RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466657.1

SIKE1-205, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIKE1, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-205ENST00000466657 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.97■■■■■ 4.79
SIKE1-205ENST00000466657 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.42■■■■■ 4.06
SIKE1-205ENST00000466657 ABCC9O60706 1549 aa40.02■■■■■ 4
SIKE1-205ENST00000466657 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.28■■■■□ 3.72
SIKE1-205ENST00000466657 NACADO15069 1562 aa38.08■■■■□ 3.69
SIKE1-205ENST00000466657 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.69■■■■□ 3.62
SIKE1-205ENST00000466657 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.58■■■■□ 3.61
SIKE1-205ENST00000466657 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.57■■■■□ 3.6
SIKE1-205ENST00000466657 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.38■■■■□ 3.57
SIKE1-205ENST00000466657 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
SIKE1-205ENST00000466657 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.25■■■■□ 3.55
SIKE1-205ENST00000466657 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.21■■■■□ 3.55
SIKE1-205ENST00000466657 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.19■■■■□ 3.54
SIKE1-205ENST00000466657 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.76■■■■□ 3.48
SIKE1-205ENST00000466657 SCRIBQ14160 1630 aa36.67■■■■□ 3.46
SIKE1-205ENST00000466657 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.26■■■■□ 3.4
SIKE1-205ENST00000466657 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
SIKE1-205ENST00000466657 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.06■■■■□ 3.36
SIKE1-205ENST00000466657 NCAPD3P42695 1498 aa35.13■■■■□ 3.21
SIKE1-205ENST00000466657 SMARCA4P51532 1647 aa35.08■■■■□ 3.21
SIKE1-205ENST00000466657 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.02■■■■□ 3.2
SIKE1-205ENST00000466657 SMARCA2P51531 1590 aa34.96■■■■□ 3.19
SIKE1-205ENST00000466657 HMGXB3Q12766 1538 aa34.94■■■■□ 3.18
SIKE1-205ENST00000466657 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
SIKE1-205ENST00000466657 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.81■■■■□ 3.16
SIKE1-205ENST00000466657 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
SIKE1-205ENST00000466657 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.62■■■■□ 3.13
SIKE1-205ENST00000466657 ERCC6Q03468 1493 aa34.52■■■■□ 3.12
SIKE1-205ENST00000466657 CUX2O14529 1486 aa34.52■■■■□ 3.12
SIKE1-205ENST00000466657 NESP48681 1621 aa34.45■■■■□ 3.11
SIKE1-205ENST00000466657 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.35■■■■□ 3.09
SIKE1-205ENST00000466657 WIZO95785 1651 aa34.25■■■■□ 3.07
SIKE1-205ENST00000466657 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.22■■■■□ 3.07
SIKE1-205ENST00000466657 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
SIKE1-205ENST00000466657 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.15■■■■□ 3.06
SIKE1-205ENST00000466657 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.04■■■■□ 3.04
SIKE1-205ENST00000466657 CADPSQ9ULU8 1353 aa34■■■■□ 3.03
SIKE1-205ENST00000466657 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.02
SIKE1-205ENST00000466657 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
SIKE1-205ENST00000466657 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.76■■■■□ 3
SIKE1-205ENST00000466657 WDR62O43379 1518 aa33.74■■■□□ 2.99
SIKE1-205ENST00000466657 CFTRP13569 1480 aa33.7■■■□□ 2.99
SIKE1-205ENST00000466657 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.65■■■□□ 2.98
SIKE1-205ENST00000466657 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.63■■■□□ 2.97
SIKE1-205ENST00000466657 PRDM2Q13029 1718 aa33.56■■■□□ 2.96
SIKE1-205ENST00000466657 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.39■■■□□ 2.94
SIKE1-205ENST00000466657 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
SIKE1-205ENST00000466657 TOPBP1Q92547 1522 aa33.04■■■□□ 2.88
