RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466165.1

PRKRA-208, Transcript of protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2, humanhuman

TSL 2

Gene PRKRA, Length 585 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRA-208ENST00000466165 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.06■■■■■ 4.16
PRKRA-208ENST00000466165 ABCC9O60706 1549 aa37.93■■■■□ 3.66
PRKRA-208ENST00000466165 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.15■■■■□ 3.54
PRKRA-208ENST00000466165 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.31■■■■□ 3.4
PRKRA-208ENST00000466165 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.78■■■■□ 3.32
PRKRA-208ENST00000466165 NACADO15069 1562 aa35.36■■■■□ 3.25
PRKRA-208ENST00000466165 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.25■■■■□ 3.23
PRKRA-208ENST00000466165 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.13■■■■□ 3.21
PRKRA-208ENST00000466165 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.9■■■■□ 3.18
PRKRA-208ENST00000466165 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.71■■■■□ 3.15
PRKRA-208ENST00000466165 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.6■■■■□ 3.13
PRKRA-208ENST00000466165 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.27■■■■□ 3.08
PRKRA-208ENST00000466165 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.21■■■■□ 3.07
PRKRA-208ENST00000466165 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.21■■■■□ 3.07
PRKRA-208ENST00000466165 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.97■■■■□ 3.03
PRKRA-208ENST00000466165 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
PRKRA-208ENST00000466165 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.87■■■■□ 3.01
PRKRA-208ENST00000466165 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3.01
PRKRA-208ENST00000466165 SCRIBQ14160 1630 aa33.79■■■■□ 3
PRKRA-208ENST00000466165 CUX2O14529 1486 aa33.03■■■□□ 2.88
PRKRA-208ENST00000466165 ERCC6Q03468 1493 aa32.84■■■□□ 2.85
PRKRA-208ENST00000466165 NCAPD3P42695 1498 aa32.67■■■□□ 2.82
PRKRA-208ENST00000466165 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.43■■■□□ 2.78
PRKRA-208ENST00000466165 NESP48681 1621 aa32.34■■■□□ 2.77
PRKRA-208ENST00000466165 SMARCA2P51531 1590 aa32.31■■■□□ 2.76
PRKRA-208ENST00000466165 HMGXB3Q12766 1538 aa32.3■■■□□ 2.76
PRKRA-208ENST00000466165 SMARCA4P51532 1647 aa32.17■■■□□ 2.74
PRKRA-208ENST00000466165 TRIM41Q8WV44 630 aa32.14■■■□□ 2.74
PRKRA-208ENST00000466165 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
PRKRA-208ENST00000466165 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
PRKRA-208ENST00000466165 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.02■■■□□ 2.72
PRKRA-208ENST00000466165 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
PRKRA-208ENST00000466165 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.92■■■□□ 2.7
PRKRA-208ENST00000466165 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.88■■■□□ 2.69
PRKRA-208ENST00000466165 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.86■■■□□ 2.69
PRKRA-208ENST00000466165 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.66■■■□□ 2.66
PRKRA-208ENST00000466165 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.64■■■□□ 2.66
PRKRA-208ENST00000466165 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.6■■■□□ 2.65
PRKRA-208ENST00000466165 WDR62O43379 1518 aa31.55■■■□□ 2.64
PRKRA-208ENST00000466165 OSCARQ8IYS5 282 aa31.5■■■□□ 2.63
PRKRA-208ENST00000466165 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.36■■■□□ 2.61
PRKRA-208ENST00000466165 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.26■■■□□ 2.59
PRKRA-208ENST00000466165 WIZO95785 1651 aa31.19■■■□□ 2.58
PRKRA-208ENST00000466165 CFTRP13569 1480 aa31.09■■■□□ 2.57
PRKRA-208ENST00000466165 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.03■■■□□ 2.56
PRKRA-208ENST00000466165 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.03■■■□□ 2.56
PRKRA-208ENST00000466165 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.03■■■□□ 2.56
