RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462996.1

PTPN18-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN18, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18-208ENST00000462996 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.59■■■■■ 5.85
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PTPN18-208ENST00000462996 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.53■■■■■ 5.04
PTPN18-208ENST00000462996 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.04■■■■■ 4.8
PTPN18-208ENST00000462996 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.63■■■■■ 4.73
PTPN18-208ENST00000462996 NACADO15069 1562 aa44.17■■■■■ 4.66
PTPN18-208ENST00000462996 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.94■■■■■ 4.62
PTPN18-208ENST00000462996 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.86■■■■■ 4.61
PTPN18-208ENST00000462996 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.69■■■■■ 4.58
PTPN18-208ENST00000462996 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.43■■■■■ 4.54
PTPN18-208ENST00000462996 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.32■■■■■ 4.53
PTPN18-208ENST00000462996 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.66■■■■■ 4.42
PTPN18-208ENST00000462996 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.65■■■■■ 4.42
PTPN18-208ENST00000462996 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.62■■■■■ 4.41
PTPN18-208ENST00000462996 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
PTPN18-208ENST00000462996 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.54■■■■■ 4.4
PTPN18-208ENST00000462996 SCRIBQ14160 1630 aa42.4■■■■■ 4.38
PTPN18-208ENST00000462996 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
PTPN18-208ENST00000462996 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.79■■■■■ 4.28
PTPN18-208ENST00000462996 CUX2O14529 1486 aa40.96■■■■■ 4.15
PTPN18-208ENST00000462996 NCAPD3P42695 1498 aa40.82■■■■■ 4.12
PTPN18-208ENST00000462996 ERCC6Q03468 1493 aa40.8■■■■■ 4.12
PTPN18-208ENST00000462996 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.61■■■■■ 4.09
PTPN18-208ENST00000462996 NESP48681 1621 aa40.44■■■■■ 4.06
PTPN18-208ENST00000462996 HMGXB3Q12766 1538 aa40.42■■■■■ 4.06
PTPN18-208ENST00000462996 SMARCA2P51531 1590 aa40.4■■■■■ 4.06
PTPN18-208ENST00000462996 SMARCA4P51532 1647 aa40.38■■■■■ 4.05
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PTPN18-208ENST00000462996 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
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PTPN18-208ENST00000462996 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.97■■■■□ 3.99
PTPN18-208ENST00000462996 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.86■■■■□ 3.97
PTPN18-208ENST00000462996 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.77■■■■□ 3.96
PTPN18-208ENST00000462996 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.76■■■■□ 3.96
PTPN18-208ENST00000462996 TRIM41Q8WV44 630 aa39.67■■■■□ 3.94
PTPN18-208ENST00000462996 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.55■■■■□ 3.92
PTPN18-208ENST00000462996 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.48■■■■□ 3.91
PTPN18-208ENST00000462996 WDR62O43379 1518 aa39.4■■■■□ 3.9
PTPN18-208ENST00000462996 WIZO95785 1651 aa39.25■■■■□ 3.87
PTPN18-208ENST00000462996 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.17■■■■□ 3.86
PTPN18-208ENST00000462996 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.1■■■■□ 3.85
PTPN18-208ENST00000462996 OSCARQ8IYS5 282 aa39.03■■■■□ 3.84
PTPN18-208ENST00000462996 CFTRP13569 1480 aa38.95■■■■□ 3.83
PTPN18-208ENST00000462996 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.84■■■■□ 3.81
PTPN18-208ENST00000462996 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.7■■■■□ 3.79
PTPN18-208ENST00000462996 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
PTPN18-208ENST00000462996 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.59■■■■□ 3.77
PTPN18-208ENST00000462996 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.59■■■■□ 3.77
