RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465894.6

SH3BP5-209, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-209ENST00000465894 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.94■■■□□ 2.54
SH3BP5-209ENST00000465894 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.13■■□□□ 1.93
SH3BP5-209ENST00000465894 ABCC9O60706 1549 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP5-209ENST00000465894 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP5-209ENST00000465894 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP5-209ENST00000465894 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP5-209ENST00000465894 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP5-209ENST00000465894 NACADO15069 1562 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP5-209ENST00000465894 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-209ENST00000465894 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP5-209ENST00000465894 SCRIBQ14160 1630 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP5-209ENST00000465894 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.64■■□□□ 1.53
SH3BP5-209ENST00000465894 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-209ENST00000465894 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-209ENST00000465894 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP5-209ENST00000465894 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SH3BP5-209ENST00000465894 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SH3BP5-209ENST00000465894 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
SH3BP5-209ENST00000465894 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP5-209ENST00000465894 SMARCA4P51532 1647 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP5-209ENST00000465894 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-209ENST00000465894 WIZO95785 1651 aa23.64■■□□□ 1.38
SH3BP5-209ENST00000465894 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-209ENST00000465894 SMARCA2P51531 1590 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-209ENST00000465894 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-209ENST00000465894 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-209ENST00000465894 NCAPD3P42695 1498 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-209ENST00000465894 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-209ENST00000465894 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-209ENST00000465894 HMGXB3Q12766 1538 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-209ENST00000465894 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP5-209ENST00000465894 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5-209ENST00000465894 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-209ENST00000465894 CFTRP13569 1480 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-209ENST00000465894 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5-209ENST00000465894 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5-209ENST00000465894 PRDM2Q13029 1718 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5-209ENST00000465894 NESP48681 1621 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5-209ENST00000465894 TRIM41Q8WV44 630 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5-209ENST00000465894 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5-209ENST00000465894 ABCC8Q09428 1581 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP5-209ENST00000465894 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP5-209ENST00000465894 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5-209ENST00000465894 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-209ENST00000465894 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5-209ENST00000465894 SYNJ1O43426 1573 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP5-209ENST00000465894 CUX1P39880 1505 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP5-209ENST00000465894 TOP2BQ02880 1626 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP5-209ENST00000465894 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5-209ENST00000465894 ERCC6Q03468 1493 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5-209ENST00000465894 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5-209ENST00000465894 TOPBP1Q92547 1522 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5-209ENST00000465894 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-209ENST00000465894 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-209ENST00000465894 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5-209ENST00000465894 WDR62O43379 1518 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5-209ENST00000465894 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5-209ENST00000465894 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5-209ENST00000465894 SOGA1O94964 1423 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-209ENST00000465894 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-209ENST00000465894 EEA1Q15075 1411 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5-209ENST00000465894 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5-209ENST00000465894 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP5-209ENST00000465894 KIF27Q86VH2 1401 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-209ENST00000465894 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-209ENST00000465894 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5-209ENST00000465894 CUX2O14529 1486 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-209ENST00000465894 IFT140Q96RY7 1462 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5-209ENST00000465894 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5-209ENST00000465894 WDR97A6NE52 1622 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5-209ENST00000465894 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-209ENST00000465894 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-209ENST00000465894 IGF1RP08069 1367 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-209ENST00000465894 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP5-209ENST00000465894 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP5-209ENST00000465894 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP5-209ENST00000465894 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP5-209ENST00000465894 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-209ENST00000465894 KIF21BO75037 1637 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-209ENST00000465894 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-209ENST00000465894 PRXQ9BXM0 1461 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-209ENST00000465894 GOLGA3Q08378 1498 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP5-209ENST00000465894 GRIN2BQ13224 1484 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP5-209ENST00000465894 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP5-209ENST00000465894 CUL7Q14999 1698 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP5-209ENST00000465894 PBRM1Q86U86 1689 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP5-209ENST00000465894 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP5-209ENST00000465894 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP5-209ENST00000465894 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP5-209ENST00000465894 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP5-209ENST00000465894 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP5-209ENST00000465894 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP5-209ENST00000465894 ADAMTS12P58397 1594 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP5-209ENST00000465894 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BP5-209ENST00000465894 SYNJ2O15056 1496 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP5-209ENST00000465894 FBLN2P98095 1184 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP5-209ENST00000465894 GRIN2AQ12879 1464 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP5-209ENST00000465894 CEP162Q5TB80 1403 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP5-209ENST00000465894 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.34■■□□□ 1.01
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