RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466015.1

EHD1-208, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene EHD1, Length 1,290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-208ENST00000466015 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.16■■■■■ 4.98
EHD1-208ENST00000466015 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.06■■■■■ 4.16
EHD1-208ENST00000466015 ABCC9O60706 1549 aa40.56■■■■■ 4.08
EHD1-208ENST00000466015 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.92■■■■□ 3.82
EHD1-208ENST00000466015 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.86■■■■□ 3.81
EHD1-208ENST00000466015 NACADO15069 1562 aa38.74■■■■□ 3.79
EHD1-208ENST00000466015 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.38■■■■□ 3.73
EHD1-208ENST00000466015 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.38■■■■□ 3.73
EHD1-208ENST00000466015 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.13■■■■□ 3.69
EHD1-208ENST00000466015 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.92■■■■□ 3.66
EHD1-208ENST00000466015 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.76■■■■□ 3.64
EHD1-208ENST00000466015 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.58■■■■□ 3.61
EHD1-208ENST00000466015 SCRIBQ14160 1630 aa37.54■■■■□ 3.6
EHD1-208ENST00000466015 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.38■■■■□ 3.57
EHD1-208ENST00000466015 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.24■■■■□ 3.55
EHD1-208ENST00000466015 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
EHD1-208ENST00000466015 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.59■■■■□ 3.45
EHD1-208ENST00000466015 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.46■■■■□ 3.43
EHD1-208ENST00000466015 SMARCA4P51532 1647 aa35.83■■■■□ 3.33
EHD1-208ENST00000466015 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
EHD1-208ENST00000466015 NCAPD3P42695 1498 aa35.76■■■■□ 3.32
EHD1-208ENST00000466015 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.75■■■■□ 3.31
EHD1-208ENST00000466015 SMARCA2P51531 1590 aa35.7■■■■□ 3.31
EHD1-208ENST00000466015 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.56■■■■□ 3.28
EHD1-208ENST00000466015 HMGXB3Q12766 1538 aa35.52■■■■□ 3.28
EHD1-208ENST00000466015 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
EHD1-208ENST00000466015 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.45■■■■□ 3.27
EHD1-208ENST00000466015 WIZO95785 1651 aa35.14■■■■□ 3.22
EHD1-208ENST00000466015 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
EHD1-208ENST00000466015 ERCC6Q03468 1493 aa35.04■■■■□ 3.2
EHD1-208ENST00000466015 NESP48681 1621 aa34.97■■■■□ 3.19
EHD1-208ENST00000466015 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.83■■■■□ 3.17
EHD1-208ENST00000466015 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
EHD1-208ENST00000466015 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.75■■■■□ 3.15
EHD1-208ENST00000466015 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.71■■■■□ 3.15
EHD1-208ENST00000466015 CUX2O14529 1486 aa34.65■■■■□ 3.14
EHD1-208ENST00000466015 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.47■■■■□ 3.11
EHD1-208ENST00000466015 CFTRP13569 1480 aa34.46■■■■□ 3.11
EHD1-208ENST00000466015 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
EHD1-208ENST00000466015 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.41■■■■□ 3.1
EHD1-208ENST00000466015 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.35■■■■□ 3.09
EHD1-208ENST00000466015 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.34■■■■□ 3.09
EHD1-208ENST00000466015 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.33■■■■□ 3.09
EHD1-208ENST00000466015 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
EHD1-208ENST00000466015 WDR62O43379 1518 aa34.15■■■■□ 3.06
EHD1-208ENST00000466015 PRDM2Q13029 1718 aa34.01■■■■□ 3.03
EHD1-208ENST00000466015 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