PTPN18-208ENST00000462996 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.59■■■■□ 3.77
PTPN18-208ENST00000462996 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
PTPN18-208ENST00000462996 PRDM2Q13029 1718 aa38.46■■■■□ 3.75
PTPN18-208ENST00000462996 IFT140Q96RY7 1462 aa38.41■■■■□ 3.74
PTPN18-208ENST00000462996 ARHGEF11O15085 1522 aa38.38■■■■□ 3.74
PTPN18-208ENST00000462996 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.28■■■■□ 3.72
PTPN18-208ENST00000462996 TOPBP1Q92547 1522 aa38.28■■■■□ 3.72
PTPN18-208ENST00000462996 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
PTPN18-208ENST00000462996 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.18■■■■□ 3.7
PTPN18-208ENST00000462996 ABCC8Q09428 1581 aa38.1■■■■□ 3.69
PTPN18-208ENST00000462996 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.06■■■■□ 3.68
PTPN18-208ENST00000462996 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.05■■■■□ 3.68
PTPN18-208ENST00000462996 CHD1O14646 1710 aa38.05■■■■□ 3.68
PTPN18-208ENST00000462996 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.67
PTPN18-208ENST00000462996 ARAP1Q96P48 1450 aa37.98■■■■□ 3.67
PTPN18-208ENST00000462996 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
PTPN18-208ENST00000462996 FBLN2P98095 1184 aa37.91■■■■□ 3.66
PTPN18-208ENST00000462996 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
PTPN18-208ENST00000462996 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.76■■■■□ 3.63
PTPN18-208ENST00000462996 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
PTPN18-208ENST00000462996 SOGA1O94964 1423 aa37.67■■■■□ 3.62
PTPN18-208ENST00000462996 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.6■■■■□ 3.61
PTPN18-208ENST00000462996 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.6■■■■□ 3.61
PTPN18-208ENST00000462996 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
PTPN18-208ENST00000462996 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.52■■■■□ 3.6
PTPN18-208ENST00000462996 WDR97A6NE52 1622 aa37.49■■■■□ 3.59
PTPN18-208ENST00000462996 SYNJ1O43426 1573 aa37.46■■■■□ 3.59
PTPN18-208ENST00000462996 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
PTPN18-208ENST00000462996 CUX1P39880 1505 aa37.4■■■■□ 3.58
PTPN18-208ENST00000462996 GRIN2BQ13224 1484 aa37.39■■■■□ 3.58
PTPN18-208ENST00000462996 SYNJ2O15056 1496 aa37.35■■■■□ 3.57
PTPN18-208ENST00000462996 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
PTPN18-208ENST00000462996 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.24■■■■□ 3.55
PTPN18-208ENST00000462996 PBRM1Q86U86 1689 aa37.2■■■■□ 3.55
PTPN18-208ENST00000462996 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.04■■■■□ 3.52
PTPN18-208ENST00000462996 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.04■■■■□ 3.52
PTPN18-208ENST00000462996 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.01■■■■□ 3.52
PTPN18-208ENST00000462996 GRIN2AQ12879 1464 aa36.92■■■■□ 3.5
PTPN18-208ENST00000462996 CEP170Q5SW79 1584 aa36.85■■■■□ 3.49
PTPN18-208ENST00000462996 NUP160Q12769 1436 aa36.84■■■■□ 3.49
PTPN18-208ENST00000462996 ADAMTS12P58397 1594 aa36.8■■■■□ 3.48
PTPN18-208ENST00000462996 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.75■■■■□ 3.47
PTPN18-208ENST00000462996 SHROOM2Q13796 1616 aa36.74■■■■□ 3.47
PTPN18-208ENST00000462996 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.68■■■■□ 3.46
PTPN18-208ENST00000462996 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.65■■■■□ 3.46
PTPN18-208ENST00000462996 TOP2BQ02880 1626 aa36.58■■■■□ 3.45
PTPN18-208ENST00000462996 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.58■■■■□ 3.45
PTPN18-208ENST00000462996 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.54■■■■□ 3.44
PTPN18-208ENST00000462996 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
PTPN18-208ENST00000462996 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
PTPN18-208ENST00000462996 JPH4Q96JJ6 628 aa36.49■■■■□ 3.43
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