RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464957.1

CPTP-202, Transcript of ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

TSL 2

Gene CPTP, Length 1,101 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTP-202ENST00000464957 NISCHQ9Y2I1 1504 aa75.94■■■■■ 9.75
CPTP-202ENST00000464957 ABCC9O60706 1549 aa68.36■■■■■ 8.53
CPTP-202ENST00000464957 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa68.19■■■■■ 8.51
CPTP-202ENST00000464957 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa65.01■■■■■ 8
CPTP-202ENST00000464957 NACADO15069 1562 aa64.51■■■■■ 7.92
CPTP-202ENST00000464957 DCAF8L2P0C7V8 631 aa64.32■■■■■ 7.89
CPTP-202ENST00000464957 DNAJC5BQ9UF47 199 aa64.13■■■■■ 7.86
CPTP-202ENST00000464957 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP63.64■■■■■ 7.78
CPTP-202ENST00000464957 MYO15BQ96JP2 1530 aa63.53■■■■■ 7.76
CPTP-202ENST00000464957 UNC13AQ9UPW8 1703 aa63.47■■■■■ 7.75
CPTP-202ENST00000464957 BICRAQ9NZM4 1560 aa63.04■■■■■ 7.68
CPTP-202ENST00000464957 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP62.9■■■■■ 7.66
CPTP-202ENST00000464957 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa62.7■■■■■ 7.63
CPTP-202ENST00000464957 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa62.22■■■■■ 7.55
CPTP-202ENST00000464957 SCRIBQ14160 1630 aa62.19■■■■■ 7.55
CPTP-202ENST00000464957 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa61.71■■■■■ 7.47
CPTP-202ENST00000464957 CECR2Q9BXF3 1484 aa61.58■■■■■ 7.45
CPTP-202ENST00000464957 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP61.55■■■■■ 7.44
CPTP-202ENST00000464957 NCAPD3P42695 1498 aa59.53■■■■■ 7.12
CPTP-202ENST00000464957 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa59.35■■■■■ 7.09
CPTP-202ENST00000464957 SMARCA4P51532 1647 aa59.28■■■■■ 7.08
CPTP-202ENST00000464957 SMARCA2P51531 1590 aa59.22■■■■■ 7.07
CPTP-202ENST00000464957 HMGXB3Q12766 1538 aa59.1■■■■■ 7.05
CPTP-202ENST00000464957 ERCC6Q03468 1493 aa59.09■■■■■ 7.05
CPTP-202ENST00000464957 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa59.02■■■■■ 7.04
CPTP-202ENST00000464957 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP58.99■■■■■ 7.03
CPTP-202ENST00000464957 CUX2O14529 1486 aa58.94■■■■■ 7.03
CPTP-202ENST00000464957 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP58.83■■■■■ 7.01
CPTP-202ENST00000464957 NESP48681 1621 aa58.66■■■■■ 6.98
CPTP-202ENST00000464957 PEG3Q9GZU2 1588 aa58.65■■■■■ 6.98
CPTP-202ENST00000464957 MROH2BQ7Z745 1585 aa58.51■■■■■ 6.96
CPTP-202ENST00000464957 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa58.25■■■■■ 6.92
CPTP-202ENST00000464957 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP58.06■■■■■ 6.88
CPTP-202ENST00000464957 PDS5BQ9NTI5 1447 aa57.95■■■■■ 6.87
CPTP-202ENST00000464957 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa57.9■■■■■ 6.86
CPTP-202ENST00000464957 WIZO95785 1651 aa57.83■■■■■ 6.85
CPTP-202ENST00000464957 CADPSQ9ULU8 1353 aa57.76■■■■■ 6.84
CPTP-202ENST00000464957 MRC2Q9UBG0 1479 aa57.44■■■■■ 6.79
CPTP-202ENST00000464957 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP57.26■■■■■ 6.76
CPTP-202ENST00000464957 WDR62O43379 1518 aa57.26■■■■■ 6.76
CPTP-202ENST00000464957 CEP164Q9UPV0 1460 aa57.21■■■■■ 6.75
CPTP-202ENST00000464957 FANCD2Q9BXW9 1451 aa57.12■■■■■ 6.73
CPTP-202ENST00000464957 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP57.09■■■■■ 6.73
CPTP-202ENST00000464957 CFTRP13569 1480 aa57.05■■■■■ 6.72
CPTP-202ENST00000464957 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP56.62■■■■■ 6.65
CPTP-202ENST00000464957 TRIM41Q8WV44 630 aa56.5■■■■■ 6.64
CPTP-202ENST00000464957 PRDM2Q13029 1718 aa56.48■■■■■ 6.63
CPTP-202ENST00000464957 CCDC88BA6NC98 1476 aa56.44■■■■■ 6.63
CPTP-202ENST00000464957 OSCARQ8IYS5 282 aa56.29■■■■■ 6.6
