RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.37■■■■■ 5.81
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.78■■■■■ 4.92
SIKE1-204ENST00000462123 ABCC9O60706 1549 aa45.24■■■■■ 4.83
SIKE1-204ENST00000462123 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.38■■■■■ 4.54
SIKE1-204ENST00000462123 NACADO15069 1562 aa43.29■■■■■ 4.52
SIKE1-204ENST00000462123 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.06■■■■■ 4.48
SIKE1-204ENST00000462123 MYO15BQ96JP2 1530 aa43■■■■■ 4.47
SIKE1-204ENST00000462123 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
SIKE1-204ENST00000462123 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.59■■■■■ 4.41
SIKE1-204ENST00000462123 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.24■■■■■ 4.35
SIKE1-204ENST00000462123 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.07■■■■■ 4.33
SIKE1-204ENST00000462123 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.03■■■■■ 4.32
SIKE1-204ENST00000462123 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.02■■■■■ 4.32
SIKE1-204ENST00000462123 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.79■■■■■ 4.28
SIKE1-204ENST00000462123 SCRIBQ14160 1630 aa41.62■■■■■ 4.25
SIKE1-204ENST00000462123 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
SIKE1-204ENST00000462123 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.88■■■■■ 4.13
SIKE1-204ENST00000462123 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.78■■■■■ 4.12
SIKE1-204ENST00000462123 NCAPD3P42695 1498 aa40.01■■■■■ 4
SIKE1-204ENST00000462123 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.88■■■■□ 3.98
SIKE1-204ENST00000462123 SMARCA4P51532 1647 aa39.86■■■■□ 3.97
SIKE1-204ENST00000462123 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
SIKE1-204ENST00000462123 SMARCA2P51531 1590 aa39.81■■■■□ 3.96
SIKE1-204ENST00000462123 HMGXB3Q12766 1538 aa39.68■■■■□ 3.94
SIKE1-204ENST00000462123 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.59■■■■□ 3.93
SIKE1-204ENST00000462123 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.5■■■■□ 3.91
SIKE1-204ENST00000462123 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
SIKE1-204ENST00000462123 ERCC6Q03468 1493 aa39.09■■■■□ 3.85
SIKE1-204ENST00000462123 NESP48681 1621 aa38.98■■■■□ 3.83
SIKE1-204ENST00000462123 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
SIKE1-204ENST00000462123 CUX2O14529 1486 aa38.94■■■■□ 3.82
SIKE1-204ENST00000462123 WIZO95785 1651 aa38.94■■■■□ 3.82
SIKE1-204ENST00000462123 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.92■■■■□ 3.82
SIKE1-204ENST00000462123 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.81■■■■□ 3.8
SIKE1-204ENST00000462123 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.79■■■■□ 3.8
SIKE1-204ENST00000462123 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
SIKE1-204ENST00000462123 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
SIKE1-204ENST00000462123 CFTRP13569 1480 aa38.46■■■■□ 3.75
SIKE1-204ENST00000462123 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.36■■■■□ 3.73
SIKE1-204ENST00000462123 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.36■■■■□ 3.73
SIKE1-204ENST00000462123 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.32■■■■□ 3.72
SIKE1-204ENST00000462123 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.27■■■■□ 3.72
SIKE1-204ENST00000462123 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.27■■■■□ 3.72
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.21■■■■□ 3.71
SIKE1-204ENST00000462123 WDR62O43379 1518 aa38.18■■■■□ 3.7
SIKE1-204ENST00000462123 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
SIKE1-204ENST00000462123 PRDM2Q13029 1718 aa37.79■■■■□ 3.64
SIKE1-204ENST00000462123 ABCC8Q09428 1581 aa37.7■■■■□ 3.63
SIKE1-204ENST00000462123 TOPBP1Q92547 1522 aa37.58■■■■□ 3.61
SIKE1-204ENST00000462123 IFT140Q96RY7 1462 aa37.54■■■■□ 3.6
