RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465528.1

NOTCH4-202, Transcript of notch 4, humanhuman

TSL 5

Gene NOTCH4, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4-202ENST00000465528 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.35■■■□□ 2.77
NOTCH4-202ENST00000465528 ABCC9O60706 1549 aa29.26■■■□□ 2.27
NOTCH4-202ENST00000465528 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.98■■■□□ 2.23
NOTCH4-202ENST00000465528 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.71■■■□□ 2.03
NOTCH4-202ENST00000465528 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.7■■■□□ 2.03
NOTCH4-202ENST00000465528 NACADO15069 1562 aa27.49■■□□□ 1.99
NOTCH4-202ENST00000465528 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.42■■□□□ 1.98
NOTCH4-202ENST00000465528 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
NOTCH4-202ENST00000465528 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.08■■□□□ 1.93
NOTCH4-202ENST00000465528 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.07■■□□□ 1.92
NOTCH4-202ENST00000465528 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.98■■□□□ 1.91
NOTCH4-202ENST00000465528 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
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NOTCH4-202ENST00000465528 SCRIBQ14160 1630 aa26.47■■□□□ 1.83
NOTCH4-202ENST00000465528 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.39■■□□□ 1.82
NOTCH4-202ENST00000465528 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.36■■□□□ 1.81
NOTCH4-202ENST00000465528 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
NOTCH4-202ENST00000465528 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.47■■□□□ 1.67
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NOTCH4-202ENST00000465528 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.35■■□□□ 1.65
NOTCH4-202ENST00000465528 SMARCA4P51532 1647 aa25.23■■□□□ 1.63
NOTCH4-202ENST00000465528 CUX2O14529 1486 aa25.23■■□□□ 1.63
NOTCH4-202ENST00000465528 ERCC6Q03468 1493 aa25.21■■□□□ 1.63
NOTCH4-202ENST00000465528 SMARCA2P51531 1590 aa25.2■■□□□ 1.62
NOTCH4-202ENST00000465528 HMGXB3Q12766 1538 aa25.18■■□□□ 1.62
NOTCH4-202ENST00000465528 NESP48681 1621 aa25.12■■□□□ 1.61
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NOTCH4-202ENST00000465528 PEG3Q9GZU2 1588 aa25■■□□□ 1.59
NOTCH4-202ENST00000465528 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.96■■□□□ 1.59
NOTCH4-202ENST00000465528 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
NOTCH4-202ENST00000465528 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.82■■□□□ 1.56
NOTCH4-202ENST00000465528 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.72■■□□□ 1.55
NOTCH4-202ENST00000465528 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.69■■□□□ 1.54
NOTCH4-202ENST00000465528 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.67■■□□□ 1.54
NOTCH4-202ENST00000465528 WIZO95785 1651 aa24.61■■□□□ 1.53
NOTCH4-202ENST00000465528 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.51■■□□□ 1.51
NOTCH4-202ENST00000465528 WDR62O43379 1518 aa24.45■■□□□ 1.51
NOTCH4-202ENST00000465528 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
NOTCH4-202ENST00000465528 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.38■■□□□ 1.49
NOTCH4-202ENST00000465528 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.37■■□□□ 1.49
NOTCH4-202ENST00000465528 CFTRP13569 1480 aa24.35■■□□□ 1.49
NOTCH4-202ENST00000465528 TRIM41Q8WV44 630 aa24.28■■□□□ 1.48
NOTCH4-202ENST00000465528 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
NOTCH4-202ENST00000465528 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
NOTCH4-202ENST00000465528 OSCARQ8IYS5 282 aa24.11■■□□□ 1.45
NOTCH4-202ENST00000465528 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.07■■□□□ 1.44
NOTCH4-202ENST00000465528 PRDM2Q13029 1718 aa23.96■■□□□ 1.43
NOTCH4-202ENST00000465528 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
NOTCH4-202ENST00000465528 IFT140Q96RY7 1462 aa23.91■■□□□ 1.42
