RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464321.5

NSMCE4A-204, Transcript of NSE4 homolog A, SMC5-SMC6 complex component, humanhuman

TSL 5

Gene NSMCE4A, Length 822 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE4A-204ENST00000464321 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.52■■■■■ 7.12
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NSMCE4A-204ENST00000464321 ABCC9O60706 1549 aa52.68■■■■■ 6.02
NSMCE4A-204ENST00000464321 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.31■■■■■ 5.64
NSMCE4A-204ENST00000464321 NACADO15069 1562 aa50.09■■■■■ 5.61
NSMCE4A-204ENST00000464321 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.01■■■■■ 5.6
NSMCE4A-204ENST00000464321 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.52■■■■■ 5.52
NSMCE4A-204ENST00000464321 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.45■■■■■ 5.51
NSMCE4A-204ENST00000464321 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.34■■■■■ 5.49
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NSMCE4A-204ENST00000464321 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.13■■■■■ 5.45
NSMCE4A-204ENST00000464321 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.94■■■■■ 5.43
NSMCE4A-204ENST00000464321 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.92■■■■■ 5.42
NSMCE4A-204ENST00000464321 SCRIBQ14160 1630 aa48.58■■■■■ 5.37
NSMCE4A-204ENST00000464321 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.13■■■■■ 5.3
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NSMCE4A-204ENST00000464321 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.62■■■■■ 5.21
NSMCE4A-204ENST00000464321 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.34■■■■■ 5.17
NSMCE4A-204ENST00000464321 SMARCA4P51532 1647 aa46.35■■■■■ 5.01
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NSMCE4A-204ENST00000464321 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.21■■■■■ 4.99
NSMCE4A-204ENST00000464321 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.13■■■■■ 4.98
NSMCE4A-204ENST00000464321 SMARCA2P51531 1590 aa46.08■■■■■ 4.97
NSMCE4A-204ENST00000464321 HMGXB3Q12766 1538 aa45.96■■■■■ 4.95
NSMCE4A-204ENST00000464321 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.93■■■■■ 4.94
NSMCE4A-204ENST00000464321 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.84■■■■■ 4.93
NSMCE4A-204ENST00000464321 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.79■■■■■ 4.92
NSMCE4A-204ENST00000464321 NESP48681 1621 aa45.45■■■■■ 4.87
NSMCE4A-204ENST00000464321 WIZO95785 1651 aa45.44■■■■■ 4.87
NSMCE4A-204ENST00000464321 ERCC6Q03468 1493 aa45.38■■■■■ 4.86
NSMCE4A-204ENST00000464321 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.13■■■■■ 4.82
NSMCE4A-204ENST00000464321 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.11■■■■■ 4.81
NSMCE4A-204ENST00000464321 CUX2O14529 1486 aa45.06■■■■■ 4.8
NSMCE4A-204ENST00000464321 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.91■■■■■ 4.78
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NSMCE4A-204ENST00000464321 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.85■■■■■ 4.77
NSMCE4A-204ENST00000464321 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
NSMCE4A-204ENST00000464321 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.79■■■■■ 4.76
NSMCE4A-204ENST00000464321 CFTRP13569 1480 aa44.47■■■■■ 4.71
NSMCE4A-204ENST00000464321 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.43■■■■■ 4.7
NSMCE4A-204ENST00000464321 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.41■■■■■ 4.7
NSMCE4A-204ENST00000464321 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.39■■■■■ 4.7
NSMCE4A-204ENST00000464321 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.37■■■■■ 4.69
NSMCE4A-204ENST00000464321 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.33■■■■■ 4.69
NSMCE4A-204ENST00000464321 WDR62O43379 1518 aa44.32■■■■■ 4.69
NSMCE4A-204ENST00000464321 PRDM2Q13029 1718 aa44.17■■■■■ 4.66
NSMCE4A-204ENST00000464321 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