PRKRA-208ENST00000466165 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
PRKRA-208ENST00000466165 ARHGEF11O15085 1522 aa30.86■■■□□ 2.53
PRKRA-208ENST00000466165 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.79■■■□□ 2.52
PRKRA-208ENST00000466165 IFT140Q96RY7 1462 aa30.78■■■□□ 2.52
PRKRA-208ENST00000466165 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
PRKRA-208ENST00000466165 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
PRKRA-208ENST00000466165 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
PRKRA-208ENST00000466165 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
PRKRA-208ENST00000466165 PRDM2Q13029 1718 aa30.67■■■□□ 2.5
PRKRA-208ENST00000466165 TOPBP1Q92547 1522 aa30.57■■■□□ 2.48
PRKRA-208ENST00000466165 ABCC8Q09428 1581 aa30.53■■■□□ 2.48
PRKRA-208ENST00000466165 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
PRKRA-208ENST00000466165 ARAP1Q96P48 1450 aa30.5■■■□□ 2.47
PRKRA-208ENST00000466165 FBLN2P98095 1184 aa30.46■■■□□ 2.47
PRKRA-208ENST00000466165 CHD1O14646 1710 aa30.46■■■□□ 2.47
PRKRA-208ENST00000466165 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.44■■■□□ 2.46
PRKRA-208ENST00000466165 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.44■■■□□ 2.463e-6■■■■□ 24.7
PRKRA-208ENST00000466165 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
PRKRA-208ENST00000466165 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.37■■■□□ 2.45
PRKRA-208ENST00000466165 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
PRKRA-208ENST00000466165 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
PRKRA-208ENST00000466165 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.41
PRKRA-208ENST00000466165 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
PRKRA-208ENST00000466165 SOGA1O94964 1423 aa30.12■■■□□ 2.41
PRKRA-208ENST00000466165 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.12■■■□□ 2.41
PRKRA-208ENST00000466165 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.09■■■□□ 2.41
PRKRA-208ENST00000466165 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.06■■■□□ 2.4
PRKRA-208ENST00000466165 SYNJ1O43426 1573 aa30.05■■■□□ 2.4
PRKRA-208ENST00000466165 WDR97A6NE52 1622 aa30■■■□□ 2.39
PRKRA-208ENST00000466165 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
PRKRA-208ENST00000466165 GRIN2BQ13224 1484 aa29.91■■■□□ 2.38
PRKRA-208ENST00000466165 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.9■■■□□ 2.38
PRKRA-208ENST00000466165 SYNJ2O15056 1496 aa29.89■■■□□ 2.38
PRKRA-208ENST00000466165 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.88■■■□□ 2.37
PRKRA-208ENST00000466165 CUX1P39880 1505 aa29.74■■■□□ 2.35
PRKRA-208ENST00000466165 PBRM1Q86U86 1689 aa29.67■■■□□ 2.34
PRKRA-208ENST00000466165 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.56■■■□□ 2.32
PRKRA-208ENST00000466165 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.53■■■□□ 2.32
PRKRA-208ENST00000466165 GRIN2AQ12879 1464 aa29.5■■■□□ 2.31
PRKRA-208ENST00000466165 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.5■■■□□ 2.31
PRKRA-208ENST00000466165 CEP170Q5SW79 1584 aa29.47■■■□□ 2.31
PRKRA-208ENST00000466165 NUP160Q12769 1436 aa29.44■■■□□ 2.3
PRKRA-208ENST00000466165 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.41■■■□□ 2.3
PRKRA-208ENST00000466165 SHROOM2Q13796 1616 aa29.36■■■□□ 2.29
PRKRA-208ENST00000466165 ADAMTS12P58397 1594 aa29.35■■■□□ 2.29
PRKRA-208ENST00000466165 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.3■■■□□ 2.28
PRKRA-208ENST00000466165 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.3■■■□□ 2.28
PRKRA-208ENST00000466165 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.28■■■□□ 2.28
PRKRA-208ENST00000466165 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.27
PRKRA-208ENST00000466165 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
PRKRA-208ENST00000466165 JPH4Q96JJ6 628 aa29.23■■■□□ 2.27
PRKRA-208ENST00000466165 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.2■■■□□ 2.26
PRKRA-208ENST00000466165 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 262 ms