RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466071.1

LTC4S-204, Transcript of leukotriene C4 synthase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LTC4S, Length 564 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4S-204ENST00000466071 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.69■■■■■ 8.59
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LTC4S-204ENST00000466071 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.23■■■■■ 6.91
LTC4S-204ENST00000466071 NACADO15069 1562 aa57.95■■■■■ 6.87
LTC4S-204ENST00000466071 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.8■■■■■ 6.84
LTC4S-204ENST00000466071 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.3■■■■■ 6.76
LTC4S-204ENST00000466071 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.03■■■■■ 6.72
LTC4S-204ENST00000466071 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.95■■■■■ 6.71
LTC4S-204ENST00000466071 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.82■■■■■ 6.69
LTC4S-204ENST00000466071 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.76■■■■■ 6.68
LTC4S-204ENST00000466071 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.69■■■■■ 6.67
LTC4S-204ENST00000466071 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.5■■■■■ 6.64
LTC4S-204ENST00000466071 SCRIBQ14160 1630 aa56.01■■■■■ 6.56
LTC4S-204ENST00000466071 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.77■■■■■ 6.52
LTC4S-204ENST00000466071 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.07■■■■■ 6.41
LTC4S-204ENST00000466071 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.07■■■■■ 6.41
LTC4S-204ENST00000466071 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.83■■■■■ 6.37
LTC4S-204ENST00000466071 SMARCA4P51532 1647 aa53.49■■■■■ 6.15
LTC4S-204ENST00000466071 NCAPD3P42695 1498 aa53.47■■■■■ 6.15
LTC4S-204ENST00000466071 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.39■■■■■ 6.14
LTC4S-204ENST00000466071 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.29■■■■■ 6.12
LTC4S-204ENST00000466071 SMARCA2P51531 1590 aa53.28■■■■■ 6.12
LTC4S-204ENST00000466071 HMGXB3Q12766 1538 aa53.13■■■■■ 6.1
LTC4S-204ENST00000466071 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.95■■■■■ 6.07
LTC4S-204ENST00000466071 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.94■■■■■ 6.07
LTC4S-204ENST00000466071 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.92■■■■■ 6.06
LTC4S-204ENST00000466071 ERCC6Q03468 1493 aa52.57■■■■■ 6.01
LTC4S-204ENST00000466071 NESP48681 1621 aa52.49■■■■■ 5.99
LTC4S-204ENST00000466071 WIZO95785 1651 aa52.35■■■■■ 5.97
LTC4S-204ENST00000466071 CUX2O14529 1486 aa52.29■■■■■ 5.96
LTC4S-204ENST00000466071 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.21■■■■■ 5.95
LTC4S-204ENST00000466071 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.03■■■■■ 5.92
LTC4S-204ENST00000466071 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.88■■■■■ 5.9
LTC4S-204ENST00000466071 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.88■■■■■ 5.9
LTC4S-204ENST00000466071 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.86■■■■■ 5.89
LTC4S-204ENST00000466071 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.85■■■■■ 5.89
LTC4S-204ENST00000466071 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.71■■■■■ 5.87
LTC4S-204ENST00000466071 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.68■■■■■ 5.86
LTC4S-204ENST00000466071 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.41■■■■■ 5.82
LTC4S-204ENST00000466071 CFTRP13569 1480 aa51.4■■■■■ 5.82
LTC4S-204ENST00000466071 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.31■■■■■ 5.8
LTC4S-204ENST00000466071 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.3■■■■■ 5.8
LTC4S-204ENST00000466071 WDR62O43379 1518 aa51.25■■■■■ 5.79
LTC4S-204ENST00000466071 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.12■■■■■ 5.77
LTC4S-204ENST00000466071 PRDM2Q13029 1718 aa50.98■■■■■ 5.75
LTC4S-204ENST00000466071 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.85■■■■■ 5.73
LTC4S-204ENST00000466071 TOPBP1Q92547 1522 aa50.39■■■■■ 5.66
