RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464931.1

USP19-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, humanhuman

TSL 3

Gene USP19, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19-209ENST00000464931 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.92■■■■■ 4.14
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USP19-209ENST00000464931 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.41■■■■□ 3.1
USP19-209ENST00000464931 NACADO15069 1562 aa34.34■■■■□ 3.09
USP19-209ENST00000464931 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.27■■■■□ 3.08
USP19-209ENST00000464931 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.1■■■■□ 3.05
USP19-209ENST00000464931 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
USP19-209ENST00000464931 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.89■■■■□ 3.02
USP19-209ENST00000464931 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.5■■■□□ 2.95
USP19-209ENST00000464931 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.37■■■□□ 2.93
USP19-209ENST00000464931 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.26■■■□□ 2.91
USP19-209ENST00000464931 SCRIBQ14160 1630 aa33.21■■■□□ 2.91
USP19-209ENST00000464931 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.06■■■□□ 2.88
USP19-209ENST00000464931 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.84■■■□□ 2.85
USP19-209ENST00000464931 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
USP19-209ENST00000464931 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.33■■■□□ 2.77
USP19-209ENST00000464931 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.17■■■□□ 2.74
USP19-209ENST00000464931 SMARCA4P51532 1647 aa31.77■■■□□ 2.68
USP19-209ENST00000464931 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
USP19-209ENST00000464931 NCAPD3P42695 1498 aa31.66■■■□□ 2.66
USP19-209ENST00000464931 SMARCA2P51531 1590 aa31.65■■■□□ 2.66
USP19-209ENST00000464931 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.64■■■□□ 2.66
USP19-209ENST00000464931 HMGXB3Q12766 1538 aa31.5■■■□□ 2.63
USP19-209ENST00000464931 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.48■■■□□ 2.63
USP19-209ENST00000464931 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.47■■■□□ 2.63
USP19-209ENST00000464931 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
USP19-209ENST00000464931 WIZO95785 1651 aa31.13■■■□□ 2.57
USP19-209ENST00000464931 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
USP19-209ENST00000464931 ERCC6Q03468 1493 aa30.91■■■□□ 2.54
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USP19-209ENST00000464931 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.87■■■□□ 2.53
USP19-209ENST00000464931 NESP48681 1621 aa30.86■■■□□ 2.53
USP19-209ENST00000464931 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.74■■■□□ 2.51
USP19-209ENST00000464931 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.71■■■□□ 2.51
USP19-209ENST00000464931 CUX2O14529 1486 aa30.63■■■□□ 2.49
USP19-209ENST00000464931 CFTRP13569 1480 aa30.51■■■□□ 2.48
USP19-209ENST00000464931 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.51■■■□□ 2.47
USP19-209ENST00000464931 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.47■■■□□ 2.47
USP19-209ENST00000464931 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
USP19-209ENST00000464931 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.38■■■□□ 2.45
USP19-209ENST00000464931 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.38■■■□□ 2.45
USP19-209ENST00000464931 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.35■■■□□ 2.45
USP19-209ENST00000464931 PRDM2Q13029 1718 aa30.27■■■□□ 2.44
USP19-209ENST00000464931 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
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USP19-209ENST00000464931 TOPBP1Q92547 1522 aa29.86■■■□□ 2.37
USP19-209ENST00000464931 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.84■■■□□ 2.37
USP19-209ENST00000464931 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.8■■■□□ 2.36
USP19-209ENST00000464931 IFT140Q96RY7 1462 aa29.76■■■□□ 2.35
USP19-209ENST00000464931 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
USP19-209ENST00000464931 CUX1P39880 1505 aa29.55■■■□□ 2.32
USP19-209ENST00000464931 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
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USP19-209ENST00000464931 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.51■■■□□ 2.31
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USP19-209ENST00000464931 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.37■■■□□ 2.29
USP19-209ENST00000464931 OSCARQ8IYS5 282 aa29.35■■■□□ 2.29
USP19-209ENST00000464931 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
USP19-209ENST00000464931 TOP2BQ02880 1626 aa29.31■■■□□ 2.28
USP19-209ENST00000464931 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.3■■■□□ 2.28
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USP19-209ENST00000464931 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.24■■■□□ 2.27
USP19-209ENST00000464931 GRIN2BQ13224 1484 aa29.19■■■□□ 2.26
USP19-209ENST00000464931 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.17■■■□□ 2.26
USP19-209ENST00000464931 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
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USP19-209ENST00000464931 FBLN2P98095 1184 aa29.12■■■□□ 2.25
USP19-209ENST00000464931 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.1■■■□□ 2.25
USP19-209ENST00000464931 CHD1O14646 1710 aa29.08■■■□□ 2.25
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USP19-209ENST00000464931 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.91■■■□□ 2.22
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USP19-209ENST00000464931 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.84■■■□□ 2.21
USP19-209ENST00000464931 KIF27Q86VH2 1401 aa28.82■■■□□ 2.2
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USP19-209ENST00000464931 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.8■■■□□ 2.2
USP19-209ENST00000464931 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.8■■■□□ 2.2
USP19-209ENST00000464931 ARHGEF11O15085 1522 aa28.8■■■□□ 2.2
USP19-209ENST00000464931 GRIN2AQ12879 1464 aa28.79■■■□□ 2.2
USP19-209ENST00000464931 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.79■■■□□ 2.2
USP19-209ENST00000464931 TRIM41Q8WV44 630 aa28.77■■■□□ 2.2
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USP19-209ENST00000464931 CEP170Q5SW79 1584 aa28.61■■■□□ 2.17
USP19-209ENST00000464931 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.57■■■□□ 2.16
USP19-209ENST00000464931 ARAP1Q96P48 1450 aa28.54■■■□□ 2.16
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USP19-209ENST00000464931 SHROOM2Q13796 1616 aa28.44■■■□□ 2.14
USP19-209ENST00000464931 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.41■■■□□ 2.14
USP19-209ENST00000464931 JPH4Q96JJ6 628 aa28.39■■■□□ 2.14
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