RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466177.6

PELI1-202, Transcript of pellino E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 5

Gene PELI1, Length 698 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI1-202ENST00000466177 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.12■■■■■ 5.93
PELI1-202ENST00000466177 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.78■■■■■ 5.08
PELI1-202ENST00000466177 ABCC9O60706 1549 aa46.72■■■■■ 5.07
PELI1-202ENST00000466177 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.52■■■■■ 4.72
PELI1-202ENST00000466177 NACADO15069 1562 aa44.22■■■■■ 4.67
PELI1-202ENST00000466177 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.01■■■■■ 4.64
PELI1-202ENST00000466177 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.76■■■■■ 4.6
PELI1-202ENST00000466177 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.63■■■■■ 4.57
PELI1-202ENST00000466177 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.5■■■■■ 4.55
PELI1-202ENST00000466177 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.48■■■■■ 4.55
PELI1-202ENST00000466177 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.51
PELI1-202ENST00000466177 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.16■■■■■ 4.5
PELI1-202ENST00000466177 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.07■■■■■ 4.49
PELI1-202ENST00000466177 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.66■■■■■ 4.42
PELI1-202ENST00000466177 SCRIBQ14160 1630 aa42.6■■■■■ 4.41
PELI1-202ENST00000466177 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.21■■■■■ 4.35
PELI1-202ENST00000466177 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
PELI1-202ENST00000466177 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.1■■■■■ 4.33
PELI1-202ENST00000466177 NCAPD3P42695 1498 aa40.81■■■■■ 4.12
PELI1-202ENST00000466177 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.68■■■■■ 4.1
PELI1-202ENST00000466177 SMARCA4P51532 1647 aa40.65■■■■■ 4.1
PELI1-202ENST00000466177 SMARCA2P51531 1590 aa40.61■■■■■ 4.09
PELI1-202ENST00000466177 HMGXB3Q12766 1538 aa40.52■■■■■ 4.08
PELI1-202ENST00000466177 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
PELI1-202ENST00000466177 ERCC6Q03468 1493 aa40.38■■■■■ 4.05
PELI1-202ENST00000466177 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
PELI1-202ENST00000466177 CUX2O14529 1486 aa40.29■■■■■ 4.04
PELI1-202ENST00000466177 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.27■■■■■ 4.04
PELI1-202ENST00000466177 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.21■■■■■ 4.03
PELI1-202ENST00000466177 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.14■■■■■ 4.02
PELI1-202ENST00000466177 NESP48681 1621 aa40.13■■■■■ 4.01
PELI1-202ENST00000466177 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.91■■■■□ 3.98
PELI1-202ENST00000466177 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
PELI1-202ENST00000466177 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.69■■■■□ 3.94
PELI1-202ENST00000466177 WIZO95785 1651 aa39.67■■■■□ 3.94
PELI1-202ENST00000466177 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.63■■■■□ 3.93
PELI1-202ENST00000466177 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.59■■■■□ 3.93
PELI1-202ENST00000466177 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
PELI1-202ENST00000466177 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.31■■■■□ 3.88
PELI1-202ENST00000466177 WDR62O43379 1518 aa39.21■■■■□ 3.87
PELI1-202ENST00000466177 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
PELI1-202ENST00000466177 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.17■■■■□ 3.86
PELI1-202ENST00000466177 CFTRP13569 1480 aa39.13■■■■□ 3.85
PELI1-202ENST00000466177 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.12■■■■□ 3.85
PELI1-202ENST00000466177 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
PELI1-202ENST00000466177 PRDM2Q13029 1718 aa38.77■■■■□ 3.8
PELI1-202ENST00000466177 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.73■■■■□ 3.79