LTC4S-204ENST00000466071 ABCC8Q09428 1581 aa50.32■■■■■ 5.65
LTC4S-204ENST00000466071 IFT140Q96RY7 1462 aa50.27■■■■■ 5.64
LTC4S-204ENST00000466071 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.26■■■■■ 5.64
LTC4S-204ENST00000466071 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.15■■■■■ 5.62
LTC4S-204ENST00000466071 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.14■■■■■ 5.62
LTC4S-204ENST00000466071 OSCARQ8IYS5 282 aa50.01■■■■■ 5.6
LTC4S-204ENST00000466071 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.91■■■■■ 5.58
LTC4S-204ENST00000466071 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.91■■■■■ 5.58
LTC4S-204ENST00000466071 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.89■■■■■ 5.58
LTC4S-204ENST00000466071 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.76■■■■■ 5.56
LTC4S-204ENST00000466071 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.72■■■■■ 5.55
LTC4S-204ENST00000466071 CUX1P39880 1505 aa49.7■■■■■ 5.55
LTC4S-204ENST00000466071 SOGA1O94964 1423 aa49.7■■■■■ 5.55
LTC4S-204ENST00000466071 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.68■■■■■ 5.54
LTC4S-204ENST00000466071 TRIM41Q8WV44 630 aa49.65■■■■■ 5.54
LTC4S-204ENST00000466071 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.53■■■■■ 5.52
LTC4S-204ENST00000466071 CHD1O14646 1710 aa49.46■■■■■ 5.51
LTC4S-204ENST00000466071 WDR97A6NE52 1622 aa49.42■■■■■ 5.5
LTC4S-204ENST00000466071 FBLN2P98095 1184 aa49.35■■■■■ 5.49
LTC4S-204ENST00000466071 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.31■■■■■ 5.48
LTC4S-204ENST00000466071 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.31■■■■■ 5.48
LTC4S-204ENST00000466071 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.31■■■■■ 5.48
LTC4S-204ENST00000466071 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.25■■■■■ 5.48
LTC4S-204ENST00000466071 GRIN2BQ13224 1484 aa49.2■■■■■ 5.47
LTC4S-204ENST00000466071 ARHGEF11O15085 1522 aa49.19■■■■■ 5.47
LTC4S-204ENST00000466071 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.14■■■■■ 5.46
LTC4S-204ENST00000466071 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.14■■■■■ 5.46
LTC4S-204ENST00000466071 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.1■■■■■ 5.45
LTC4S-204ENST00000466071 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.09■■■■■ 5.45
LTC4S-204ENST00000466071 PBRM1Q86U86 1689 aa49.07■■■■■ 5.45
LTC4S-204ENST00000466071 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.07■■■■■ 5.45
LTC4S-204ENST00000466071 TOP2BQ02880 1626 aa49.06■■■■■ 5.44
LTC4S-204ENST00000466071 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.06■■■■■ 5.44
LTC4S-204ENST00000466071 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.02■■■■■ 5.44
LTC4S-204ENST00000466071 SYNJ1O43426 1573 aa49.02■■■■■ 5.44
LTC4S-204ENST00000466071 SYNJ2O15056 1496 aa48.98■■■■■ 5.43
LTC4S-204ENST00000466071 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.86■■■■■ 5.41
LTC4S-204ENST00000466071 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.81■■■■■ 5.4
LTC4S-204ENST00000466071 ARAP1Q96P48 1450 aa48.74■■■■■ 5.39
LTC4S-204ENST00000466071 ADAMTS12P58397 1594 aa48.6■■■■■ 5.37
LTC4S-204ENST00000466071 GRIN2AQ12879 1464 aa48.56■■■■■ 5.36
LTC4S-204ENST00000466071 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.53■■■■■ 5.36
LTC4S-204ENST00000466071 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.49■■■■■ 5.35
LTC4S-204ENST00000466071 CEP170Q5SW79 1584 aa48.38■■■■■ 5.33
LTC4S-204ENST00000466071 NUP160Q12769 1436 aa48.37■■■■■ 5.33
LTC4S-204ENST00000466071 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.15■■■■■ 5.3
LTC4S-204ENST00000466071 SHROOM2Q13796 1616 aa48.12■■■■■ 5.29
LTC4S-204ENST00000466071 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.11■■■■■ 5.29
LTC4S-204ENST00000466071 KIF27Q86VH2 1401 aa48.11■■■■■ 5.29
LTC4S-204ENST00000466071 IGF1RP08069 1367 aa48.03■■■■■ 5.28
LTC4S-204ENST00000466071 CUL7Q14999 1698 aa47.94■■■■■ 5.26
LTC4S-204ENST00000466071 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.91■■■■■ 5.26
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