NOTCH4-202ENST00000465528 TOPBP1Q92547 1522 aa23.89■■□□□ 1.42
NOTCH4-202ENST00000465528 ABCC8Q09428 1581 aa23.78■■□□□ 1.4
NOTCH4-202ENST00000465528 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.76■■□□□ 1.39
NOTCH4-202ENST00000465528 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.76■■□□□ 1.39
NOTCH4-202ENST00000465528 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.76■■□□□ 1.39
NOTCH4-202ENST00000465528 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.75■■□□□ 1.39
NOTCH4-202ENST00000465528 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
NOTCH4-202ENST00000465528 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
NOTCH4-202ENST00000465528 ARHGEF11O15085 1522 aa23.69■■□□□ 1.38
NOTCH4-202ENST00000465528 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
NOTCH4-202ENST00000465528 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
NOTCH4-202ENST00000465528 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.6■■□□□ 1.37
NOTCH4-202ENST00000465528 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.58■■□□□ 1.37
NOTCH4-202ENST00000465528 FBLN2P98095 1184 aa23.57■■□□□ 1.36
NOTCH4-202ENST00000465528 SOGA1O94964 1423 aa23.55■■□□□ 1.36
NOTCH4-202ENST00000465528 CHD1O14646 1710 aa23.55■■□□□ 1.36
NOTCH4-202ENST00000465528 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
NOTCH4-202ENST00000465528 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4-202ENST00000465528 ARAP1Q96P48 1450 aa23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4-202ENST00000465528 CUX1P39880 1505 aa23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4-202ENST00000465528 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.42■■□□□ 1.34
NOTCH4-202ENST00000465528 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
NOTCH4-202ENST00000465528 WDR97A6NE52 1622 aa23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4-202ENST00000465528 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.33■■□□□ 1.32
NOTCH4-202ENST00000465528 GRIN2BQ13224 1484 aa23.32■■□□□ 1.32
NOTCH4-202ENST00000465528 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
NOTCH4-202ENST00000465528 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
NOTCH4-202ENST00000465528 SYNJ2O15056 1496 aa23.26■■□□□ 1.31
NOTCH4-202ENST00000465528 SYNJ1O43426 1573 aa23.25■■□□□ 1.31
NOTCH4-202ENST00000465528 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.24■■□□□ 1.31
NOTCH4-202ENST00000465528 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
NOTCH4-202ENST00000465528 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.19■■□□□ 1.3
NOTCH4-202ENST00000465528 PBRM1Q86U86 1689 aa23.16■■□□□ 1.3
NOTCH4-202ENST00000465528 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.14■■□□□ 1.29
NOTCH4-202ENST00000465528 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
NOTCH4-202ENST00000465528 GRIN2AQ12879 1464 aa23.03■■□□□ 1.28
NOTCH4-202ENST00000465528 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.01■■□□□ 1.27
NOTCH4-202ENST00000465528 NUP160Q12769 1436 aa22.99■■□□□ 1.27
NOTCH4-202ENST00000465528 ADAMTS12P58397 1594 aa22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4-202ENST00000465528 TOP2BQ02880 1626 aa22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4-202ENST00000465528 CEP170Q5SW79 1584 aa22.96■■□□□ 1.27
NOTCH4-202ENST00000465528 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.96■■□□□ 1.27
NOTCH4-202ENST00000465528 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.93■■□□□ 1.26
NOTCH4-202ENST00000465528 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4-202ENST00000465528 SHROOM2Q13796 1616 aa22.85■■□□□ 1.25
NOTCH4-202ENST00000465528 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NOTCH4-202ENST00000465528 JPH4Q96JJ6 628 aa22.78■■□□□ 1.24
NOTCH4-202ENST00000465528 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
NOTCH4-202ENST00000465528 IGF1RP08069 1367 aa22.64■■□□□ 1.22
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