EHD1-208ENST00000466015 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.9■■■■□ 3.02
EHD1-208ENST00000466015 ABCC8Q09428 1581 aa33.77■■■■□ 3
EHD1-208ENST00000466015 TOPBP1Q92547 1522 aa33.74■■■□□ 2.99
EHD1-208ENST00000466015 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.67■■■□□ 2.98
EHD1-208ENST00000466015 IFT140Q96RY7 1462 aa33.62■■■□□ 2.97
EHD1-208ENST00000466015 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
EHD1-208ENST00000466015 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
EHD1-208ENST00000466015 CUX1P39880 1505 aa33.38■■■□□ 2.93
EHD1-208ENST00000466015 SOGA1O94964 1423 aa33.37■■■□□ 2.93
EHD1-208ENST00000466015 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.35■■■□□ 2.93
EHD1-208ENST00000466015 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.32■■■□□ 2.92
EHD1-208ENST00000466015 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
EHD1-208ENST00000466015 OSCARQ8IYS5 282 aa33.28■■■□□ 2.92
EHD1-208ENST00000466015 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.28■■■□□ 2.922e-6■■■■■ 34.3
EHD1-208ENST00000466015 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
EHD1-208ENST00000466015 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
EHD1-208ENST00000466015 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.16■■■□□ 2.9
EHD1-208ENST00000466015 FBLN2P98095 1184 aa33.08■■■□□ 2.89
EHD1-208ENST00000466015 WDR97A6NE52 1622 aa33.06■■■□□ 2.88
EHD1-208ENST00000466015 TOP2BQ02880 1626 aa33.02■■■□□ 2.88
EHD1-208ENST00000466015 SYNJ1O43426 1573 aa33■■■□□ 2.87
EHD1-208ENST00000466015 GRIN2BQ13224 1484 aa32.99■■■□□ 2.87
EHD1-208ENST00000466015 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.98■■■□□ 2.87
EHD1-208ENST00000466015 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.97■■■□□ 2.87
EHD1-208ENST00000466015 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.96■■■□□ 2.87
EHD1-208ENST00000466015 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.95■■■□□ 2.87
EHD1-208ENST00000466015 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
EHD1-208ENST00000466015 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
EHD1-208ENST00000466015 CHD1O14646 1710 aa32.85■■■□□ 2.85
EHD1-208ENST00000466015 TRIM41Q8WV44 630 aa32.82■■■□□ 2.84
EHD1-208ENST00000466015 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.81■■■□□ 2.84
EHD1-208ENST00000466015 SYNJ2O15056 1496 aa32.79■■■□□ 2.84
EHD1-208ENST00000466015 PBRM1Q86U86 1689 aa32.77■■■□□ 2.84
EHD1-208ENST00000466015 ARHGEF11O15085 1522 aa32.63■■■□□ 2.81
EHD1-208ENST00000466015 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.62■■■□□ 2.81
EHD1-208ENST00000466015 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.62■■■□□ 2.81
EHD1-208ENST00000466015 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.62■■■□□ 2.81
EHD1-208ENST00000466015 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.59■■■□□ 2.81
EHD1-208ENST00000466015 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.57■■■□□ 2.8
EHD1-208ENST00000466015 ADAMTS12P58397 1594 aa32.55■■■□□ 2.8
EHD1-208ENST00000466015 GRIN2AQ12879 1464 aa32.54■■■□□ 2.8
EHD1-208ENST00000466015 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.52■■■□□ 2.8
EHD1-208ENST00000466015 KIF27Q86VH2 1401 aa32.51■■■□□ 2.8
EHD1-208ENST00000466015 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.47■■■□□ 2.79
EHD1-208ENST00000466015 NUP160Q12769 1436 aa32.37■■■□□ 2.77
EHD1-208ENST00000466015 IGF1RP08069 1367 aa32.36■■■□□ 2.77
EHD1-208ENST00000466015 ARAP1Q96P48 1450 aa32.35■■■□□ 2.77
EHD1-208ENST00000466015 CEP170Q5SW79 1584 aa32.33■■■□□ 2.77
EHD1-208ENST00000466015 CUL7Q14999 1698 aa32.23■■■□□ 2.75
EHD1-208ENST00000466015 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.2■■■□□ 2.75
EHD1-208ENST00000466015 JPH4Q96JJ6 628 aa32.13■■■□□ 2.73
EHD1-208ENST00000466015 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
EHD1-208ENST00000466015 SHROOM2Q13796 1616 aa32.08■■■□□ 2.73
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