SIKE1-204ENST00000462123 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
SIKE1-204ENST00000462123 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.48■■■■□ 3.59
SIKE1-204ENST00000462123 OSCARQ8IYS5 282 aa37.3■■■■□ 3.56
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
SIKE1-204ENST00000462123 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
SIKE1-204ENST00000462123 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
SIKE1-204ENST00000462123 SOGA1O94964 1423 aa37.14■■■■□ 3.54
SIKE1-204ENST00000462123 CUX1P39880 1505 aa37.08■■■■□ 3.53
SIKE1-204ENST00000462123 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.07■■■■□ 3.528e-7■■■□□ 16
SIKE1-204ENST00000462123 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
SIKE1-204ENST00000462123 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.05■■■■□ 3.52
SIKE1-204ENST00000462123 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.04■■■■□ 3.52
SIKE1-204ENST00000462123 WDR97A6NE52 1622 aa36.96■■■■□ 3.51
SIKE1-204ENST00000462123 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
SIKE1-204ENST00000462123 GRIN2BQ13224 1484 aa36.76■■■■□ 3.48
SIKE1-204ENST00000462123 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.76■■■■□ 3.47
SIKE1-204ENST00000462123 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.75■■■■□ 3.47
SIKE1-204ENST00000462123 FBLN2P98095 1184 aa36.72■■■■□ 3.47
SIKE1-204ENST00000462123 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
SIKE1-204ENST00000462123 TRIM41Q8WV44 630 aa36.7■■■■□ 3.47
SIKE1-204ENST00000462123 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.69■■■■□ 3.46
SIKE1-204ENST00000462123 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.67■■■■□ 3.46
SIKE1-204ENST00000462123 TOP2BQ02880 1626 aa36.65■■■■□ 3.46
SIKE1-204ENST00000462123 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
SIKE1-204ENST00000462123 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.59■■■■□ 3.45
SIKE1-204ENST00000462123 SYNJ2O15056 1496 aa36.57■■■■□ 3.45
SIKE1-204ENST00000462123 CHD1O14646 1710 aa36.56■■■■□ 3.44
SIKE1-204ENST00000462123 ARHGEF11O15085 1522 aa36.54■■■■□ 3.44
SIKE1-204ENST00000462123 SYNJ1O43426 1573 aa36.53■■■■□ 3.44
SIKE1-204ENST00000462123 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.52■■■■□ 3.44
SIKE1-204ENST00000462123 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.5■■■■□ 3.43
SIKE1-204ENST00000462123 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.5■■■■□ 3.43
SIKE1-204ENST00000462123 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.5■■■■□ 3.43
SIKE1-204ENST00000462123 PBRM1Q86U86 1689 aa36.38■■■■□ 3.41
SIKE1-204ENST00000462123 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.37■■■■□ 3.41
SIKE1-204ENST00000462123 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.3■■■■□ 3.4
SIKE1-204ENST00000462123 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.29■■■■□ 3.4
SIKE1-204ENST00000462123 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.29■■■■□ 3.4
SIKE1-204ENST00000462123 GRIN2AQ12879 1464 aa36.24■■■■□ 3.39
SIKE1-204ENST00000462123 ARAP1Q96P48 1450 aa36.21■■■■□ 3.39
SIKE1-204ENST00000462123 ADAMTS12P58397 1594 aa36.2■■■■□ 3.39
SIKE1-204ENST00000462123 NUP160Q12769 1436 aa36.17■■■■□ 3.38
SIKE1-204ENST00000462123 KIF27Q86VH2 1401 aa36.08■■■■□ 3.37
SIKE1-204ENST00000462123 IGF1RP08069 1367 aa36.01■■■■□ 3.35
SIKE1-204ENST00000462123 CEP170Q5SW79 1584 aa35.98■■■■□ 3.35
SIKE1-204ENST00000462123 JPH4Q96JJ6 628 aa35.83■■■■□ 3.33
SIKE1-204ENST00000462123 SHROOM2Q13796 1616 aa35.83■■■■□ 3.33
SIKE1-204ENST00000462123 CUL7Q14999 1698 aa35.78■■■■□ 3.32
SIKE1-204ENST00000462123 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.76■■■■□ 3.31
SIKE1-204ENST00000462123 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
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