RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464543.1

CCZ1B-205, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 748 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-205ENST00000464543 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.56■■■■■ 8.25
CCZ1B-205ENST00000464543 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.44■■■■■ 7.11
CCZ1B-205ENST00000464543 ABCC9O60706 1549 aa58.68■■■■■ 6.98
CCZ1B-205ENST00000464543 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.19■■■■■ 6.59
CCZ1B-205ENST00000464543 NACADO15069 1562 aa55.99■■■■■ 6.55
CCZ1B-205ENST00000464543 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.77■■■■■ 6.52
CCZ1B-205ENST00000464543 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.47■■■■■ 6.47
CCZ1B-205ENST00000464543 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.35■■■■■ 6.45
CCZ1B-205ENST00000464543 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.04■■■■■ 6.4
CCZ1B-205ENST00000464543 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.99■■■■■ 6.39
CCZ1B-205ENST00000464543 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.72■■■■■ 6.35
CCZ1B-205ENST00000464543 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.57■■■■■ 6.33
CCZ1B-205ENST00000464543 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.38■■■■■ 6.3
CCZ1B-205ENST00000464543 SCRIBQ14160 1630 aa54.2■■■■■ 6.27
CCZ1B-205ENST00000464543 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.88■■■■■ 6.22
CCZ1B-205ENST00000464543 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.15■■■■■ 6.1
CCZ1B-205ENST00000464543 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.07■■■■■ 6.09
CCZ1B-205ENST00000464543 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.78■■■■■ 6.04
CCZ1B-205ENST00000464543 SMARCA4P51532 1647 aa51.79■■■■■ 5.88
CCZ1B-205ENST00000464543 NCAPD3P42695 1498 aa51.67■■■■■ 5.86
CCZ1B-205ENST00000464543 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.63■■■■■ 5.86
CCZ1B-205ENST00000464543 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.62■■■■■ 5.85
CCZ1B-205ENST00000464543 SMARCA2P51531 1590 aa51.53■■■■■ 5.84
CCZ1B-205ENST00000464543 HMGXB3Q12766 1538 aa51.38■■■■■ 5.82
CCZ1B-205ENST00000464543 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.31■■■■■ 5.8
CCZ1B-205ENST00000464543 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.28■■■■■ 5.8
CCZ1B-205ENST00000464543 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.16■■■■■ 5.78
CCZ1B-205ENST00000464543 WIZO95785 1651 aa50.74■■■■■ 5.71
CCZ1B-205ENST00000464543 NESP48681 1621 aa50.64■■■■■ 5.7
CCZ1B-205ENST00000464543 ERCC6Q03468 1493 aa50.59■■■■■ 5.69
CCZ1B-205ENST00000464543 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.5■■■■■ 5.67
CCZ1B-205ENST00000464543 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.41■■■■■ 5.66
CCZ1B-205ENST00000464543 CUX2O14529 1486 aa50.27■■■■■ 5.64
CCZ1B-205ENST00000464543 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.15■■■■■ 5.62
CCZ1B-205ENST00000464543 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.12■■■■■ 5.61
CCZ1B-205ENST00000464543 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.05■■■■■ 5.6
CCZ1B-205ENST00000464543 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.04■■■■■ 5.6
CCZ1B-205ENST00000464543 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.01■■■■■ 5.6
CCZ1B-205ENST00000464543 CFTRP13569 1480 aa49.72■■■■■ 5.55
CCZ1B-205ENST00000464543 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.61■■■■■ 5.53
CCZ1B-205ENST00000464543 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.57■■■■■ 5.53
CCZ1B-205ENST00000464543 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.56■■■■■ 5.52
CCZ1B-205ENST00000464543 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.55■■■■■ 5.52
CCZ1B-205ENST00000464543 WDR62O43379 1518 aa49.48■■■■■ 5.51
CCZ1B-205ENST00000464543 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.37■■■■■ 5.49
CCZ1B-205ENST00000464543 PRDM2Q13029 1718 aa49.35■■■■■ 5.49
CCZ1B-205ENST00000464543 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.14■■■■■ 5.46