CPTP-202ENST00000464957 IFT140Q96RY7 1462 aa56.06■■■■■ 6.56
CPTP-202ENST00000464957 TOPBP1Q92547 1522 aa56.01■■■■■ 6.56
CPTP-202ENST00000464957 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP55.94■■■■■ 6.55
CPTP-202ENST00000464957 ABCC8Q09428 1581 aa55.91■■■■■ 6.54
CPTP-202ENST00000464957 DNMBPQ6XZF7 1577 aa55.8■■■■■ 6.52
CPTP-202ENST00000464957 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP55.65■■■■■ 6.5
CPTP-202ENST00000464957 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa55.52■■■■■ 6.48
CPTP-202ENST00000464957 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa55.52■■■■■ 6.48
CPTP-202ENST00000464957 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa55.52■■■■■ 6.48
CPTP-202ENST00000464957 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP55.48■■■■■ 6.47
CPTP-202ENST00000464957 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP55.44■■■■■ 6.47
CPTP-202ENST00000464957 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP55.42■■■■■ 6.46
CPTP-202ENST00000464957 ARHGEF11O15085 1522 aa55.33■■■■■ 6.45
CPTP-202ENST00000464957 CHD1O14646 1710 aa55.26■■■■■ 6.44
CPTP-202ENST00000464957 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa55.24■■■■■ 6.43
CPTP-202ENST00000464957 FBLN2P98095 1184 aa55.22■■■■■ 6.43
CPTP-202ENST00000464957 SOGA1O94964 1423 aa55.21■■■■■ 6.43
CPTP-202ENST00000464957 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP55.11■■■■■ 6.41
CPTP-202ENST00000464957 FGD5Q6ZNL6 1462 aa55.08■■■■■ 6.41
CPTP-202ENST00000464957 CYB5RLQ6IPT4 315 aa54.99■■■■■ 6.39
CPTP-202ENST00000464957 CUX1P39880 1505 aa54.99■■■■■ 6.39
CPTP-202ENST00000464957 WDR97A6NE52 1622 aa54.95■■■■■ 6.39
CPTP-202ENST00000464957 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa54.9■■■■■ 6.38
CPTP-202ENST00000464957 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP54.78■■■■■ 6.36
CPTP-202ENST00000464957 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP54.77■■■■■ 6.36
CPTP-202ENST00000464957 ARAP1Q96P48 1450 aa54.77■■■■■ 6.36
CPTP-202ENST00000464957 GRIN2BQ13224 1484 aa54.73■■■■■ 6.35
CPTP-202ENST00000464957 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP54.73■■■■■ 6.35
CPTP-202ENST00000464957 SYNJ1O43426 1573 aa54.62■■■■■ 6.33
CPTP-202ENST00000464957 CLASP1Q7Z460 1538 aa54.59■■■■■ 6.33
CPTP-202ENST00000464957 SYNJ2O15056 1496 aa54.55■■■■■ 6.32
CPTP-202ENST00000464957 GAPVD1Q14C86 1478 aa54.54■■■■■ 6.32
CPTP-202ENST00000464957 PBRM1Q86U86 1689 aa54.51■■■■■ 6.32
CPTP-202ENST00000464957 TRHP20396 242 aaPredicted RBP54.48■■■■■ 6.31
CPTP-202ENST00000464957 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa54.43■■■■■ 6.3
CPTP-202ENST00000464957 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa54.34■■■■■ 6.29
CPTP-202ENST00000464957 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP54.23■■■■■ 6.27
CPTP-202ENST00000464957 TOP2BQ02880 1626 aa54.09■■■■■ 6.25
CPTP-202ENST00000464957 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa54.08■■■■■ 6.25
CPTP-202ENST00000464957 GRIN2AQ12879 1464 aa54.01■■■■■ 6.24
CPTP-202ENST00000464957 ADAMTS12P58397 1594 aa53.96■■■■■ 6.23
CPTP-202ENST00000464957 FHAD1B1AJZ9 1412 aa53.84■■■■■ 6.21
CPTP-202ENST00000464957 NUP160Q12769 1436 aa53.81■■■■■ 6.2
CPTP-202ENST00000464957 CEP170Q5SW79 1584 aa53.8■■■■■ 6.2
CPTP-202ENST00000464957 ERICH3Q5RHP9 1530 aa53.76■■■■■ 6.2
CPTP-202ENST00000464957 ERCC6L2Q5T890 1561 aa53.73■■■■■ 6.19
CPTP-202ENST00000464957 SHROOM2Q13796 1616 aa53.57■■■■■ 6.17
CPTP-202ENST00000464957 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP53.35■■■■■ 6.13
CPTP-202ENST00000464957 JPH4Q96JJ6 628 aa53.32■■■■■ 6.13
CPTP-202ENST00000464957 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa53.2■■■■■ 6.11
CPTP-202ENST00000464957 KIF27Q86VH2 1401 aa53.08■■■■■ 6.09
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