■■□□□ 1.7
EML3-209ENST00000466671 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.68■■□□□ 1.7
EML3-209ENST00000466671 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.66■■□□□ 1.7
EML3-209ENST00000466671 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.66■■□□□ 1.7
EML3-209ENST00000466671 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.65■■□□□ 1.7
EML3-209ENST00000466671 TOP2BQ02880 1626 aa25.63■■□□□ 1.69
EML3-209ENST00000466671 SYNJ2O15056 1496 aa25.62■■□□□ 1.69
EML3-209ENST00000466671 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.62■■□□□ 1.69
EML3-209ENST00000466671 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
EML3-209ENST00000466671 SYNJ1O43426 1573 aa25.61■■□□□ 1.69
EML3-209ENST00000466671 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.69
EML3-209ENST00000466671 ARAP1Q96P48 1450 aa25.56■■□□□ 1.68
EML3-209ENST00000466671 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.54■■□□□ 1.68
EML3-209ENST00000466671 ADAMTS12P58397 1594 aa25.44■■□□□ 1.66
EML3-209ENST00000466671 GRIN2AQ12879 1464 aa25.4■■□□□ 1.66
EML3-209ENST00000466671 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.37■■□□□ 1.65
EML3-209ENST00000466671 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.33■■□□□ 1.65
EML3-209ENST00000466671 CEP170Q5SW79 1584 aa25.33■■□□□ 1.65
EML3-209ENST00000466671 NUP160Q12769 1436 aa25.32■■□□□ 1.64
EML3-209ENST00000466671 SHROOM2Q13796 1616 aa25.23■■□□□ 1.63
EML3-209ENST00000466671 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.22■■□□□ 1.63
EML3-209ENST00000466671 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
EML3-209ENST00000466671 KIF27Q86VH2 1401 aa25.09■■□□□ 1.61
EML3-209ENST00000466671 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.08■■□□□ 1.61
EML3-209ENST00000466671 IGF1RP08069 1367 aa25.06■■□□□ 1.6
EML3-209ENST00000466671 CUL7Q14999 1698 aa25.06■■□□□ 1.6
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