NSMCE4A-204ENST00000464321 TOPBP1Q92547 1522 aa43.63■■■■■ 4.57
NSMCE4A-204ENST00000464321 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
NSMCE4A-204ENST00000464321 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.5■■■■■ 4.55
NSMCE4A-204ENST00000464321 ABCC8Q09428 1581 aa43.45■■■■■ 4.55
NSMCE4A-204ENST00000464321 IFT140Q96RY7 1462 aa43.44■■■■■ 4.54
NSMCE4A-204ENST00000464321 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
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NSMCE4A-204ENST00000464321 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
NSMCE4A-204ENST00000464321 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
NSMCE4A-204ENST00000464321 CUX1P39880 1505 aa43.12■■■■■ 4.49
NSMCE4A-204ENST00000464321 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.09■■■■■ 4.49
NSMCE4A-204ENST00000464321 OSCARQ8IYS5 282 aa43.08■■■■■ 4.49
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NSMCE4A-204ENST00000464321 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.04■■■■■ 4.48
NSMCE4A-204ENST00000464321 SOGA1O94964 1423 aa42.99■■■■■ 4.47
NSMCE4A-204ENST00000464321 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.45
NSMCE4A-204ENST00000464321 CHD1O14646 1710 aa42.82■■■■■ 4.44
NSMCE4A-204ENST00000464321 TRIM41Q8WV44 630 aa42.78■■■■■ 4.44
NSMCE4A-204ENST00000464321 WDR97A6NE52 1622 aa42.75■■■■■ 4.43
NSMCE4A-204ENST00000464321 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.64■■■■■ 4.42
NSMCE4A-204ENST00000464321 FBLN2P98095 1184 aa42.64■■■■■ 4.42
NSMCE4A-204ENST00000464321 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.6■■■■■ 4.41
NSMCE4A-204ENST00000464321 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.6■■■■■ 4.41
NSMCE4A-204ENST00000464321 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.6■■■■■ 4.41
NSMCE4A-204ENST00000464321 SYNJ1O43426 1573 aa42.57■■■■■ 4.41
NSMCE4A-204ENST00000464321 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.57■■■■■ 4.4
NSMCE4A-204ENST00000464321 GRIN2BQ13224 1484 aa42.55■■■■■ 4.4
NSMCE4A-204ENST00000464321 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.54■■■■■ 4.4
NSMCE4A-204ENST00000464321 TOP2BQ02880 1626 aa42.54■■■■■ 4.4
NSMCE4A-204ENST00000464321 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.54■■■■■ 4.4
NSMCE4A-204ENST00000464321 PBRM1Q86U86 1689 aa42.53■■■■■ 4.4
NSMCE4A-204ENST00000464321 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.49■■■■■ 4.39
NSMCE4A-204ENST00000464321 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.49■■■■■ 4.39
NSMCE4A-204ENST00000464321 ARHGEF11O15085 1522 aa42.48■■■■■ 4.39
NSMCE4A-204ENST00000464321 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
NSMCE4A-204ENST00000464321 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
NSMCE4A-204ENST00000464321 SYNJ2O15056 1496 aa42.35■■■■■ 4.37
NSMCE4A-204ENST00000464321 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.26■■■■■ 4.36
NSMCE4A-204ENST00000464321 ARAP1Q96P48 1450 aa42.12■■■■■ 4.33
NSMCE4A-204ENST00000464321 ADAMTS12P58397 1594 aa42.12■■■■■ 4.33
NSMCE4A-204ENST00000464321 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.11■■■■■ 4.33
NSMCE4A-204ENST00000464321 GRIN2AQ12879 1464 aa42.03■■■■■ 4.32
NSMCE4A-204ENST00000464321 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42■■■■■ 4.31
NSMCE4A-204ENST00000464321 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.95■■■■■ 4.31
NSMCE4A-204ENST00000464321 CEP170Q5SW79 1584 aa41.92■■■■■ 4.3
NSMCE4A-204ENST00000464321 NUP160Q12769 1436 aa41.85■■■■■ 4.29
NSMCE4A-204ENST00000464321 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.74■■■■■ 4.27
NSMCE4A-204ENST00000464321 KIF27Q86VH2 1401 aa41.66■■■■■ 4.26
NSMCE4A-204ENST00000464321 SHROOM2Q13796 1616 aa41.65■■■■■ 4.26
NSMCE4A-204ENST00000464321 IGF1RP08069 1367 aa41.62■■■■■ 4.25
NSMCE4A-204ENST00000464321 CUL7Q14999 1698 aa41.53■■■■■ 4.24
NSMCE4A-204ENST00000464321 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.52■■■■■ 4.24
NSMCE4A-204ENST00000464321 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
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