RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461944.1

NGEF-208, Transcript of neuronal guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 4

Gene NGEF, Length 568 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGEF-208ENST00000461944 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.17■■■■■ 4.5
NGEF-208ENST00000461944 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.16■■■■□ 3.7
NGEF-208ENST00000461944 ABCC9O60706 1549 aa36.46■■■■□ 3.43
NGEF-208ENST00000461944 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
NGEF-208ENST00000461944 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.74■■■■□ 3.31
NGEF-208ENST00000461944 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.69■■■■□ 3.3
NGEF-208ENST00000461944 NACADO15069 1562 aa35.57■■■■□ 3.28
NGEF-208ENST00000461944 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.55■■■■□ 3.28
NGEF-208ENST00000461944 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.47■■■■□ 3.27
NGEF-208ENST00000461944 SCRIBQ14160 1630 aa34.92■■■■□ 3.18
NGEF-208ENST00000461944 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.77■■■■□ 3.16
NGEF-208ENST00000461944 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.67■■■■□ 3.14
NGEF-208ENST00000461944 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.31■■■■□ 3.08
NGEF-208ENST00000461944 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.1■■■■□ 3.05
NGEF-208ENST00000461944 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.87■■■■□ 3.01
NGEF-208ENST00000461944 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.5■■■□□ 2.95
NGEF-208ENST00000461944 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
NGEF-208ENST00000461944 SMARCA4P51532 1647 aa33.42■■■□□ 2.94
NGEF-208ENST00000461944 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
NGEF-208ENST00000461944 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.3■■■□□ 2.92
NGEF-208ENST00000461944 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
NGEF-208ENST00000461944 WIZO95785 1651 aa33.06■■■□□ 2.88
NGEF-208ENST00000461944 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.05■■■□□ 2.88
NGEF-208ENST00000461944 PEG3Q9GZU2 1588 aa33■■■□□ 2.87
NGEF-208ENST00000461944 SMARCA2P51531 1590 aa32.99■■■□□ 2.87
NGEF-208ENST00000461944 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
NGEF-208ENST00000461944 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.91■■■□□ 2.86
NGEF-208ENST00000461944 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
NGEF-208ENST00000461944 HMGXB3Q12766 1538 aa32.77■■■□□ 2.84
NGEF-208ENST00000461944 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
NGEF-208ENST00000461944 NCAPD3P42695 1498 aa32.71■■■□□ 2.83
NGEF-208ENST00000461944 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.26■■■□□ 2.75
NGEF-208ENST00000461944 PRDM2Q13029 1718 aa31.92■■■□□ 2.7
NGEF-208ENST00000461944 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.86■■■□□ 2.69
NGEF-208ENST00000461944 CFTRP13569 1480 aa31.83■■■□□ 2.69
NGEF-208ENST00000461944 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.81■■■□□ 2.68
NGEF-208ENST00000461944 NESP48681 1621 aa31.77■■■□□ 2.68
NGEF-208ENST00000461944 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.57■■■□□ 2.64
NGEF-208ENST00000461944 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.54■■■□□ 2.64
NGEF-208ENST00000461944 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.54■■■□□ 2.64
NGEF-208ENST00000461944 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.47■■■□□ 2.63
NGEF-208ENST00000461944 ABCC8Q09428 1581 aa31.45■■■□□ 2.63
NGEF-208ENST00000461944 ERCC6Q03468 1493 aa31.41■■■□□ 2.62
NGEF-208ENST00000461944 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.3■■■□□ 2.6
NGEF-208ENST00000461944 SYNJ1O43426 1573 aa31.26■■■□□ 2.6
NGEF-208ENST00000461944 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.24■■■□□ 2.59
NGEF-208ENST00000461944 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.23■■■□□ 2.59
