RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466244.1

RAB17-209, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB17, Length 937 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17-209ENST00000466244 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.85■■■■□ 3.49
RAB17-209ENST00000466244 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.77■■■□□ 2.84
RAB17-209ENST00000466244 ABCC9O60706 1549 aa31.82■■■□□ 2.68
RAB17-209ENST00000466244 NACADO15069 1562 aa30.77■■■□□ 2.52
RAB17-209ENST00000466244 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.74■■■□□ 2.51
RAB17-209ENST00000466244 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
RAB17-209ENST00000466244 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.74■■■□□ 2.51
RAB17-209ENST00000466244 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.6■■■□□ 2.49
RAB17-209ENST00000466244 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.41■■■□□ 2.46
RAB17-209ENST00000466244 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.05■■■□□ 2.4
RAB17-209ENST00000466244 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.88■■■□□ 2.37
RAB17-209ENST00000466244 SCRIBQ14160 1630 aa29.74■■■□□ 2.35
RAB17-209ENST00000466244 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.69■■■□□ 2.345e-11■□□□□ 9.6
RAB17-209ENST00000466244 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.66■■■□□ 2.34
RAB17-209ENST00000466244 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.2■■■□□ 2.26
RAB17-209ENST00000466244 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
RAB17-209ENST00000466244 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.86■■■□□ 2.21
RAB17-209ENST00000466244 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.66■■■□□ 2.18
RAB17-209ENST00000466244 SMARCA4P51532 1647 aa28.56■■■□□ 2.16
RAB17-209ENST00000466244 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
RAB17-209ENST00000466244 NCAPD3P42695 1498 aa28.42■■■□□ 2.14
RAB17-209ENST00000466244 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.4■■■□□ 2.14
RAB17-209ENST00000466244 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.4■■■□□ 2.14
RAB17-209ENST00000466244 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.37■■■□□ 2.13
RAB17-209ENST00000466244 SMARCA2P51531 1590 aa28.36■■■□□ 2.13
RAB17-209ENST00000466244 HMGXB3Q12766 1538 aa28.29■■■□□ 2.12
RAB17-209ENST00000466244 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
RAB17-209ENST00000466244 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
RAB17-209ENST00000466244 WIZO95785 1651 aa28.02■■■□□ 2.08
RAB17-209ENST00000466244 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
RAB17-209ENST00000466244 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.62■■■□□ 2.01
RAB17-209ENST00000466244 NESP48681 1621 aa27.59■■■□□ 2.01
RAB17-209ENST00000466244 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.52■■■□□ 2
RAB17-209ENST00000466244 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.43■■□□□ 1.98
RAB17-209ENST00000466244 CFTRP13569 1480 aa27.43■■□□□ 1.98
RAB17-209ENST00000466244 ERCC6Q03468 1493 aa27.38■■□□□ 1.97
RAB17-209ENST00000466244 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.37■■□□□ 1.97
RAB17-209ENST00000466244 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.28■■□□□ 1.96
RAB17-209ENST00000466244 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
RAB17-209ENST00000466244 CUX2O14529 1486 aa27.23■■□□□ 1.95
RAB17-209ENST00000466244 PRDM2Q13029 1718 aa27.19■■□□□ 1.94
RAB17-209ENST00000466244 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.19■■□□□ 1.94
RAB17-209ENST00000466244 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
RAB17-209ENST00000466244 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.13■■□□□ 1.93
RAB17-209ENST00000466244 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.11■■□□□ 1.93
RAB17-209ENST00000466244 WDR62O43379 1518 aa27.07■■□□□ 1.92
RAB17-209ENST00000466244 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
