RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465147.1

SEMA5B-208, Transcript of semaphorin 5B, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA5B, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5B-208ENST00000465147 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.17■■■■■ 5.78
SEMA5B-208ENST00000465147 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.74■■■■■ 4.91
SEMA5B-208ENST00000465147 ABCC9O60706 1549 aa45.72■■■■■ 4.91
SEMA5B-208ENST00000465147 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.46■■■■■ 4.55
SEMA5B-208ENST00000465147 NACADO15069 1562 aa43.2■■■■■ 4.51
SEMA5B-208ENST00000465147 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.19■■■■■ 4.5
SEMA5B-208ENST00000465147 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.87■■■■■ 4.45
SEMA5B-208ENST00000465147 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.66■■■■■ 4.42
SEMA5B-208ENST00000465147 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.63■■■■■ 4.42
SEMA5B-208ENST00000465147 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.61■■■■■ 4.41
SEMA5B-208ENST00000465147 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
SEMA5B-208ENST00000465147 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.34■■■■■ 4.37
SEMA5B-208ENST00000465147 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.19■■■■■ 4.34
SEMA5B-208ENST00000465147 SCRIBQ14160 1630 aa41.81■■■■■ 4.28
SEMA5B-208ENST00000465147 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.53■■■■■ 4.24
SEMA5B-208ENST00000465147 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.27■■■■■ 4.2
SEMA5B-208ENST00000465147 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
SEMA5B-208ENST00000465147 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.1■■■■■ 4.17
SEMA5B-208ENST00000465147 NCAPD3P42695 1498 aa39.94■■■■□ 3.98
SEMA5B-208ENST00000465147 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.88■■■■□ 3.98
SEMA5B-208ENST00000465147 SMARCA4P51532 1647 aa39.87■■■■□ 3.97
SEMA5B-208ENST00000465147 SMARCA2P51531 1590 aa39.68■■■■□ 3.94
SEMA5B-208ENST00000465147 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.94
SEMA5B-208ENST00000465147 HMGXB3Q12766 1538 aa39.6■■■■□ 3.93
SEMA5B-208ENST00000465147 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.5■■■■□ 3.91
SEMA5B-208ENST00000465147 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
SEMA5B-208ENST00000465147 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.43■■■■□ 3.9
SEMA5B-208ENST00000465147 NESP48681 1621 aa39.38■■■■□ 3.89
SEMA5B-208ENST00000465147 ERCC6Q03468 1493 aa39.35■■■■□ 3.89
SEMA5B-208ENST00000465147 CUX2O14529 1486 aa39.18■■■■□ 3.86
SEMA5B-208ENST00000465147 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.07■■■■□ 3.85
SEMA5B-208ENST00000465147 WIZO95785 1651 aa39.03■■■■□ 3.84
SEMA5B-208ENST00000465147 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.95■■■■□ 3.83
SEMA5B-208ENST00000465147 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.84■■■■□ 3.81
SEMA5B-208ENST00000465147 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.81■■■■□ 3.8
SEMA5B-208ENST00000465147 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.74■■■■□ 3.79
SEMA5B-208ENST00000465147 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
SEMA5B-208ENST00000465147 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.72■■■■□ 3.79
SEMA5B-208ENST00000465147 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
SEMA5B-208ENST00000465147 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.42■■■■□ 3.74
SEMA5B-208ENST00000465147 CFTRP13569 1480 aa38.34■■■■□ 3.73
SEMA5B-208ENST00000465147 WDR62O43379 1518 aa38.32■■■■□ 3.72
SEMA5B-208ENST00000465147 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.31■■■■□ 3.72
SEMA5B-208ENST00000465147 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.29■■■■□ 3.72
SEMA5B-208ENST00000465147 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.1■■■■□ 3.69
SEMA5B-208ENST00000465147 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
SEMA5B-208ENST00000465147 PRDM2Q13029 1718 aa37.91■■■■□ 3.66
