RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465774.2

RBM20-202, Transcript of RNA binding motif protein 20, humanhuman

TSL 4

Gene RBM20, Length 905 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM20-202ENST00000465774 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.6■■■■□ 3.13
RBM20-202ENST00000465774 ABCC9O60706 1549 aa31.39■■■□□ 2.62
RBM20-202ENST00000465774 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.16■■■□□ 2.58
RBM20-202ENST00000465774 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.73■■■□□ 2.35
RBM20-202ENST00000465774 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.7■■■□□ 2.35
RBM20-202ENST00000465774 NACADO15069 1562 aa29.46■■■□□ 2.31
RBM20-202ENST00000465774 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.24■■■□□ 2.27
RBM20-202ENST00000465774 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.23■■■□□ 2.27
RBM20-202ENST00000465774 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.18■■■□□ 2.26
RBM20-202ENST00000465774 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.98■■■□□ 2.23
RBM20-202ENST00000465774 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.95■■■□□ 2.23
RBM20-202ENST00000465774 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
RBM20-202ENST00000465774 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.53■■■□□ 2.16
RBM20-202ENST00000465774 SCRIBQ14160 1630 aa28.43■■■□□ 2.14
RBM20-202ENST00000465774 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.4■■■□□ 2.14
RBM20-202ENST00000465774 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.36■■■□□ 2.13
RBM20-202ENST00000465774 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.27■■■□□ 2.12
RBM20-202ENST00000465774 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
RBM20-202ENST00000465774 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.32■■□□□ 1.96
RBM20-202ENST00000465774 NCAPD3P42695 1498 aa27.2■■□□□ 1.95
RBM20-202ENST00000465774 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.12■■□□□ 1.93
RBM20-202ENST00000465774 CUX2O14529 1486 aa27.08■■□□□ 1.93
RBM20-202ENST00000465774 SMARCA4P51532 1647 aa27.08■■□□□ 1.93
RBM20-202ENST00000465774 ERCC6Q03468 1493 aa27.06■■□□□ 1.92
RBM20-202ENST00000465774 HMGXB3Q12766 1538 aa27■■□□□ 1.91
RBM20-202ENST00000465774 SMARCA2P51531 1590 aa27■■□□□ 1.91
RBM20-202ENST00000465774 NESP48681 1621 aa26.95■■□□□ 1.91
RBM20-202ENST00000465774 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
RBM20-202ENST00000465774 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
RBM20-202ENST00000465774 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.78■■□□□ 1.88
RBM20-202ENST00000465774 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
RBM20-202ENST00000465774 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.71■■□□□ 1.87
RBM20-202ENST00000465774 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.64■■□□□ 1.86
RBM20-202ENST00000465774 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.63■■□□□ 1.85
RBM20-202ENST00000465774 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.44■■□□□ 1.82
RBM20-202ENST00000465774 WIZO95785 1651 aa26.41■■□□□ 1.82
RBM20-202ENST00000465774 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.35■■□□□ 1.81
RBM20-202ENST00000465774 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.28■■□□□ 1.8
RBM20-202ENST00000465774 WDR62O43379 1518 aa26.25■■□□□ 1.79
RBM20-202ENST00000465774 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.12■■□□□ 1.77
RBM20-202ENST00000465774 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.09■■□□□ 1.77
RBM20-202ENST00000465774 TRIM41Q8WV44 630 aa26.05■■□□□ 1.76
RBM20-202ENST00000465774 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
RBM20-202ENST00000465774 CFTRP13569 1480 aa26.04■■□□□ 1.76
RBM20-202ENST00000465774 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
RBM20-202ENST00000465774 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
RBM20-202ENST00000465774 PRDM2Q13029 1718 aa25.85■■□□□ 1.73
RBM20-202ENST00000465774 OSCARQ8IYS5 282 aa25.76■■□□□ 1.71
RBM20-202ENST00000465774 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.7■■□□□ 1.7
RBM20-202ENST00000465774 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
RBM20-202ENST00000465774 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.59■■□□□ 1.69
RBM20-202ENST00000465774 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.59■■□□□ 1.69
RBM20-202ENST00000465774 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.59■■□□□ 1.69
RBM20-202ENST00000465774 TOPBP1Q92547 1522 aa25.59■■□□□ 1.69
RBM20-202ENST00000465774 IFT140Q96RY7 1462 aa25.59■■□□□ 1.69
RBM20-202ENST00000465774 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
RBM20-202ENST00000465774 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.48■■□□□ 1.67
RBM20-202ENST00000465774 ARHGEF11O15085 1522 aa25.45■■□□□ 1.66
RBM20-202ENST00000465774 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
RBM20-202ENST00000465774 ABCC8Q09428 1581 aa25.41■■□□□ 1.66
RBM20-202ENST00000465774 CHD1O14646 1710 aa25.4■■□□□ 1.66
RBM20-202ENST00000465774 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
RBM20-202ENST00000465774 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
RBM20-202ENST00000465774 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.26■■□□□ 1.63
RBM20-202ENST00000465774 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.22■■□□□ 1.63
RBM20-202ENST00000465774 ARAP1Q96P48 1450 aa25.21■■□□□ 1.63
RBM20-202ENST00000465774 FBLN2P98095 1184 aa25.18■■□□□ 1.62
RBM20-202ENST00000465774 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
RBM20-202ENST00000465774 SOGA1O94964 1423 aa25.15■■□□□ 1.62
RBM20-202ENST00000465774 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.13■■□□□ 1.61
RBM20-202ENST00000465774 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.11■■□□□ 1.61
RBM20-202ENST00000465774 CUX1P39880 1505 aa25.11■■□□□ 1.61
RBM20-202ENST00000465774 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.06■■□□□ 1.6
RBM20-202ENST00000465774 WDR97A6NE52 1622 aa25.04■■□□□ 1.6
RBM20-202ENST00000465774 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RBM20-202ENST00000465774 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
RBM20-202ENST00000465774 SYNJ1O43426 1573 aa24.96■■□□□ 1.59
RBM20-202ENST00000465774 GRIN2BQ13224 1484 aa24.96■■□□□ 1.59
RBM20-202ENST00000465774 PBRM1Q86U86 1689 aa24.95■■□□□ 1.58
RBM20-202ENST00000465774 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
RBM20-202ENST00000465774 SYNJ2O15056 1496 aa24.91■■□□□ 1.58
RBM20-202ENST00000465774 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.85■■□□□ 1.57
RBM20-202ENST00000465774 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.84■■□□□ 1.57
RBM20-202ENST00000465774 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.81■■□□□ 1.56
RBM20-202ENST00000465774 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.71■■□□□ 1.55
RBM20-202ENST00000465774 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
RBM20-202ENST00000465774 ADAMTS12P58397 1594 aa24.67■■□□□ 1.54
RBM20-202ENST00000465774 GRIN2AQ12879 1464 aa24.66■■□□□ 1.54
RBM20-202ENST00000465774 CEP170Q5SW79 1584 aa24.65■■□□□ 1.54
RBM20-202ENST00000465774 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.64■■□□□ 1.53
RBM20-202ENST00000465774 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
RBM20-202ENST00000465774 TOP2BQ02880 1626 aa24.61■■□□□ 1.53
RBM20-202ENST00000465774 NUP160Q12769 1436 aa24.59■■□□□ 1.53
RBM20-202ENST00000465774 SHROOM2Q13796 1616 aa24.56■■□□□ 1.52
RBM20-202ENST00000465774 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.51■■□□□ 1.51
RBM20-202ENST00000465774 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.47■■□□□ 1.51
RBM20-202ENST00000465774 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.41■■□□□ 1.5
RBM20-202ENST00000465774 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
RBM20-202ENST00000465774 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
RBM20-202ENST00000465774 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.33■■□□□ 1.49
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