NGEF-208ENST00000461944 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.23■■■□□ 2.59
NGEF-208ENST00000461944 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.22■■■□□ 2.59
NGEF-208ENST00000461944 CUX1P39880 1505 aa31.21■■■□□ 2.59
NGEF-208ENST00000461944 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
NGEF-208ENST00000461944 TOP2BQ02880 1626 aa31.2■■■□□ 2.59
NGEF-208ENST00000461944 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
NGEF-208ENST00000461944 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.16■■■□□ 2.58
NGEF-208ENST00000461944 TOPBP1Q92547 1522 aa31.13■■■□□ 2.57
NGEF-208ENST00000461944 WDR62O43379 1518 aa31.12■■■□□ 2.57
NGEF-208ENST00000461944 TRIM41Q8WV44 630 aa31.07■■■□□ 2.56
NGEF-208ENST00000461944 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31■■■□□ 2.55
NGEF-208ENST00000461944 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
NGEF-208ENST00000461944 CUX2O14529 1486 aa30.91■■■□□ 2.54
NGEF-208ENST00000461944 WDR97A6NE52 1622 aa30.8■■■□□ 2.52
NGEF-208ENST00000461944 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
NGEF-208ENST00000461944 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.76■■■□□ 2.51
NGEF-208ENST00000461944 SOGA1O94964 1423 aa30.74■■■□□ 2.51
NGEF-208ENST00000461944 IFT140Q96RY7 1462 aa30.72■■■□□ 2.51
NGEF-208ENST00000461944 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.68■■■□□ 2.5
NGEF-208ENST00000461944 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.59■■■□□ 2.49
NGEF-208ENST00000461944 KIF27Q86VH2 1401 aa30.57■■■□□ 2.48
NGEF-208ENST00000461944 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
NGEF-208ENST00000461944 EEA1Q15075 1411 aa30.54■■■□□ 2.48
NGEF-208ENST00000461944 PBRM1Q86U86 1689 aa30.53■■■□□ 2.48
NGEF-208ENST00000461944 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.52■■■□□ 2.48
NGEF-208ENST00000461944 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
NGEF-208ENST00000461944 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.46■■■□□ 2.47
NGEF-208ENST00000461944 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
NGEF-208ENST00000461944 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
NGEF-208ENST00000461944 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.41■■■□□ 2.461e-8■■□□□ 13.5
NGEF-208ENST00000461944 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.37■■■□□ 2.45
NGEF-208ENST00000461944 CUL7Q14999 1698 aa30.36■■■□□ 2.45
NGEF-208ENST00000461944 GRIN2BQ13224 1484 aa30.34■■■□□ 2.45
NGEF-208ENST00000461944 ADAMTS12P58397 1594 aa30.27■■■□□ 2.44
NGEF-208ENST00000461944 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.26■■■□□ 2.43
NGEF-208ENST00000461944 KIF21BO75037 1637 aa30.25■■■□□ 2.43
NGEF-208ENST00000461944 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.25■■■□□ 2.43
NGEF-208ENST00000461944 IGF1RP08069 1367 aa30.22■■■□□ 2.43
NGEF-208ENST00000461944 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
NGEF-208ENST00000461944 PRXQ9BXM0 1461 aa30.15■■■□□ 2.42
NGEF-208ENST00000461944 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.13■■■□□ 2.41
NGEF-208ENST00000461944 GOLGA3Q08378 1498 aa30.12■■■□□ 2.41
NGEF-208ENST00000461944 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.11■■■□□ 2.41
NGEF-208ENST00000461944 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.1■■■□□ 2.41
NGEF-208ENST00000461944 SYNJ2O15056 1496 aa30.06■■■□□ 2.4
NGEF-208ENST00000461944 CHD1O14646 1710 aa30.05■■■□□ 2.4
NGEF-208ENST00000461944 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.05■■■□□ 2.4
NGEF-208ENST00000461944 GRIN2AQ12879 1464 aa29.98■■■□□ 2.39
NGEF-208ENST00000461944 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.98■■■□□ 2.39
NGEF-208ENST00000461944 FBLN2P98095 1184 aa29.9■■■□□ 2.38
NGEF-208ENST00000461944 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
NGEF-208ENST00000461944 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.88■■■□□ 2.37
NGEF-208ENST00000461944 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
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