SEMA5B-208ENST00000465147 TOPBP1Q92547 1522 aa37.62■■■■□ 3.61
SEMA5B-208ENST00000465147 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
SEMA5B-208ENST00000465147 IFT140Q96RY7 1462 aa37.52■■■■□ 3.6
SEMA5B-208ENST00000465147 OSCARQ8IYS5 282 aa37.49■■■■□ 3.59
SEMA5B-208ENST00000465147 TRIM41Q8WV44 630 aa37.47■■■■□ 3.59
SEMA5B-208ENST00000465147 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.45■■■■□ 3.59
SEMA5B-208ENST00000465147 ABCC8Q09428 1581 aa37.42■■■■□ 3.58
SEMA5B-208ENST00000465147 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
SEMA5B-208ENST00000465147 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
SEMA5B-208ENST00000465147 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.55
SEMA5B-208ENST00000465147 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.25■■■■□ 3.55
SEMA5B-208ENST00000465147 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
SEMA5B-208ENST00000465147 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.19■■■■□ 3.54
SEMA5B-208ENST00000465147 CUX1P39880 1505 aa37.09■■■■□ 3.53
SEMA5B-208ENST00000465147 SOGA1O94964 1423 aa37.09■■■■□ 3.53
SEMA5B-208ENST00000465147 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.06■■■■□ 3.52
SEMA5B-208ENST00000465147 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
SEMA5B-208ENST00000465147 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.02■■■■□ 3.52
SEMA5B-208ENST00000465147 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.02■■■■□ 3.52
SEMA5B-208ENST00000465147 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.02■■■■□ 3.52
SEMA5B-208ENST00000465147 CHD1O14646 1710 aa37■■■■□ 3.51
SEMA5B-208ENST00000465147 FBLN2P98095 1184 aa36.92■■■■□ 3.5
SEMA5B-208ENST00000465147 ARHGEF11O15085 1522 aa36.9■■■■□ 3.5
SEMA5B-208ENST00000465147 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.82■■■■□ 3.48
SEMA5B-208ENST00000465147 WDR97A6NE52 1622 aa36.76■■■■□ 3.48
SEMA5B-208ENST00000465147 GRIN2BQ13224 1484 aa36.69■■■■□ 3.46
SEMA5B-208ENST00000465147 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.68■■■■□ 3.46
SEMA5B-208ENST00000465147 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
SEMA5B-208ENST00000465147 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
SEMA5B-208ENST00000465147 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.62■■■■□ 3.45
SEMA5B-208ENST00000465147 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.6■■■■□ 3.45
SEMA5B-208ENST00000465147 ARAP1Q96P48 1450 aa36.6■■■■□ 3.45
SEMA5B-208ENST00000465147 PBRM1Q86U86 1689 aa36.58■■■■□ 3.45
SEMA5B-208ENST00000465147 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.56■■■■□ 3.44
SEMA5B-208ENST00000465147 SYNJ2O15056 1496 aa36.55■■■■□ 3.44
SEMA5B-208ENST00000465147 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.54■■■■□ 3.44
SEMA5B-208ENST00000465147 SYNJ1O43426 1573 aa36.5■■■■□ 3.43
SEMA5B-208ENST00000465147 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.48■■■■□ 3.43
SEMA5B-208ENST00000465147 TOP2BQ02880 1626 aa36.47■■■■□ 3.43
SEMA5B-208ENST00000465147 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.47■■■■□ 3.43
SEMA5B-208ENST00000465147 ADAMTS12P58397 1594 aa36.25■■■■□ 3.39
SEMA5B-208ENST00000465147 GRIN2AQ12879 1464 aa36.24■■■■□ 3.39
SEMA5B-208ENST00000465147 CEP170Q5SW79 1584 aa36.16■■■■□ 3.38
SEMA5B-208ENST00000465147 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
SEMA5B-208ENST00000465147 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.14■■■■□ 3.38
SEMA5B-208ENST00000465147 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.13■■■■□ 3.37
SEMA5B-208ENST00000465147 NUP160Q12769 1436 aa36.12■■■■□ 3.37
SEMA5B-208ENST00000465147 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.1■■■■□ 3.37
SEMA5B-208ENST00000465147 SHROOM2Q13796 1616 aa35.94■■■■□ 3.34
SEMA5B-208ENST00000465147 IGF1RP08069 1367 aa35.8■■■■□ 3.32
SEMA5B-208ENST00000465147 JPH4Q96JJ6 628 aa35.79■■■■□ 3.32
SEMA5B-208ENST00000465147 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
SEMA5B-208ENST00000465147 KIF27Q86VH2 1401 aa35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms