RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465905.5

TRAPPC10-206, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 563 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-206ENST00000465905 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.6■■■□□ 2.65
TRAPPC10-206ENST00000465905 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC10-206ENST00000465905 ABCC9O60706 1549 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC10-206ENST00000465905 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-206ENST00000465905 NACADO15069 1562 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC10-206ENST00000465905 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC10-206ENST00000465905 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC10-206ENST00000465905 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC10-206ENST00000465905 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC10-206ENST00000465905 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC10-206ENST00000465905 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10-206ENST00000465905 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC10-206ENST00000465905 SCRIBQ14160 1630 aa25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC10-206ENST00000465905 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10-206ENST00000465905 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10-206ENST00000465905 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-206ENST00000465905 NCAPD3P42695 1498 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-206ENST00000465905 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC10-206ENST00000465905 SMARCA4P51532 1647 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10-206ENST00000465905 SMARCA2P51531 1590 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC10-206ENST00000465905 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-206ENST00000465905 HMGXB3Q12766 1538 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC10-206ENST00000465905 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC10-206ENST00000465905 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10-206ENST00000465905 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-206ENST00000465905 ERCC6Q03468 1493 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10-206ENST00000465905 CUX2O14529 1486 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10-206ENST00000465905 NESP48681 1621 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10-206ENST00000465905 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10-206ENST00000465905 WIZO95785 1651 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC10-206ENST00000465905 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10-206ENST00000465905 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10-206ENST00000465905 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC10-206ENST00000465905 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10-206ENST00000465905 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10-206ENST00000465905 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10-206ENST00000465905 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC10-206ENST00000465905 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC10-206ENST00000465905 CFTRP13569 1480 aa23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC10-206ENST00000465905 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC10-206ENST00000465905 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC10-206ENST00000465905 WDR62O43379 1518 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC10-206ENST00000465905 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC10-206ENST00000465905 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-206ENST00000465905 PRDM2Q13029 1718 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-206ENST00000465905 ABCC8Q09428 1581 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC10-206ENST00000465905 IFT140Q96RY7 1462 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC10-206ENST00000465905 TOPBP1Q92547 1522 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC10-206ENST00000465905 OSCARQ8IYS5 282 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC10-206ENST00000465905 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC10-206ENST00000465905 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC10-206ENST00000465905 TRIM41Q8WV44 630 aa23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC10-206ENST00000465905 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC10-206ENST00000465905 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC10-206ENST00000465905 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC10-206ENST00000465905 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC10-206ENST00000465905 SOGA1O94964 1423 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC10-206ENST00000465905 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC10-206ENST00000465905 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC10-206ENST00000465905 CUX1P39880 1505 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC10-206ENST00000465905 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC10-206ENST00000465905 FBLN2P98095 1184 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC10-206ENST00000465905 WDR97A6NE52 1622 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC10-206ENST00000465905 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC10-206ENST00000465905 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC10-206ENST00000465905 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC10-206ENST00000465905 CHD1O14646 1710 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC10-206ENST00000465905 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC10-206ENST00000465905 ARHGEF11O15085 1522 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC10-206ENST00000465905 GRIN2BQ13224 1484 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC10-206ENST00000465905 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC10-206ENST00000465905 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC10-206ENST00000465905 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC10-206ENST00000465905 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC10-206ENST00000465905 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC10-206ENST00000465905 SYNJ2O15056 1496 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC10-206ENST00000465905 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC10-206ENST00000465905 SYNJ1O43426 1573 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC10-206ENST00000465905 TOP2BQ02880 1626 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC10-206ENST00000465905 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC10-206ENST00000465905 PBRM1Q86U86 1689 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC10-206ENST00000465905 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC10-206ENST00000465905 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC10-206ENST00000465905 ARAP1Q96P48 1450 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC10-206ENST00000465905 GRIN2AQ12879 1464 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC10-206ENST00000465905 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC10-206ENST00000465905 ADAMTS12P58397 1594 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC10-206ENST00000465905 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC10-206ENST00000465905 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-206ENST00000465905 NUP160Q12769 1436 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-206ENST00000465905 CEP170Q5SW79 1584 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-206ENST00000465905 KIF27Q86VH2 1401 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC10-206ENST00000465905 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC10-206ENST00000465905 SHROOM2Q13796 1616 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-206ENST00000465905 JPH4Q96JJ6 628 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-206ENST00000465905 IGF1RP08069 1367 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-206ENST00000465905 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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