PELI1-202ENST00000466177 OSCARQ8IYS5 282 aa38.47■■■■□ 3.75
PELI1-202ENST00000466177 TRIM41Q8WV44 630 aa38.47■■■■□ 3.75
PELI1-202ENST00000466177 IFT140Q96RY7 1462 aa38.4■■■■□ 3.74
PELI1-202ENST00000466177 TOPBP1Q92547 1522 aa38.38■■■■□ 3.74
PELI1-202ENST00000466177 ABCC8Q09428 1581 aa38.36■■■■□ 3.73
PELI1-202ENST00000466177 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
PELI1-202ENST00000466177 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.26■■■■□ 3.72
PELI1-202ENST00000466177 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.1■■■■□ 3.69
PELI1-202ENST00000466177 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
PELI1-202ENST00000466177 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.99■■■■□ 3.67
PELI1-202ENST00000466177 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.96■■■■□ 3.67
PELI1-202ENST00000466177 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.93■■■■□ 3.66
PELI1-202ENST00000466177 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.93■■■■□ 3.66
PELI1-202ENST00000466177 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.93■■■■□ 3.66
PELI1-202ENST00000466177 SOGA1O94964 1423 aa37.84■■■■□ 3.65
PELI1-202ENST00000466177 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.84■■■■□ 3.65
PELI1-202ENST00000466177 ARHGEF11O15085 1522 aa37.82■■■■□ 3.64
PELI1-202ENST00000466177 CHD1O14646 1710 aa37.81■■■■□ 3.64
PELI1-202ENST00000466177 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.76■■■■□ 3.63
PELI1-202ENST00000466177 FBLN2P98095 1184 aa37.75■■■■□ 3.63
PELI1-202ENST00000466177 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
PELI1-202ENST00000466177 CUX1P39880 1505 aa37.71■■■■□ 3.63
PELI1-202ENST00000466177 WDR97A6NE52 1622 aa37.7■■■■□ 3.63
PELI1-202ENST00000466177 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
PELI1-202ENST00000466177 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.58■■■■□ 3.61
PELI1-202ENST00000466177 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.56■■■■□ 3.6
PELI1-202ENST00000466177 GRIN2BQ13224 1484 aa37.52■■■■□ 3.6
PELI1-202ENST00000466177 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
PELI1-202ENST00000466177 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
PELI1-202ENST00000466177 ARAP1Q96P48 1450 aa37.43■■■■□ 3.58
PELI1-202ENST00000466177 SYNJ1O43426 1573 aa37.4■■■■□ 3.58
PELI1-202ENST00000466177 SYNJ2O15056 1496 aa37.38■■■■□ 3.57
PELI1-202ENST00000466177 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.38■■■■□ 3.57
PELI1-202ENST00000466177 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.37■■■■□ 3.57
PELI1-202ENST00000466177 PBRM1Q86U86 1689 aa37.35■■■■□ 3.57
PELI1-202ENST00000466177 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.35■■■■□ 3.57
PELI1-202ENST00000466177 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.27■■■■□ 3.56
PELI1-202ENST00000466177 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.22■■■■□ 3.55
PELI1-202ENST00000466177 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
PELI1-202ENST00000466177 TOP2BQ02880 1626 aa37.14■■■■□ 3.54
PELI1-202ENST00000466177 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.14■■■■□ 3.54
PELI1-202ENST00000466177 GRIN2AQ12879 1464 aa37.01■■■■□ 3.52
PELI1-202ENST00000466177 ADAMTS12P58397 1594 aa36.99■■■■□ 3.51
PELI1-202ENST00000466177 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.91■■■■□ 3.5
PELI1-202ENST00000466177 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.89■■■■□ 3.5
PELI1-202ENST00000466177 NUP160Q12769 1436 aa36.88■■■■□ 3.49
PELI1-202ENST00000466177 CEP170Q5SW79 1584 aa36.86■■■■□ 3.49
PELI1-202ENST00000466177 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.77■■■■□ 3.48
PELI1-202ENST00000466177 SHROOM2Q13796 1616 aa36.71■■■■□ 3.47
PELI1-202ENST00000466177 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
PELI1-202ENST00000466177 JPH4Q96JJ6 628 aa36.54■■■■□ 3.44
PELI1-202ENST00000466177 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.46■■■■□ 3.43
PELI1-202ENST00000466177 KIF27Q86VH2 1401 aa36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.9 ms