CCZ1B-205ENST00000464543 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.75■■■■■ 5.39
CCZ1B-205ENST00000464543 TOPBP1Q92547 1522 aa48.73■■■■■ 5.39
CCZ1B-205ENST00000464543 ABCC8Q09428 1581 aa48.64■■■■■ 5.38
CCZ1B-205ENST00000464543 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.62■■■■■ 5.37
CCZ1B-205ENST00000464543 IFT140Q96RY7 1462 aa48.53■■■■■ 5.36
CCZ1B-205ENST00000464543 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.4■■■■■ 5.34
CCZ1B-205ENST00000464543 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.28■■■■■ 5.32
CCZ1B-205ENST00000464543 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.26■■■■■ 5.32
CCZ1B-205ENST00000464543 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.2■■■■■ 5.31
CCZ1B-205ENST00000464543 CUX1P39880 1505 aa48.17■■■■■ 5.3
CCZ1B-205ENST00000464543 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.08■■■■■ 5.29
CCZ1B-205ENST00000464543 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.08■■■■■ 5.29
CCZ1B-205ENST00000464543 OSCARQ8IYS5 282 aa48.04■■■■■ 5.28
CCZ1B-205ENST00000464543 SOGA1O94964 1423 aa48.04■■■■■ 5.28
CCZ1B-205ENST00000464543 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.04■■■■■ 5.28
CCZ1B-205ENST00000464543 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
CCZ1B-205ENST00000464543 WDR97A6NE52 1622 aa47.81■■■■■ 5.24
CCZ1B-205ENST00000464543 CHD1O14646 1710 aa47.7■■■■■ 5.23
CCZ1B-205ENST00000464543 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.62■■■■■ 5.21
CCZ1B-205ENST00000464543 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.61■■■■■ 5.21
CCZ1B-205ENST00000464543 TOP2BQ02880 1626 aa47.59■■■■■ 5.21
CCZ1B-205ENST00000464543 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.59■■■■■ 5.21
CCZ1B-205ENST00000464543 SYNJ1O43426 1573 aa47.58■■■■■ 5.21
CCZ1B-205ENST00000464543 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.57■■■■■ 5.21
CCZ1B-205ENST00000464543 GRIN2BQ13224 1484 aa47.55■■■■■ 5.2
CCZ1B-205ENST00000464543 FBLN2P98095 1184 aa47.51■■■■■ 5.2
CCZ1B-205ENST00000464543 TRIM41Q8WV44 630 aa47.5■■■■■ 5.19
CCZ1B-205ENST00000464543 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.49■■■■■ 5.19
CCZ1B-205ENST00000464543 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.48■■■■■ 5.19
CCZ1B-205ENST00000464543 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.47■■■■■ 5.19
CCZ1B-205ENST00000464543 PBRM1Q86U86 1689 aa47.47■■■■■ 5.19
CCZ1B-205ENST00000464543 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.42■■■■■ 5.18
CCZ1B-205ENST00000464543 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.42■■■■■ 5.18
CCZ1B-205ENST00000464543 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.42■■■■■ 5.18
CCZ1B-205ENST00000464543 ARHGEF11O15085 1522 aa47.34■■■■■ 5.17
CCZ1B-205ENST00000464543 SYNJ2O15056 1496 aa47.31■■■■■ 5.16
CCZ1B-205ENST00000464543 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.29■■■■■ 5.16
CCZ1B-205ENST00000464543 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.17■■■■■ 5.14
CCZ1B-205ENST00000464543 ADAMTS12P58397 1594 aa47.06■■■■■ 5.12
CCZ1B-205ENST00000464543 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47■■■■■ 5.11
CCZ1B-205ENST00000464543 GRIN2AQ12879 1464 aa46.96■■■■■ 5.11
CCZ1B-205ENST00000464543 ARAP1Q96P48 1450 aa46.94■■■■■ 5.1
CCZ1B-205ENST00000464543 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.9■■■■■ 5.1
CCZ1B-205ENST00000464543 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.88■■■■■ 5.1
CCZ1B-205ENST00000464543 NUP160Q12769 1436 aa46.78■■■■■ 5.08
CCZ1B-205ENST00000464543 CEP170Q5SW79 1584 aa46.77■■■■■ 5.08
CCZ1B-205ENST00000464543 KIF27Q86VH2 1401 aa46.65■■■■■ 5.06
CCZ1B-205ENST00000464543 IGF1RP08069 1367 aa46.54■■■■■ 5.04
CCZ1B-205ENST00000464543 SHROOM2Q13796 1616 aa46.5■■■■■ 5.04
CCZ1B-205ENST00000464543 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.49■■■■■ 5.03
CCZ1B-205ENST00000464543 CUL7Q14999 1698 aa46.47■■■■■ 5.03
CCZ1B-205ENST00000464543 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.38■■■■■ 5.01
CCZ1B-205ENST00000464543 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.24■■■■■ 4.99
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