RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464570.1

MIB2-205, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 3

Gene MIB2, Length 968 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-205ENST00000464570 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.05■■■■■ 6.88
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MIB2-205ENST00000464570 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.72■■■■■ 4.75
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MIB2-205ENST00000464570 NESP48681 1621 aa44.45■■■■■ 4.71
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MIB2-205ENST00000464570 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.26■■■■■ 4.68
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MIB2-205ENST00000464570 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
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MIB2-205ENST00000464570 CFTRP13569 1480 aa43.45■■■■■ 4.55
MIB2-205ENST00000464570 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.43■■■■■ 4.54
MIB2-205ENST00000464570 PRDM2Q13029 1718 aa43.27■■■■■ 4.52
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MIB2-205ENST00000464570 IFT140Q96RY7 1462 aa42.58■■■■■ 4.41
MIB2-205ENST00000464570 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.56■■■■■ 4.4
MIB2-205ENST00000464570 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
MIB2-205ENST00000464570 OSCARQ8IYS5 282 aa42.38■■■■■ 4.37
MIB2-205ENST00000464570 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
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MIB2-205ENST00000464570 CUX1P39880 1505 aa42.01■■■■■ 4.32
MIB2-205ENST00000464570 CHD1O14646 1710 aa42■■■■■ 4.31
MIB2-205ENST00000464570 WDR97A6NE52 1622 aa41.91■■■■■ 4.3
MIB2-205ENST00000464570 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.89■■■■■ 4.3
MIB2-205ENST00000464570 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.89■■■■■ 4.3
MIB2-205ENST00000464570 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.89■■■■■ 4.3
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MIB2-205ENST00000464570 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.54■■■■■ 4.24
MIB2-205ENST00000464570 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
MIB2-205ENST00000464570 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.51■■■■■ 4.23
MIB2-205ENST00000464570 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.51■■■■■ 4.23
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MIB2-205ENST00000464570 TOP2BQ02880 1626 aa41.47■■■■■ 4.23
MIB2-205ENST00000464570 SYNJ2O15056 1496 aa41.47■■■■■ 4.23
MIB2-205ENST00000464570 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.44■■■■■ 4.23
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MIB2-205ENST00000464570 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.06■■■■■ 4.16
MIB2-205ENST00000464570 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.01■■■■■ 4.16
MIB2-205ENST00000464570 CEP170Q5SW79 1584 aa40.97■■■■■ 4.15
MIB2-205ENST00000464570 NUP160Q12769 1436 aa40.93■■■■■ 4.14
MIB2-205ENST00000464570 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
MIB2-205ENST00000464570 SHROOM2Q13796 1616 aa40.77■■■■■ 4.12
MIB2-205ENST00000464570 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.77■■■■■ 4.12
MIB2-205ENST00000464570 KIF27Q86VH2 1401 aa40.65■■■■■ 4.1
MIB2-205ENST00000464570 CUL7Q14999 1698 aa40.6■■■■■ 4.09
MIB2-205ENST00000464570 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.6■■■■■ 4.09
MIB2-205ENST00000464570 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
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