SIKE1-205ENST00000466657 ABCC8Q09428 1581 aa33■■■□□ 2.87
SIKE1-205ENST00000466657 IFT140Q96RY7 1462 aa32.99■■■□□ 2.87
SIKE1-205ENST00000466657 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.96■■■□□ 2.87
SIKE1-205ENST00000466657 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
SIKE1-205ENST00000466657 OSCARQ8IYS5 282 aa32.84■■■□□ 2.85
SIKE1-205ENST00000466657 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
SIKE1-205ENST00000466657 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
SIKE1-205ENST00000466657 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
SIKE1-205ENST00000466657 TRIM41Q8WV44 630 aa32.64■■■□□ 2.82
SIKE1-205ENST00000466657 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.58■■■□□ 2.818e-7■■■□□ 16
SIKE1-205ENST00000466657 CHD1O14646 1710 aa32.57■■■□□ 2.8
SIKE1-205ENST00000466657 CUX1P39880 1505 aa32.53■■■□□ 2.8
SIKE1-205ENST00000466657 WDR97A6NE52 1622 aa32.53■■■□□ 2.8
SIKE1-205ENST00000466657 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.53■■■□□ 2.8
SIKE1-205ENST00000466657 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.53■■■□□ 2.8
SIKE1-205ENST00000466657 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.53■■■□□ 2.8
SIKE1-205ENST00000466657 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.53■■■□□ 2.8
SIKE1-205ENST00000466657 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.51■■■□□ 2.79
SIKE1-205ENST00000466657 SOGA1O94964 1423 aa32.5■■■□□ 2.79
SIKE1-205ENST00000466657 ARHGEF11O15085 1522 aa32.41■■■□□ 2.78
SIKE1-205ENST00000466657 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
SIKE1-205ENST00000466657 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
SIKE1-205ENST00000466657 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.28■■■□□ 2.76
SIKE1-205ENST00000466657 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
SIKE1-205ENST00000466657 PBRM1Q86U86 1689 aa32.24■■■□□ 2.75
SIKE1-205ENST00000466657 GRIN2BQ13224 1484 aa32.23■■■□□ 2.75
SIKE1-205ENST00000466657 FBLN2P98095 1184 aa32.2■■■□□ 2.75
SIKE1-205ENST00000466657 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.2■■■□□ 2.74
SIKE1-205ENST00000466657 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.18■■■□□ 2.74
SIKE1-205ENST00000466657 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.17■■■□□ 2.74
SIKE1-205ENST00000466657 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.15■■■□□ 2.74
SIKE1-205ENST00000466657 SYNJ2O15056 1496 aa32.14■■■□□ 2.74
SIKE1-205ENST00000466657 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.14■■■□□ 2.74
SIKE1-205ENST00000466657 SYNJ1O43426 1573 aa32.12■■■□□ 2.73
SIKE1-205ENST00000466657 TOP2BQ02880 1626 aa32.11■■■□□ 2.73
SIKE1-205ENST00000466657 ARAP1Q96P48 1450 aa32.1■■■□□ 2.73
SIKE1-205ENST00000466657 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
SIKE1-205ENST00000466657 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.02■■■□□ 2.72
SIKE1-205ENST00000466657 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.01■■■□□ 2.71
SIKE1-205ENST00000466657 ADAMTS12P58397 1594 aa31.9■■■□□ 2.7
SIKE1-205ENST00000466657 GRIN2AQ12879 1464 aa31.84■■■□□ 2.69
SIKE1-205ENST00000466657 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.8■■■□□ 2.68
SIKE1-205ENST00000466657 CEP170Q5SW79 1584 aa31.76■■■□□ 2.67
SIKE1-205ENST00000466657 NUP160Q12769 1436 aa31.75■■■□□ 2.67
SIKE1-205ENST00000466657 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.75■■■□□ 2.67
SIKE1-205ENST00000466657 SHROOM2Q13796 1616 aa31.68■■■□□ 2.66
SIKE1-205ENST00000466657 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.62■■■□□ 2.65
SIKE1-205ENST00000466657 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
SIKE1-205ENST00000466657 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.46■■■□□ 2.63
SIKE1-205ENST00000466657 CUL7Q14999 1698 aa31.41■■■□□ 2.62
SIKE1-205ENST00000466657 KIF27Q86VH2 1401 aa31.38■■■□□ 2.61
SIKE1-205ENST00000466657 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
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