RAB17-209ENST00000466244 ABCC8Q09428 1581 aa26.8■■□□□ 1.88
RAB17-209ENST00000466244 TOPBP1Q92547 1522 aa26.78■■□□□ 1.88
RAB17-209ENST00000466244 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.76■■□□□ 1.87
RAB17-209ENST00000466244 CUX1P39880 1505 aa26.61■■□□□ 1.85
RAB17-209ENST00000466244 IFT140Q96RY7 1462 aa26.6■■□□□ 1.85
RAB17-209ENST00000466244 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
RAB17-209ENST00000466244 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
RAB17-209ENST00000466244 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.48■■□□□ 1.83
RAB17-209ENST00000466244 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
RAB17-209ENST00000466244 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.82
RAB17-209ENST00000466244 TOP2BQ02880 1626 aa26.43■■□□□ 1.82
RAB17-209ENST00000466244 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.43■■□□□ 1.82
RAB17-209ENST00000466244 SOGA1O94964 1423 aa26.39■■□□□ 1.82
RAB17-209ENST00000466244 SYNJ1O43426 1573 aa26.38■■□□□ 1.81
RAB17-209ENST00000466244 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.38■■□□□ 1.81
RAB17-209ENST00000466244 WDR97A6NE52 1622 aa26.37■■□□□ 1.81
RAB17-209ENST00000466244 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
RAB17-209ENST00000466244 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.29■■□□□ 1.8
RAB17-209ENST00000466244 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.82e-7■■■□□ 17.8
RAB17-209ENST00000466244 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.26■■□□□ 1.79
RAB17-209ENST00000466244 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
RAB17-209ENST00000466244 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.19■■□□□ 1.78
RAB17-209ENST00000466244 GRIN2BQ13224 1484 aa26.12■■□□□ 1.77
RAB17-209ENST00000466244 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.11■■□□□ 1.77
RAB17-209ENST00000466244 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
RAB17-209ENST00000466244 PBRM1Q86U86 1689 aa26.05■■□□□ 1.76
RAB17-209ENST00000466244 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.04■■□□□ 1.76
RAB17-209ENST00000466244 OSCARQ8IYS5 282 aa25.99■■□□□ 1.75
RAB17-209ENST00000466244 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.98■■□□□ 1.75
RAB17-209ENST00000466244 CHD1O14646 1710 aa25.97■■□□□ 1.75
RAB17-209ENST00000466244 SYNJ2O15056 1496 aa25.96■■□□□ 1.75
RAB17-209ENST00000466244 ADAMTS12P58397 1594 aa25.9■■□□□ 1.74
RAB17-209ENST00000466244 KIF27Q86VH2 1401 aa25.86■■□□□ 1.73
RAB17-209ENST00000466244 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.84■■□□□ 1.73
RAB17-209ENST00000466244 GRIN2AQ12879 1464 aa25.8■■□□□ 1.72
RAB17-209ENST00000466244 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.8■■□□□ 1.72
RAB17-209ENST00000466244 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
RAB17-209ENST00000466244 IGF1RP08069 1367 aa25.79■■□□□ 1.72
RAB17-209ENST00000466244 FBLN2P98095 1184 aa25.77■■□□□ 1.72
RAB17-209ENST00000466244 NUP160Q12769 1436 aa25.73■■□□□ 1.71
RAB17-209ENST00000466244 CUL7Q14999 1698 aa25.72■■□□□ 1.71
RAB17-209ENST00000466244 TRIM41Q8WV44 630 aa25.71■■□□□ 1.71
RAB17-209ENST00000466244 CEP170Q5SW79 1584 aa25.67■■□□□ 1.7
RAB17-209ENST00000466244 ARHGEF11O15085 1522 aa25.64■■□□□ 1.7
RAB17-209ENST00000466244 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.63■■□□□ 1.69
RAB17-209ENST00000466244 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.62■■□□□ 1.69
RAB17-209ENST00000466244 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.62■■□□□ 1.69
RAB17-209ENST00000466244 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.62■■□□□ 1.69
RAB17-209ENST00000466244 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.58■■□□□ 1.69
RAB17-209ENST00000466244 SHROOM2Q13796 1616 aa25.55■■□□□ 1.68
RAB17-209ENST00000466244 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.53■■□□□ 1.68
RAB17-209ENST00000466244 PRXQ9BXM0 1461 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB17-209ENST00000466244 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms